Epidendrum radicans (estrella de fuego) Distribución potencial (Damon y Bertolini, 2014)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: V. Bertolini, Damon-Beale, A. A., (2014)

Palabras clave: Distribución potencial, Epidendrum radicans, JM061, MaxEnt, Orchidaceae, Superficie probabilidad

Fecha de publicación: 03-07-2013, del metadato 25-02-2014

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      V. Bertolini, Damon-Beale, A. A., (2014). 'Epidendrum radicans (estrella de fuego). Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. El Colegio de la Frontera Sur, Unidad Tapachula. Proyecto: JM061, Modelación de la distribución geográfica de las orquídeas del Soconusco. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO).. Tapachula, Chiapas, México.
      Fecha de publicación:
      03-07-2013
      Nombre del producto:
      Epidendrum radicans (estrella de fuego) Distribución potencial (Damon y Bertolini, 2014)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/era061dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      El modelo estima la distribución del nicho ambiental de la especie Epidendrum radicans, generado a través de 'Minimum training presence' de Maxent. Por lo tanto tiene información binaria de presencia/ausencia del nicho ambiental, abarcando desde el centro de México hasta el norte de Brasil.
      Propósito:
      Estimar la distribución potencial de Epidendrum radicans
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=JM&Numero=061
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1938-2010
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extensión geográfica:
      República Mexicana, Centroamérica y Sudamérica
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -102.233093261719, (Este) -72.3997497558594, (Norte) 19.1289520263672, (Sur) 1.45395088195801
    6. Palabras clave
      Tema:
      Distribución potencial, Epidendrum radicans, JM061, MaxEnt, Orchidaceae, Superficie probabilidad
      Lugar:
      República Mexicana, Veracruz de Ignacio de la Llave, Tabasco, República de Guatemala, Quintana Roo, Puebla, Panamá, Oaxaca, Nicaragua, Michoacán de Ocampo, Honduras, Guerrero, El Salvador, Chiapas, Costa Rica, Colombia, Campeche, Belize
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Liliopsida, Orchidales, Orchidaceae, Epidendrum, Epidendrum radicans, estrella de fuego
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.'

        19810000. Cronquist, A., (1981), 'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.', Columbia University Press., New York, Estados Unidos.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Plantae: Magnoliophyta: Liliopsida: Orchidales: Orchidaceae: Epidendrum: ()

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/era061dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/era061dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3k, ArcView 3.2, ArchMap 10, Divas-Gis, Dell Vostro 470, Intel® Core i7-3770 CPU @, 3.4GHz, RAM 6.0 GB, Windows 7
    16. Documentos relacionados
  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      1) Se integró una base de datos a partir de datos de distintas fuentes de información, datos propios, datos obtenidos vía electrónica, datos proporcionados por el SNIB, y datos recopilados de distintos herbarios de Centroamérica y Colombia. 2) Los datos se revisaron exhaustivamente en términos de su distribución geográfica y nomenclatura. 3) Se definió una región de referencia M basada en las 'Ecorregiones Terrestres Mundiales' (http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world), y quedó conformada por las eco-regiones con presencia de registros de esta especie; 4) Se generaron los datos geográficos de las ocho capas bioclimáticas seleccionadas de WorldClim (Hijmans et al. 2005). 5) Se modeló la distribución geográfica utilizando MaxEnt 3.3.3k. (Phillips et al. 2006); 6) La calidad de los modelos se evaluó considerando la estimación del área bajo la curva (AUC) ROC, aplicado a 'test data' y 'training data'; 7) El modelo obtenido se transformó en un mapa booleano (presencia/ausencia) a partir del 'Minimum training presence'.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • V. Bertolini, Damon, A, (2015), 'Modelación de la distribución geográfica de las Orchidaceae del Soconusco', 1, Unidad Tapachula, El Colegio de la Frontera Sur, Tapachula, Chiapas, México.

      • Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. 1.4, WorldClim, Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http://www.worldclim.org/, University of California, Berkeley. U.S.A..

      • Olson, D. M., E. Dinerstein, E. D. Wikramanayake, N. D. Burgess, G. V. N. Powell, E. C. Underwood, J. A. D'Amico, I. Itoua, H. E. Strand, C. J. Loucks, J. C. Morrison, T. F. Allnutt, T. H. Ricketts, Y. Kura, J. F. Lamoreux, W. W. Wettengel, P. Hedao, K. R. Kassem, (2001), 'Terrestrial Ecoregions of the World (TEOW)', 2.0, World Wildlife Fund, La información sobre los métodos usados para generar las capas de Ecorregiones Terrestres del Mundo se pueden consultar en: Olson, D. M., Dinerstein, E., Wikramanayake, E. D., Burgess, N. D., Powell, G. V. N., Underwood, E. C., D'Amico, J. A., Itoua, I., Strand, H. E., Morrison, J. C., Loucks, C. J., Allnutt, T. F., Ricketts, T. H., Kura, Y., Lamoreux, J. F., Wettengel, W. W., Hedao, P., Kassem, K. R. 2001. Terrestrial ecoregions of the world: a new map of life on Earth. Bioscience 51(11):933-938., http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world, Washington, D. C..

      Procedimientos:

      • No aplica: 1) Se integró una base de datos a partir de información del grupo de investigación 'Ecología y cultivo sustentable de las orquídeas del Soconusco'(Departamento de Conservación de la Biodiversidad de ECOSUR), de datos proporcionados por el Sistema Nacional de Información de Biodiversidad (SNIB - CONABIO), datos obtenidos vía electrónica del Herbario Nacional de México (MEXU), Missouri Botanical Garden (MOBOT) y el Colegio de la Frontera Sur, unidad Tapachula (ECOSUR-T) y de datos recopilados de distintos herbarios de Centroamérica y Colombia; 2) Los datos se revisaron exhaustivamente y se identificaron registros mal ubicados, geográficamente incongruentes, o cuyos coordenadas no coincidieron con la descripción del sitio; 3) Se definió una región de referencia M basada en las 'Ecoregiones Terrestres Mundiales' (http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world), que quedó conformada por las siguientes eco-regiones (OBJECTID): 927, 1281, 169, 244, 1221, 1230, 1552, 957, 1368, 267, 271, 284, 290, 299, 1145, 752, 765, 772, 774, 840, 1360, 940, 949, 950, 988, 990, 1008, 1030, 1034, 1056, 1059, 1063, 1065, 1071, 1112, 1116, 1132, 1193, 1197, 1203, 1215, 1249, 1259, 1266, 1294, 1300, 1306, 1313, 1371, 1387, 1493. 4) Se generaron los datos geográficos de las ocho capas bioclimáticas seleccionadas a partir de las capas climáticas de WorldClim (Hijmans et al. 2005) con el molde M: Annual Mean Temperature, Temperature Seasonality (standard deviation *100), Max Temperature of Warmest Month, Min Temperature of Coldest Month, Annual Precipitation, Precipitation of Wettest Month. Precipitation of Driest Month, Precipitation Seasonality (Coefficient of Variation); 5) Se incorporaron los datos geográficos de distribución de la especie y las variables climáticas al programa MaxEnt 3.3.3k (Phillips et al. 2006). En la ventana de abertura del software Maxent, se seleccionaron las opciones pre-establecidas, además de activar la función de 'create reponse curves' y de 'Do jacknife to measure variable importance'. Abriendo la ventana de Setting/Basic, se activó la función 'Random seed' y se asignó el valor de 25% a la función de 'Random test percentage'. En la ventana de Setting/Advanced, se activó el 'Minimum training presence' de 'Apply threshold rule'. Se utilizó el 25 % de los datos para entrenamiento del modelo (total de registros: 196) y el restante 75 % para validación; 6) La calidad de los modelos se evaluó considerando la estimación del área bajo la curva (AUC) ROC, aplicado a 'test data' y 'training data' que resultó de 0.815 y 0.918, respectivamente .

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      8592
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: ERA061DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      Value Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Jose Manuel Davila Rosas

      jdavila@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      era061dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subdirección de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      25-02-2014
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Estrella Cruz Reyes

      ecruz@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 4963 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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