Cypseloides cryptus Distribución potencial (Navarro-Sigüenza et al. 2018)

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Información de identificación
1. Referencia
  
  Información de referencia:
  
  Autor:
  
  Navarro-Sigüenza, A. G., A. Gordillo-Martínez, A. Townsend-Peterson, C. A. Ríos-Muñoz, C. R. Gutiérrez-Arellano, D. Méndez-Aranda, T. Kobelkowsky-Vidrio, L. E. Sánchez-Ramos, (2018). 'Cypseloides cryptus. Distribución potencial.', escala: 1:1300000. edición: 1. Museo de Zoología Alfonso L. Herrera, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JM071, Mapas de distribución de las aves terrestres nativas de Mesoamérica. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Ciudad de México, México.
  
  Fecha de publicación:
  
  15-08-2014
  
  Nombre del producto:
  
  Cypseloides cryptus Distribución potencial (Navarro-Sigüenza et al. 2018)
  
  Formato de representación geográfica:
  
  Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
  
  Información complementaria:
  
  Escala: 1:1300000
  
  Acceso en línea:
  
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/ccr071dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
2. Descripción
  
  Resumen:
  
  Se elaboró el modelo de distribución potencial de Cypseloides cryptus dentro del proyecto JM071 Mapas de distribución de las aves terrestres nativas de Mesoamérica. Se estimó la distribución potencial de esta especie, utilizando datos geográficos digitales correspondientes a localidades de colecta y sitios de avistamiento, así como variables climáticas y coberturas topográficas. Los datos fueron incorporados al programa OpenModeller para generar el modelo, utilizando el algoritmo GARP.
  
  Propósito:
  
  Estimar la distribución potencial de Cypseloides cryptus
3. Periodo de validez de los datos
  
  Fecha y hora:
  
  No aplica
  
  Vigencia:
  
  2013-2018
4. Estado de la información
  
  Progreso:
  
  Terminado
  
  Mantenimiento:
  
  No planeado
5. Dominio espacial
  
  Descripción de la extensión geográfica:
  
  Centroamérica
  
  Coordenadas extremas:
  
  (Oeste) -89.7011108398438, (Este) -82.6911010742188, (Norte) 15.7758741378784, (Sur) 8.6458740234375
6. Palabras clave
  
  Tema:
  
  2018, Distribución potencial, JM071, Cypseloides cryptus
  
  Lugar:
  
  Costa Rica, Guatemala, Honduras, Nicaragua, Panamá
7. Taxonomía
  Palabras clave:
  
  Tema: Aves, Apodiformes, Apodidae, Cypseloides, Cypseloides cryptus
  
  Sistema taxonómico:
  
  Clasificación:
  
  Fuente:
  
  ' IOC World Bird Names'
  
  20130130. Gill, F., Donsker, D.B., (2013/01/30), ' IOC World Bird Names', 3.3, International Ornithologists' Union,
  
  Procedimiento taxonómico: No conocido
  
  Clasificación:
  
  Animalia: Chordata: Aves: Apodiformes: Apodidae: Cypseloides: Cypseloides cryptus
8. Herramienta de análisis
9. Condiciones de acceso
  Sin restricciones
10. Condiciones de uso
  Importante:
  
  No se permite utilizar estos datos con fines lucrativos y se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en http://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/mx/
11. Contacto
12. Vista previa
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/ccr071dpgw
  
  Descripción:
  
  171 x 132 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/ccr071dpgw
  
  Descripción:
  
  1002 x 774 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
13. Créditos y reconocimientos
14. Restricciones de uso
15. Sistema nativo
  OpenModeller 1.1, ArcView 3.2, Dell Precision T1650, Intel® Core i7, Windows 7 Pro Service Pack 1, 64 bits
16. Documentos relacionados
Calidad de la información
1. Precisión de los atributos no espaciales
2. Consistencia lógica
  Gabinete
3. Cobertura del tema
  Se integró una base de datos con registros de ubicación de las especies de aves obtenidos de Biologia Centrali Americana, ORNIS Centroamérica (ornisnet.org), aVerAves México (http://www.conabio.gob.mx/otros/nabci/doctos/a_ver_aves.html), Atlas Aves México (Navarro, et al. 2003), y distintas fuentes bibliográficas. La base de datos se depuró geográfica y taxonómicamente. Con los datos depurados se elaboró un dato geoespacial (shapefile) con los registros de presencia de la especie. Se definió una región de modelado M por especie, con base en dos regionalizaciones: ecorregiones de la Comisión para la Cooperación Ambiental (CCA 1997) y ecorregiones del Fondo Mundial para la Naturaleza (Olson et al. 2001). Se utilizaron las 19 variables de worldClim y 3 variables de Hidro1k. Los modelos fueron generados en el programa OpenModeller utilizando el algoritmo GARPwithBestSubsets. Para la evaluación global del modelo se utilizó una curva ROC de los datos internos. Los modelos continuos se trasformaron a binarios utilizando el 10 % como umbral máximo de omisión. Finalmente, el mapa fue editado eliminando áreas con sobrepredicción utilizando las ecorregiones de World Wildlife Fund [http://www.wwf.org]) e información publicada. Estos dos últimos procesos se realizaron con el Sistema de Información Geográfica ArcView3.1.
4. Precisión de los atributos espaciales
5. Procesamiento
  Fuentes:
  
  Navarro-Sigüenza, A. G., A. Gordillo-Martínez, T. Kobelkowsky-Vidrio, D. Méndez-Aranda, (2013/01/13), 'Base de datos de las aves terrestres nativas de Mesoamérica.', Escala 1:1. 1, Museo de Zoología Alfonso L. Herrera, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México, México, D.F.
  
  CCA, (2009), 'Ecological Regions of North America', Commission for Environmental Cooperation, Sistema de clasificación holística basado en el clima, suelos, formas de la tierra vegetación y también uso de la tierra. Sistema jerárquico: 15 regiones ecológicas nivel I y 50 regiones nivel 2., http://www.cec.org/tools-and-resources/north-american-environmental-atlas/map-files, Montreal, Quebec, Canadá.
  
  EROS Data Center, (2000), 'HYDRO1k Elevation Derivative Database', Escala 1:1000000. U.S. Geological Survey Earth Resources Observation and Science (EROS) Center, The effort has been led by U.S.G.S. scientists in collaboration with the United Nations Environment Programme/Global Resource Information Database (UNEP/GRID) located in Sioux Falls, South Dakota., https://lta.cr.usgs.gov/HYDRO1KReadMe, USA.
  
  Olson, D. M., E. Dinerstein, E. D. Wikramanayake, N. D. Burgess, G. V. N. Powell, E. C. Underwood, J. A. D'Amico, I. Itoua, H. E. Strand, J. C. Morrison, C. J. Loucks, T. F. Allnutt, T. H. Ricketts, Y. Kura, J. F. Lamoreux, W. W. Wettengel, P. Hedao, K. R. Kassem, (2001), 'Terrestrial Ecoregions of the World (TEOW)', 2.0, World Wildlife Fund, La información sobre los métodos usados para generar las capas de Ecorregiones Terrestres del Mundo se pueden consultar en: Olson, D.M., E. Dinerstein, E.D. Wikramanayake, N.D. Burgess, G.V.N. Powell, E.C. Underwood, J.A. D'Amico, I. Itoua, H.E. Strand, J.C. Morrison, C.J. Loucks, T.F. Allnutt, T.H. Ricketts, Y. Kura, J.F. Lamoreux, W.W. Wettengel, P. Hedao, and K.R. Kassem. Terrestrial Ecoregions of the World: A New Map of Life on Earth (PDF, 1.1M) BioScience 51:933-938, http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world, Washington, DC.
  
  Hijmans, R.J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. 1.4, WorldClim, Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http://www.worldclim.org/, University of California, Berkeley. U.S.A.
  Procedimientos:
  
  No aplica: Se revisó y depuró la base de datos de registros de la especie con base en su distribución geográfica y criterios taxonómicos. Se realizó una segunda depuración para lograr una representación más homogénea, eliminados registros de condiciones ambientales que estuvieran sobre-representadas. En total se utilizaron 30 registros únicos para modelar la especie y con ellos se elaboró un dato geoespacial (shapefile). Se modelo la distribución Parcial (Costa Rica, Guatemala, Honduras, Nicaragua, Panamá). Se definió la región 'M' sobre la cual se generó el modelo utilizando dos regionalizaciones: ecorregiones de la Comisión para la Cooperación Ambiental (CCA 2010) y ecorregiones del Fondo Mundial para la Naturaleza (Olson et al. 2001). La M quedó conformada por aquellas regiones en las que existen registros de la especie: Atlantic Humid Tropical Forests, Central American Pacific Dry Forests, Pacific Humid Tropical Forests, Talamanca Cordillera. Posteriormente, se utilizó la región geográfica M para cortar las de 19 variables climáticas de proyecto WorldClim y de tres coberturas de Hydro1K (índice topográfico, pendiente y elevación) y de esta forma acotar la región de modelado. Se hizo un análisis de correlación de las 22 variables utilizando el programa R y se eliminaron aquellas que estuvieran correlacionadas en más de 0.85. Las variables seleccionadas fueron: oscilación diurna de la temperatura, isotermalidad, estacionalidad de la temperatura, temperatura máxima promedio del mes más cálido, precipitación anual, precipitación del mes más seco, estacionalidad de la precipitación, precipitación del cuatrimestre más cálido, precipitación del cuatrimestre más frío, índice topográfico, pendiente y elevación. Se incorporó el dato geoespacial (shapefile) de los registros de presencia de la especie y las variables climáticas seleccionadas al programa OpenModeller DesktopVersion 1.1.0, todos en formato ASCII GRID. Se generó el modelo de distribución con el algoritmo GARPwithBestSubsets, utilizando los siguientes parámetros: Commission Sample Size: 999; Commission Threshold: 50; Convergence limit: 0.01 Hard Omission Threshold: 100; Max generations: 400; Maximum Number of Threads: 1; Models Under Omission Threshold (Best Subsets): 20; Population size: 50; Resamples: 2500; Total Runs: 100; Training Proportion: 90; Valor umbral para línea de corte: 10% de omisión. A partir del modelo binario generado con el 10 % de omisión se obtuvo el modelo final. En los casos en los que el mapa binario incluyó un gran porcentaje de los registros, se respetó el binario obtenido con este umbral de corte que paso hacer presencia (1). En los casos en los que el mapa binario mostró una predicción sobreajustada, se tomó como presencia (1) toda la predicción del modelo continuo. Finalmente, se editó el modelo resultante eliminando áreas fuera del área de distribución de la especie, a partir del mapa de ecorregiones de World Wildlife Fund [http://www.wwf.org], información publicada, y la experiencia del equipo de trabajo. Para la evaluación global del modelo se utilizó una curva ROC de los datos internos, que en este caso fue de 0.91. El archivo tipo ASCII generado por el programa OpenModeller fue importado al programa ArcView3.2 y convertido a formato GRID de ArcInfo.
6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
Atributos espaciales
1. Representacion espacial
2. Método de representacion espacial
  Vector
3. Información de vectores y puntos
  
  Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
  
  Tipo de objetos punto y vectores:
  
  G-polygon
  
  Número de puntos o vectores:
  
  123
4. Información de imágenes
Sistema de referencia
1. Sistema de coordenadas (horizontal)
  
  Geográficas:
  
  Resolución de la latitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Resolución de la longitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Unidades de las coordenadas Geográficas:
  
  Decimal degrees
  
  Modelo geodésico:
  
  Datum horizontal:
  
  WGS84
  
  Elipsoide:
  
  WGS84
  
  Semieje mayor:
  
  6378137.000000
  
  Denominador del factor de achatamiento:
  
  298.257224
2. Sistema de coordenadas (vertical)

Atributos no espaciales

Descripción detallada

Nombre: CCR071DPGW.DBF

Definición: Representa los valores de presencia de las condiciones favorables.

Fuente: No conocido

Atributo	Descripción	Fuente [1]	Dominio [2]	Precisión [3]
GRIDCODE	Numérico	Datos del proyecto.	Representa la presencia de la especie.	-

Descripción resumida

Distribución de la información
1. Información de contacto
  
  Jose Manuel Davila Rosas
  
  jdavila@conabio.gob.mx
  
  Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
2. Nombre de referencia
  ccr071dpgw
3. Responsabilidad
  La Subdirección de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
4. Medios de distribución
  Digitales:
  
  ESRI Shapefile (SHP), 1.00 MB
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/ccr071dpgw.zip
  
  Google Earth (KML)
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/ccr071dpgw.kmz
  
  Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.
5. Medios de distribución especiales
6. Requisitos técnicos
  Tener Arc-Info, Arcview o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
7. Disponibilidad
Acerca de este documento
1. Fecha de creación o última actualización
  15-08-2018
2. Fecha de última revisión
3. Fecha de la siguiente revisión
4. Información de contacto
  
  Nadya Moreno Almeraya
  
  ssig@conabio.gob.mx
  
  Administrador de Metadatos
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 01 55 5004 4963 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
5. Nombre del estándar de contenido
  FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
6. Versión del estándar de contenido
  FGDC-STD-001.1-1999
7. Uso horario
8. Condiciones de acceso
9. Condiciones de uso
10. Restricciones de seguridad o privacidad
11. Extensiones

Cypseloides cryptus Distribución potencial (Navarro-Sigüenza et al. 2018)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

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