Colibri thalassinus (colibrí orejas violetas) Distribución potencial (Schondube et al., 2020)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Schondube, J.E., J. Ayala-Berdón, A. Domínguez-Perez, (2020)

Palabras clave: 2020, colibrí orejas violetas, Colibri thalassinus, Distribución potencial, JM056, nicho ecológico

Fecha de publicación: 26-02-2020, del metadato 26-02-2020

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Schondube, J.E., J. Ayala-Berdón, A. Domínguez-Perez, (2020). 'Colibri thalassinus (colibrí orejas violetas). Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. Instituto de Investigaciones en Ecosistemas y Sustentabilidad, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JM056, Desarrollo de modelos fisiológicos para predecir la distribución geográfica de murciélagos filostómidos y colibríes. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Ciudad de México, México.
      Fecha de publicación:
      26-02-2020
      Nombre del producto:
      Colibri thalassinus (colibrí orejas violetas) Distribución potencial (Schondube et al., 2020)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/cth056dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      El Modelo de distribución geográfica potencial del colibrí Colibri thalassinus se llevó a cabo como parte del proyecto JM056.
      Propósito:
      Estimar la distribución potencial de Colibri thalassinus.
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=56
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1888-2011
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extensión geográfica:
      Canadá, Estados Unidos de América, México, Centroamérica y Sudamérica
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -124.76905931418, (Este) -34.79905931418, (Norte) 51.599638688845, (Sur) -55.970361311155
    6. Palabras clave
      Tema:
      2020, colibrí orejas violetas, Colibri thalassinus, Distribución potencial, JM056, nicho ecológico
      Lugar:
      Aguascalientes, Anguila, Antigua y Barbuda, Argentina, Aruba, Bahamas, Baja California, Baja California Sur, Barbados, Belice, Bermuda, Bolivia, Brasil, Campeche, Canadá, Ciudad de México, Coahuila de Zaragoza, Colima, Colombia, Costa Rica, Cuba, Curasao, Chiapas, Chihuahua, Chile, Dominica, Durango, Ecuador, El Salvador, Estados Unidos de América, Francia, Granada, Guanajuato, Guatemala, Guerrero, Guyana, Haití, Hidalgo, Holanda, Honduras, Islas Caimán, Islas Georgias del Sur, Islas Malvinas, Islas Turcas y Caicos, Islas Ultramarinas Menores de Estados Unidos, Islas Virgenes Británicas, Jalisco, Jamaica, México, Michoacán de Ocampo, Montserrat, Morelos, Nayarit, Nevis, Nicaragua, Nuevo León, Oaxaca, Panamá, Paraguay, Perú, Puebla, Querétaro, Quintana Roo, República Dominicana, San Luis Potosí, San Vicente y las Granadinas, Santa Lucía, Sinaloa, Sint Maarten, Sonora, Surinam, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Tobago, Uruguay, Venezuela, Veracruz de Ignacio de la Llave, Yucatán, Zacatecas
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Aves, Apodiformes, Trochilidae, Colibri, Colibri thalassinus, colibrí orejas violetas, green violetear, mexican violetear, mevi, colibri thalassin, mexicaanse violetoorkolibrie
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Check-List of North American Birds'

        19980000. AOU, (1998), 'Check-List of North American Birds', versión: 7th ed, American Ornithologists' Union, Washington D.C., USA.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Animalia: Chordata: Aves: Apodiformes: Trochilidae: Colibri: (, , , , , )

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/cth056dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/cth056dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3a, ArcView 3.1, Dell XPS 8500, Intel® Core i7, 3.4GHz, RAM 16.0, Windows 7 Pro Service Pack 1, 64 bits
    16. Documentos relacionados

      Colibri thalassinus (colibrí orejas violetas) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Schondube et al., 2020)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

      Colibri thalassinus (colibrí orejas violetas) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Schondube et al., 2020)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Página de enciclovida para Colibri thalassinus a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 13328AVES en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Para modelar la distribución potencial de la especie Colibri thalassinuss se utilizó MaxEnt. Los modelos fueron construidos con datos de colecta históricos. Se utilizaron capas de datos ambientales de WorldClim (http://biogeo.berkeley.edu/worldclim/ worldclim.htm). Se eliminaron capas de WorldClim con información ambiental redundantes. Adicionalmente se utilizaron capas topográficas de elevación, pendiente e índice topográfico. La región de modelado (M) se definió basada en la historia biográfica de la especie y a sus capacidades de dispersión. Se utilizó el 60% de los puntos de colecta para generar los modelos (entrenamiento) y el 40% restante para su validación (prueba). Se reclasificaron los modelos (binario) utilizando un error de omisión del 5%. El desempeño del modelo se evaluó utilizando ROC parcial promedio de 1000 iteraciones.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Schondube, J.E., J. Ayala-Berdón, A. Domínguez-Perez, (2017), 'Desarrollo de modelos fisiológicos para predecir la distribución geográfica de murciélagos filostómidos y colibríes', versión: 1, Instituto de Investigaciones en Ecosistemas y Sustentabilidad, Universidad Nacional Autónoma de México, Morelia, Michocán, México. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto No. JM056,

      • Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis , (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http:// www.worldclim.org/.

      • EROS Data Center, (2000), 'Hydro 1K Elevation Derivative Database', Escala 1:1000000. U.S. Geological Survey Earth Resources Observation and Science (EROS) Center, USA. The effort has been led by U.S.G.S. scientists in collaboration with the United Nations Environment Programme/Global Resource Information Database (UNEP/GRID) located in Sioux Falls, South Dakota., https://www.usgs.gov/centers/eros/science/usgs-eros-archive-digital-elevation-hydro1k?qt-science_center_objects=0#qt-science_center_objects

      • Phillips, J. S., R. Anderson, R. Schapire, M. Dudick, (2000), 'Maxent software for species habitat modeling', versión: 3.3.3 k, Princeton University and The Center of Biodiversity and Conservation, American Museum of natural History, USA. Steven J. Phillips, Miroslav Dudík, Robert E. Schapire. A maximum entropy approach to species distribution modeling. In Proceedings of the Twenty-First International Conference on Machine Learning, pages 655-662, 2004. https://www.cs.princeton.edu/~schapire/papers/maxent_icml.pdf Steven J. Phillips, Robert P. Anderson, Robert E. Schapire. Maximum entropy modeling of species geographic distributions. Ecological Modelling, 190:231-259, 2006. (datasets used in this paper are available below). http://www.cs.princeton.edu/~schapire/papers/ecolmod.pdf, http://www.cs.princeton.edu/~schapire/maxent/

      Procedimientos:

      • No aplica: El modelo de la especie Colibri thalassinus fue construido con datos de colecta históricos obtenidos de la Global Biodiversity Information Facility database (http://www.gbif.org/) y fuentes adicionales. La región de modelado (M) se definió basada en la historia biogeográfica de la especie y a sus capacidades de dispersión. Se utilizaron capas de datos ambientales de WorldClim (http://biogeo.berkeley.edu/worldclim/ worldclim.htm) y capas topográficas, que reflejan la capacidad del terreno de colectar agua con base en su forma (convexa o cóncava) (Hydro 1K, http://lpdaac.usgs.gov/gtopo30/hydro/; con una resolución de 1 km). Debido a que existe correlación entre las capas climáticas, se realizó el modelado utilizando las capas independientes con mayor importancia biológica. Para generar el modelo de distribución geográfica, se incorporaron al programa MaxEnt los datos geográficos de la distribución de la especie en formato .csv o .txt y las variables climáticas en formato ASCII GRID: rango diurno promedio de la temperatura, estacionalidad de la temperatura, temperatura máxima del mes más cálido, temperatura mínima del mes más frío, precipitación anual, precipitación del mes más seco y del mes más húmedo, y estacionalidad en la precipitación y las variables topográficas: elevación, pendiente e índice topográfico. Se utilizaron el 60% de los puntos de colecta para generar los modelos (entrenamiento) y el 40% restante para su validación (prueba). Se activaron: Create response curves, Do jacknife to measure variable importance, Auto features y Random seed. Se desactivó: Extrapolate y do clamping. Se reclasificaron los modelos (binario) utilizando un error de omisión del 5% y el valor de equal test sensitivity and specificity (0.176). El valor del ROC parcial fue de 1.906539887502 y resultó significativa (<0.001). Para modelar la especie, también se usaron los registros de la subespecie: Colibri thalassinus thalassinus.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      16730
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: CTH056DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie.

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      GRIDCODE Numérico Datos del proyecto Representa la presencia de la especie 1 y la ausencia 0. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      cth056dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info, Arcview o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      26-02-2020
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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