Cynomys ludovicianus (perro llanero) Distribución potencial (Ballesteros-Barrera et al., 2016)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Ballesteros-Barrera, C., O. Aguilar-Romero, O. Téllez-Valdés, J. López-Jardines, (2016)

Palabras clave: 2016, Biodiversidad, Categoría de Riesgo, Cynomys ludovicianus, Distribución Potencial, Distribución restringida, Endémica, JM053, Mamíferos de México, Mammalia

Fecha de publicación: 17-01-2016, del metadato 17-01-2016

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Ballesteros-Barrera, C., O. Aguilar-Romero, O. Téllez-Valdés, J. López-Jardines, (2016). 'Cynomys ludovicianus (perro llanero). Distribución potencial.', escala: 1:1000000. edición: 1. Unidad Iztapalapa, Universidad Autónoma Metropolitana. Proyecto: JM053, Distribución potencial de las especies de mamíferos con distribución restringida presentes en México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Ciudad de México, México.
      Fecha de publicación:
      17-01-2016
      Nombre del producto:
      Cynomys ludovicianus (perro llanero) Distribución potencial (Ballesteros-Barrera et al., 2016)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/clu053dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      El modelo de distribución potencial de Cynomys ludovicianus, se elaboró dentro del proyecto JM053 'Distribución potencial de las especies de mamíferos con distribución restringida presentes en México', apoyado por CONABIO. El objetivo fue estimar la distribución potencial de esta especie, utilizando como datos biológicos digitales, los sitios de recolecta que conforman la base de datos (generada para este proyecto) y las variables climáticas que influyen en la distribución de la especie (elaboradas a alta resolución para México (Cuervo-Robayo et al. 2013)). Ambos conjuntos de datos fueron incorporados en el programa MaxEnt 3.3.3k para generar el modelo, el cual fue importado al programa ArcMap 10 para eliminar las áreas con probabilidades por debajo del décimo percentil. Y se generaron los perfiles bioclimáticos de la especie por medio del programa BIOCLIM.
      Propósito:
      Estimar la distribución potencial de Cynomys ludocivianus.
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=53
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1956-1994
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extensión geográfica:
      República Mexicana
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -111.583473205566, (Este) -100.425575256348, (Norte) 31.7873725891113, (Sur) 21.3377895355225
    6. Palabras clave
      Tema:
      2016, Biodiversidad, Categoría de Riesgo, Cynomys ludovicianus, Distribución Potencial, Distribución restringida, Endémica, JM053, Mamíferos de México, Mammalia
      Lugar:
      Aguascalientes, Coahuila de Zaragoza, Chihuahua, Durango, Estados Unidos de América, Guanajuato, Jalisco, Nayarit, Nuevo León, República Mexicana, San Luis Potosí, Sinaloa, Sonora, Zacatecas
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Mammalia, Rodentia, Sciuridae, Cynomys, Cynomys ludovicianus, perro llanero, perrito llanero cola negra, ardilla terrestre, perrito de las praderas, perrito de las praderas de cola negra, perro llanero norteño, black-tailed prairie dog, chien de prairie
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Actualización del Catálogo de Autoridades de los Mamíferos.'

        20080000. Ramírez-Pulido, J., J. Arroyo-Cabrales, N. González-Ruiz, (2008), 'Actualización del Catálogo de Autoridades de los Mamíferos.', versión: 2, División de Ciencias Biológicas y de la Salud, Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa, ES010, Base de datos SNIB-CONABIO, México, D.F.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Cobertura taxonómica:
      Mamíferos
      Clasificación:

      Animalia: Chordata: Mammalia: Rodentia: Sciuridae: Cynomys: ()

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/clu053dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/clu053dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3k, Desktop GARP, ArcMap 10, ArcView 3.2, Dell Precision T1650, Intel ® Xeon ®, 3.4 GHz, RAM 8.0., Windows 7
    16. Documentos relacionados

      Cynomys ludovicianus (perro llanero) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Ballesteros-Barrera et al., 2016)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

      Cynomys ludovicianus (perro llanero) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Ballesteros-Barrera et al., 2016)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Página de enciclovida para Cynomys ludovicianus a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 11832MAMIF en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Se depuró la base de datos de los registros de la ubicación de Cynomys ludovicianus, de la base de datos tabular del proyecto: 'Distribución potencial de las especies de mamíferos con distribución restringida presentes en México', para elaborar el dato geográfico de la distribución de la especie. Se utilizaron las superficies climáticas de las condiciones actuales (1910-2009) generadas a alta resolución para México (Cuervo et al, 2013), obtenidas con los programas ANUSPLIN 4.3 y ANUCLIM 6.1. Con estas coberturas, se obtuvieron los perfiles bioclimáticos para determinar teóricamente los límites ambientales probables para la distribución de la especie, utilizando el programa BIOCLIM. En el programa MaxEnt 3.3.3k, se ejecutó para generar los modelos y se utilizó el Sistema de Información Geográfica ArcMap 10 para realizar los distintos procesos en la elaboración del dato geográfico de la distribución potencial de la especie. Se utilizó el valor del décimo percentil para determinar la presencia de la especie. Se empleó AUC, Curvas ROC y Partial ROC como métodos de evaluación global del modelo, para el cual se utilizó el 10% de las localidades únicas disponibles, seleccionadas al azar, utilizando el software de acceso libre QGIS 2.0 Dufour y se utilizó el Programa ROC Parcial (Barve, 2008). La región geográfica se determinó utilizando las Ecorregiones Terrestres de México, 2008, y cuyo trazo del polígono comprende los estados de: Coahuila, Chihuahua, Durango, Nuevo León, Sinaloa y Sonora. Está delimitado por las coordenadas extremas: N 31.787372; W -111.583469; E -100.425582 y S 21.33779. Y se utilizó el programa NCSS v.97, para realizar un Análisis de Componentes Principales e identificar las variables ambientales que influyen en la distribución de la especie, las coberturas seleccionadas para la generación del modelo fueron: Temperatura media anual, Temperatura máxima del mes más cálido, Temperatura mínima del mes más frio, Intervalo de la temperatura anual, Temperatura promedio del trimestre más húmedo, Temperatura promedio del trimestre más cálido, Temperatura promedio del trimestre más frio y Precipitación anual. El modelo se elaboró a nivel de especie, utilizando la información del campo: acceptedNameUsage (de la base de datos DarwinCore), que contiene la información a nivel de subespecie.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Ballesteros-Barrera, C., O. Aguilar-Romero, O. Téllez-Valdés, J. López-Jardines, (2016), 'Distribución potencial de las especies de mamíferos con distribución restringida presentes en México', versión: 1, Unidad Iztapalapa, Universidad Autónoma Metropolitana, Ciudad de México, México. Base de datos SNIB-CONABIO, proyecto No. JM053, http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=53

      • Cuervo-Robayo, A. P., O. Téllez-Valdés, M. Gómez, C. Venegas-Barrera, J. Manjarrez, E. Martínez-Meyer, (2013), 'An update of high-resolution monthly climate surfaces for Mexico', International Journal of Climatology, Volume 34, Issue 7 https://doi.org/10.1002/joc.3848, http://idrisi.uaemex.mx/distribucion/superficies-climaticas-para-mexico

      • INEGI, CONABIO, INE, (2008), 'Ecorregiones terrestres de México', Escala 1:1000000. Instituto Nacional de Estadística, Geografía e Informática, Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad e Instituto Nacional de Ecología, México, D. F.http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/region/biotic/ecort08gw.

      Procedimientos:

      • No aplica: Se revisó y depuró la base de datos con la ubicación geográfica de la especie para evaluar la consistencia de la distribución, la carencia de datos y la nomenclatura taxonómica; obteniendo las localidades de la especie en formato Shapefile, representando por puntos. Con el uso del software libre QGIS 2.0 Dufour, se realizó una selección aleatoria del 10% de los puntos de presencia de la especie para la validación final del modelo y el resto de los puntos (90%) se utilizó para general el modelo. Se generaron a través de la interpolación las coberturas de 19 variables climáticas utilizando los datos de temperatura máxima, temperatura mínima y precipitación; adquiridos de la red de estaciones meteorológicas estándar del sur de Estados Unidos, México y norte de Centroamérica, para el periodo de 1910 a 2009 (Cuervo et al., 2013), mediante los programas ANUSPLIN 4.3 y ANUCLIM 6.1, a una resolución de 1 km cuadrado. Utilizando estas coberturas y la extensión de BIOCLIM, se obtuvieron los perfiles bioclimáticos de la especie y con el programa NCSS v. 97, se realizó un Análisis de Componentes Principales (PCA), para determinar las variables ambientales que influyen en la distribución de la especie, seleccionando aquellas cuya explicación fuera mayor o igual al 70% para el primer eigenvalor. Se delimitó el área sobre la cual se generaría el modelo, refiriéndola como la región M de acuerdo al diagrama BAM (Soberón y Peterson, 2005), utilizando como referencia las Ecorregiones Terrestres de México, 2008, delimitando un polígono que incluye los estados de: Coahuila, Chihuahua, Durango, Nuevo León, Sinaloa y Sonora, cuya extensión está definida por las siguientes coordenadas extremas: N 31.787372; W -111.583469; E -100.425582 y S 21.33779. En seguida, se incorporaron los registros de presencia de la especie y las variables climáticas al programa MaxEnt 3.3.3k, para general el modelo de distribución geográfica potencial, cuyos parámetros de elaboración fueron: tipo de salida: logístico; número de registros: 80; porcentaje de puntos de entrenamiento: 70%; porcentaje de punto de prueba: 30%; selección de localidades únicas: no; selección de la opción Clamping: no; y versión del programa: 3.3.3k. Finalmente, el archivo tipo ASCII generado por el programa MaxEnt 3.3.3k fue incorporado al programa ArcMap 10, con el objeto de realizar un corte por debajo del décimo percentil cuyo valor es de: 0.153 y con una AUC de: 0.881. Los modelos se presentan de manera binaria, donde 0 indica ausencia y 1 = presencia. Utilizando el programa ROC Parcial (Barve, 2008), se validó el modelo obteniendo un valor de: 1.7413. El modelo se generó con registros a nivel de especie y de las siguientes subespecies (Cynomys ludovicianus arizonensis)

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      3470
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: CLU053DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      GRIDCODE Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      clu053dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      17-01-2016
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones

COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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