Aedes albopictus (mosquito tigre asiático) Distribución potencial con GARP y MAXENT (Moo-Llanes et al. 2018)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Moo-Llanes, D. A., J. G. Bond-Compeán, M. Casas-Martínez, C. F. Marina-Fernández, R. Danis-Lozano, A. Ulloa-García, (11/08/2018)

Palabras clave: 2018, Aedes albopictus, GARP, LI040, MaxEnt, Modelación, Mosquito, Nicho Ecologico, Vector

Fecha de publicación: 11-08-2018, del metadato 24-10-2018

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Moo-Llanes, D. A., J. G. Bond-Compeán, M. Casas-Martínez, C. F. Marina-Fernández, R. Danis-Lozano, A. Ulloa-García, (11/08/2018). 'Aedes albopictus (mosquito tigre asiático). Distribución potencial con GARP y MAXENT', escala: 1:1000000. edición: 1.0. Instituto Nacional de Salud Publica. Proyecto: LI040, Diagnóstico del estado actual de la invasión biológica por Aedes (Stegomyia) albopictus (Skuse) (Diptera: Culicidae) en las principales áreas naturales protegidas de la Península de Yucatán, México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Tapachula, Chiapas, México.
      Fecha de publicación:
      11-08-2018
      Nombre del producto:
      Aedes albopictus (mosquito tigre asiático) Distribución potencial con GARP y MAXENT (Moo-Llanes et al. 2018)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/aal040dpgmgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      Se construyó un modelo de nicho ecológico para el mosquito Ae. albopictus en el área correspondiente a la Península de Yucatán, Tabasco y Chiapas utilizando los algoritmos GARP y MaxEnt. Se utilizaron principalmente variables obtenidas en WorldClim e Hydro 1K a una resolución aproximadamente de 1km.
      Propósito:
      El dato geoespacial tiene como objetivo demostrar el nicho ecológico combinado del mosquito Ae. albopictus en la Península de Yucatán, Tabasco y Chiapas utilizando un algoritmo de presencia-entorno (MaxEnt) y un algoritmo de presencia-pseudoausencia (GARP).
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=LI&Numero=40
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      18 meses
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extensión geográfica:
      Península de Yucatán, Tabasco, Chiapas y República Mexicana
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -94.1409606933594, (Este) -86.7493133544922, (Norte) 21.6038818359375, (Sur) 14.5622415542603
    6. Palabras clave
      Tema:
      2018, Aedes albopictus, GARP, LI040, MaxEnt, Modelación, Mosquito, Nicho Ecologico, Vector
      Lugar:
      Campeche, Chiapas, Quintana Roo, Tabasco, Yucatán, República Mexicana
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Insecta, Diptera, Culicidae, Aedes, Aedes albopictus, mosquito tigre asiático, asian tiger mosquito
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Walter Reed Biosystematics Unit'

        20180305. Thomas V. Gaffigan, Richard C. Wilkerson, James E. Pecor, Judith A. Stoffer, Thomas Anderson, (2018/03/05), 'Walter Reed Biosystematics Unit', Walter Reed Army Institute of Research, Systematic Catalog of Culicidae, Mayland, USA.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Animalia: Arthropoda: Insecta: Diptera: Culicidae: Aedes: (, )

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/aal040dpgmgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/aal040dpgmgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      SIG ArcMap 10.0; Genetic Algorithm for Rule-Set Prediction (GARP). Lenovo Win7 PC 4.00GM RAM, Windows 10 64bits
    16. Documentos relacionados
  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Se construyó una base de datos con información de literatura científica (Torres-Avendaño et al. 2015; Ortega-Morales et al. 2015; Baak-Baak et al. 2016; Ortega-Morales & Siller-Rodríguez 2016; Ortega-Morales et al. 2016; Pech-May et al. 2016; Baak-Baak et al. 2017), portal de dominio público: Global Biodiversity Information Facility (GBIF; www.gbif.org/) y colectas realizadas durante este proyecto (cuatro etapas). Se obtuvieron todos los registros pertenecientes a Ae. albopictus. Estas ocurrencias pertenecen solamente a los estados de Yucatán, Campeche, Quintana Roo, Tabasco y Chiapas. Se construyeron modelos de nicho ecológico utilizando dos algoritmos: MaxEnt y GARP, que posteriormente fueron fusionados para crear el modelo de nicho combinado.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Moo-Llanes, D. A., J. G. Bond-Compeán, M. Casas-Martínez, C. F. Marina-Fernández, R. Danis-Lozano, A. Ulloa-García, (2018/08/11), 'Modelo de distribución potencial de Aedes albopictus utilizando el algoritmo de GARP', Escala 1:1000000. versión: 1.0, INSTITUTO NACIONAL DE SALUD PUBLICA, Tapachula, Chiapas, México.

      • Moo-Llanes, D. A., J. G. Bond-Compeán, M. Casas-Martínez, C. F. Marina-Fernández, R. Danis-Lozano, A. Ulloa-García, (2018/08/11), 'Modelo de distribución potencial de Aedes albopictus utilizando el algoritmo de MaxEnt', Escala 1:1000000. versión: 1.0, INSTITUTO NACIONAL DE SALUD PUBLICA, Tapachula, Chiapas, México.

      Procedimientos:

      • No aplica: Para la construcción del MNE (Modelos de Nicho Ecológico) del mosquito Ae. albopictus, se utilizaron 13 variables: nueve variables bioclimáticas (Bio1, Bio4, Bio5, Bio6, Bio7, Bio12, Bio13, Bio14 y Bio15) obtenidas de WorldClim-Global Climate Data (Hijmans et al. 2005). Estas variables fueron seleccionadas de un conjunto de 19 variables, que presentaron una menor inter-correlación (r <0.75) después de realizar un análisis de multicolinealidad (Moo-Llanes et al. 2013). Adicionalmente, cuatro variables topográficas (aspecto, pendiente, elevación e índice topográfico) obtenidas de Hydro 1K (Earth Resources Observations and Science). Todas las variables fueron obtenidas a una resolución de 30 arc segundos (aprox 1 km), . Se utilizaron dos algoritmos: GARP (Genetic Algorithm for Rule-set Prediction) y MaxEnt (Maximum Entropy). GARP with Best-subsets DesktopGARP implementation fue utilizado en OpenModeller 1.1.0 (de Souza et al. 2011). Los parámetros del software fueron: corridas (100), tipo de reglas utilizadas (todas), límite de convergencia (0.01) y máximo número de iteracciones (1000). El algoritmo MaxEnt 3.3.3k. (Phillips et al. 2006), estima la probabilidad de distribución promedio de encontrar la presencia de probabilidad de máxima entropía sujeta a una serie de restricciones impuestas por la información disponible sobre la distribución observada de las especies y las condiciones ambientales en el área de estudio. Los parámetros del software fueron: features (linear, product, threshold y hinge), regularización múltiple (2), máximo número de iteraciones (500), máximo número de background (10 000), bootstrap (10 réplicas), datos de salida (Logistic), selección de localidades únicas y selección de clamping (Moo-Llanes 2016). Ambos algoritmos dividen los puntos de ocurrencia en dos: datos de entrenamiento para la construcción del modelo (75 %) y datos de evaluación (25 %) (Anderson et al., 2003). Posteriormente, se realizó la sumatoria de los 10 modelos, para obtener un mapa booleano (ausencia/presencia) en base a los umbrales del 95 % de los puntos de ocurrencia (Peterson et al. 2012; Moo-Llanes 2016). Finalmente, se sumaron los modelos booleanos de cada algoritmo (GARP + MaxEnt) por especie y se reclasificaron de la siguiente manera: a) 0 y 1= 0, mientras que 2=1.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      1502
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: AAL040DPGMGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      VALUE Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Jose Manuel Davila Rosas

      jdavila@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      aal040dpgmgw
    3. Responsabilidad
      La Subdirección de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      SIG ArcMap 100; sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      24-10-2018
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Estrella Cruz Reyes

      ecruz@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 4963 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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