Bursera glabrifolia (copal) Distribución potencial (Espinosa et al., 2018)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Espinosa, D., C. A. Hernández-Quintero, F. Juárez-Barrera, G. Montaño-Arias, I. H. Salgado-Ugarte, M. Santiago-Alvarado, (2018)

Palabras clave: 2018, Biogeografía, Bursera, Bursera glabrifolia, Burseraceae, Distribución potencial, JM041, Modelo de nicho

Fecha de publicación: 03-05-2018, del metadato 03-05-2018

Descargas: Google Earth (KML), ESRI Shapefile (SHP), Metadatos

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Espinosa, D., C. A. Hernández-Quintero, F. Juárez-Barrera, G. Montaño-Arias, I. H. Salgado-Ugarte, M. Santiago-Alvarado, (2018). 'Bursera glabrifolia (copal). Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JM041, Modelación de la distribución potencial del género Bursera (Burseraceae) en México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). México, D.F.
      Fecha de publicación:
      03-05-2018
      Nombre del producto:
      Bursera glabrifolia (copal) Distribución potencial (Espinosa et al., 2018)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/bgl041dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      Bursera glabrifolia es un árbol de hasta 6 m, que habita la cuenca del Balsas y la cuenca alta de los del río Papaloapan o Valle de Tehuacán-Cuicatlán; ocurre principalmente en los bosques tropicales cuducifolia y su transición con los encinares; también presentes en los palmares de Brahea. Se modeló su distribución potencial utilizando MaxEnt, a partir de registros de colecta resultantes de un detallado control de calidad, y a partir de variables climáticas de Worldclim.
      Propósito:
      Determinar y analizar la distribución potencial de Bursera glabrifolia, con el fin de generar información sobre su estado de conservación.
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=41
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1935-2004
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extensión geográfica:
      República Mexicana
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -105.693382263184, (Este) -93.2022018432617, (Norte) 20.4555892944336, (Sur) 15.655779838562
    6. Palabras clave
      Tema:
      2018, Biogeografía, Bursera, Bursera glabrifolia, Burseraceae, Distribución potencial, JM041, Modelo de nicho
      Lugar:
      Colima, Chiapas, Distrito Federal, Guerrero, Jalisco, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Oaxaca, Puebla, República Mexicana, Tabasco, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Vertiente del Pacífico Sur
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Equisetopsida, Sapindales, Burseraceae, Bursera, Bursera glabrifolia, copal, copal blanco, copal hembra, copalillo, linaloe, linanoé, copal liso, cuachalate, linaloé, ndeokaats, ndiocats, xolicopal, zomplante, cuajiote colorado
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'An outline of a classification scheme for extant flowering plants'

        20120000. Reveal, J.L., (2012), 'An outline of a classification scheme for extant flowering plants', Phytoneuron 2012-37: 1-221. Nomenclatura aplicada a la filogenia de las plantas con flores generada por el grupo de investigación para la filogenia de las angiospermas (APG) en su tercera versión,

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Plantae: Tracheophyta: Equisetopsida: Sapindales: Burseraceae: Bursera: (, , , , , , , , , , , , , )

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/bgl041dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/bgl041dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3k, ArcMap 10.1, Dell Precision T7600, Intel® Core i7, 3.4GHz, RAM 16.0, Windows 7 Pro Service Pack 1, 64 bits
    16. Documentos relacionados

      Bursera glabrifolia (copal) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Espinosa et al., 2018)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

      Bursera glabrifolia (copal) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Espinosa et al., 2018)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Página de enciclovida para Bursera glabrifolia a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 19028ANGIO en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Se obtuvieron registros provenientes de distintas fuentes de información. Se validó la nomenclatura taxonómica de los registros. Se realizó una validación geográfica de los registros. Se modeló con MaxEnt. Primero se generó un modelo de prueba y posteriormente se generó un modelo definitivo utilizando las capas climáticas que más contribuyeron al modelo de prueba. Se utilizó un subconjunto de registros no autocorrelacionados entre si y que además tuvieran el menor sesgo geográfico posible. Se utilizaron las 19 variables climáticas de WorldClim (Hijmans et al. 2005). Se definió una región de modelado M de acuerdo con la carta de cuencas y regiones hidrográficas de la Comisión Nacional del Agua (CNA, 1998). Se le asignó una prioridad de conservación con base en su frecuencia en el conjunto de registros y en el tamaño relativo de su área.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, University of California, Berkeley. U.S.A. Variables climáticas para todo el mundo (interpolaciones de datos observados, representativos de los años 1950 a 2000), de alta resolución (30 arc-seconds (aprox 1 km)), http://www.worldclim.org/

      • CNA, (1998), 'Cuencas Hidrológicas (CNA)', Escala 1:250000. Comisión Nacional del Agua, México, D.F.http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/hidro/chidro/cue250kgw.

      • Espinosa, D., C. A. Hernández-Quintero, F. Juárez-Barrera, G. Montaño-Arias, I. H. Salgado-Ugarte, M. Santiago-Alvarado, (2018/02/01), 'Modelación de la distribución potencial del género Bursera (Burseraceae) en México', Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, Universidad Nacional Autónoma de México, México, D.F. Bases de datos SNIB-CONABIO proyecto No. JM041,

      Procedimientos:

      • No aplica: Se obtuvieron 404 registros provenientes del Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad (SNIB). La nomenclatura taxonómica se validó tomando como referencia diccionarios de autoría taxonómica. Se compararon las descripciones de localidad para establecer un enunciado único de descripción estandarizado para dos o más localidades con variantes sintácticas u ortográficas. El número de registros se redujo mediante una búsqueda de combinaciones única. La información geográfica se validó por revisión contra estándares geoestadísticos del Inegi y de GoogleEarth. Se eliminaron datos atípicos, homotípicos y autocorrelacionados. La información taxonómica fue validada siguiendo el estándar de las páginas web The Plant List (www.theplantlist.org) y Tropicos (www.tropicos.org). Los nombres de los autores de cada especie se homogeneizaron de acuerdo con Brummit (1994). La sinonimia taxonómica se adoptó del criterio propuesto en Rzedowski et al. (2005) y sus actualizaciones posteriores (Rzedowski et al. 2007, 2009). Las localidades fueron verificadas por comparación con el nomenclátor de localidades de México (INEGI) y mediante el seguimiento de rutas en Google Earth versión 7.1.2.2041 (Google Inc., 2013). Se reconocieron variantes ortográficas y sintácticas y se redujeron en lo posible a un solo enunciado. Mediante el programa IBM SPSS Statistics 20, se detectaron valores homónimos (u homotípicos, aquellos con valores idénticos en las 19 variables climáticas) y atípicos (son los valores que se salen del intervalo que recorre desde el valor de la mediana, más-menos 1.5 veces el valor de la mediana sobre 2). Se redujo en lo posible el sesgo por acumulación de registros mediante las herramientas de modelado de distribución de especies (SDM) de la interface entre ArcMap y MaxEnt (ArcToolbox/ SDM Tools/ 1 Universal Tools/ Spatially Rarefy Occurence Data for SDMs/ Spatially Rarefy Occurence Data for SDMs [to reduce spatial autocorrelation]). La estimación de la autocorrelación se evaluó a intervalos de cada kilómetro. A partir de ello, se extrajo una sub-muestra aleatoria para la construcción de un primer modelo de prueba. La base original contenía 404 registros de los estados de Aguascalientes, Colima, Estado de México, Guerrero, Jalisco, Michoacán, Morelos, Oaxaca, Puebla y Sonora (?). Después del proceso de validación taxonómica y geográfica, se extrajeron los 187 registros validados y no redundantes ni autocorrelacionados para generar el modelo. Se utilizaron las 19 variables climáticas de WorldClim (Hijmans et al. 2005). Se definió una región de modelado M de acuerdo con la carta de cuencas y regiones hidrológicas de la Comisión Nacional del Agua (CNA, 1998). Las 19 capas de información climática obtenidas de worldclim se recortaron con base en una región. Las cuencas seleccionadas fueron Río Colotepec y otros, Río Copalita y otros, Río Coyuquilla y otros, Río Cutzamala, Río Grande de Amacuzac, Río Ixtapa y otros, Río Jamapa y otros, Río Nexpa y otros, Río Nexpe y otros, Río Omotepec o Grande, Río Papagayo, Río Papaloapan, Río San Nicolás-Cuitzamala, Río Tacambaro, Río Tehuantepec, Río Tepalcatepec, Río Tepalcatepec-Infiernillo, Río Tlapaneco, Río Tomatlán-Tecuán, Río Tonalá y Lagunas del Carmen y Machona. La modelación se realizó con MaxEnt (MaxEnt versión 3.3 Phillips et al. 2004). El modelo de nicho se ejecutó con la opción Jacknife. El modelo fue ejecutado con los parámetros básicos establecidos por defecto, con excepción del número máximo de puntos de respaldo (Max number of background points = 1000) y el número de réplicas (replicates=100), implementando un muestreo de validación cruzada (crossvalidate). En los parámetros avanzados se seleccionaron todas las opciones de salida y se adoptaron todos los parámetros por defecto. Los parámetros experimentales se adoptaron por defecto, con excepción de la escritura de las predicciones de respaldo (Write background predictions). El formato de salida de los datos fue logístico y el archivo de tipo ASC. El modelo de prueba indicó que las variables que más contribuyen a la construcción del modelo, sin correlación significativa entre ellos, son precipitación del cuatrimestre caliente (pcc), precipitación del cuatrimestre frío (pcf), precipitación del cuatrimestre lluvioso (pcll), precipitación del periodo de lluvias (ppll), temperatura promedio anual (tpa), temperatura del cuatrimestre caliente (tcc), temperatura promedio del cuatrimestre frío (tpcf), temperatura promedio del cuatrimestre lluvioso (tpcll), temperatura promedio del cuatrimestre seco (tpcs), temperatura promedio del periodo caliente (tppc), estacionalidad de las temperaturas (edt), oscilación anual de las temperaturas (oat). Se generó un segundo modelo definitivo utilizando las capas climáticas que más contribuyeron al modelo de prueba. El modelo produjo áreas con una probabilidad máxima de 0.738865 de encontrar a la especie dentro de su ambiente típico, con un ajuste de 0.806 en el área bajo la curva, según la curva ROC. El recorte del modelo se hizo al décimo percentil, para ello se ocuparon los archivos de salida Bursera_glabrifolia_median.asc y maxentResults.csv (eligiendo el valor promedio de la columna '10 percentile training presence área'). El área de mayor probabilidad de encontrar a la especie abarca las las selvas bajas caducifolias de las cuencas del Balsas, Armería- Coahuayana y Tehuantepec, más común arriba de los 1500 m de elevación.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      2050
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: BGL041DPGW.DBF

      Definición: Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      Value Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      bgl041dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info, Arcview o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      03-05-2018
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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