Ficus crassinervia (amate dulce) Distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)

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Información de identificación
1. Referencia
  
  Información de referencia:
  
  Autor:
  
  López-Toledo, L., G. Ibarra-Manríquez, (04/10/2015). 'Ficus crassinervia (amate dulce). Distribución potencial.', escala: 1:1000000. edición: 1. Centro de Investigaciones en Ecosistemas, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JM037, Distribución potencial del género Ficus (Moraceae) en México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). México.
  
  Fecha de publicación:
  
  04-10-2015
  
  Nombre del producto:
  
  Ficus crassinervia (amate dulce) Distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)
  
  Formato de representación geográfica:
  
  Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
  
  Información complementaria:
  
  Escala: 1:1000000
  
  Acceso en línea:
  
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/fcr037dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
2. Descripción
  
  Resumen:
  
  Se modeló la distribución del nicho ecológico de Ficus crassinervia, dentro del proyecto JM037 'Distribución potencial del género Ficus (Moraceae) en México.', apoyado por CONABIO. El objetivo fue desarrollar el modelo de nicho la especie, para posteriormente identificar las áreas con mayor riqueza de especies del género en México. Para esto se utilizaron como datos geográficos digitales los sitios de recolecta georreferenciados de una base de datos generada por el proyecto y 15 variables ambientales no autocorrelacionados obtenidas de Worldclim. Como región de referencia (M) se utilizaron las provincias biogeográficas en las que se ha colectado la especie,así como aquellas en las que es posible su presencia: Oaxaquense, Pacifiquense, Campechano-Petenense, Yucatanense, Chiapasense, Veracruzense, Sierra Madre Sureña, Sierra Madre Occidentalense, Sierra Madre Orientalense, Neovolcanense, Nayaritense y Jalisqueño-Guerrerense. Este conjunto de datos fueron incorporados en el programa Maxent 3.3.3 para generar el modelo, el cual se procesó con el Sistema de Información Geográfica ArcMap 10 para eliminar las áreas con probabilidades por debajo del umbral 'Maximum training sensitivity plus specificity' (Valor de umbral=0.418).
  
  Propósito:
  
  Estimar la distribución del nicho ecológico de Ficus crassinervia en México
  
  Información suplementaria:
  
  Para desarrollar el modelo, se utilizaron registros de presencia de la especie, así como las siguientes capas bioclimáticas de Worldclim: Las coberturas climáticas digitales utilizadas fueron: 1. Temperatura media anual (°C), 4. Estacionalidad de la Temperatura (°C), 5. Maxima temperatura del mes más cálido (°C), 6. Minima temperatura del mes más frío (°C), 8.Media de la temperatura del cuarto mes más húmedo (°C), 9.Media de la temperatura del cuarto mes más seco (°C), 10. Media de la temperatura del mes más cálido (°C), 11. Media de la temperatura del cuarto mes más frío (°C), 12. Precipitación anual (mm), 13. Precipitación del mes más húmedo (mm), 14. Precipitación del mes más seco (mm), 15. Estacionalidad de la precipitación (mm), 16. Precipitación del cuarto mes más húmedo (mm), 17. Precipitación del cuarto mes más seco (mm) y 19. Precipitación del cuarto mes más frío (mm). La región de referencia (M) se construyó con base en las provincias biogeográficas Oaxaquense, Pacifiquense, Campechano-Petenense, Yucatanense, Chiapasense, Veracruzense, Sierra Madre Sureña, Sierra Madre Occidentalense, Sierra Madre Orientalense, Neovolcanense, Nayaritense y Jalisqueño-Guerrerense (Ferrusquía-Villafranca 1990). Del número de sitios utilizados para modelar, (6) se encuentran fuera del modelo Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=JM&Numero=37
3. Periodo de validez de los datos
  
  Fecha y hora:
  
  No aplica
  
  Vigencia:
  
  1935-2009
4. Estado de la información
  
  Progreso:
  
  Terminado
  
  Mantenimiento:
  
  No planeado
5. Dominio espacial
  
  Descripción de la extensión geográfica:
  
  República Mexicana
  
  Coordenadas extremas:
  
  (Oeste) -111.251335144043, (Este) -86.7375640869141, (Norte) 31.4121074676514, (Sur) 14.5653743743896
6. Palabras clave
  
  Tema:
  
  2013, Ficus crassinervia, JM037
  
  Lugar:
  
  Aguascalientes, Belize, Campechano-Petenense, Campeche, Coahuila de Zaragoza, Colima, Chiapas, Chiapasense, Chihuahua, Distrito Federal, Durango, Estados Unidos de América, Guanajuato, Guerrero, Hidalgo, Jalisco, Jalisqueno-Guerrerense, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Nayarit, Nayaritense, Neovolcanense, Nuevo León, Oaxaca, Oaxaquense, Pacifiquense, Puebla, Querétaro de Arteaga, Quintana Roo, República de Guatemala, República Mexicana, San Luis Potosí, Sierra Madre Orientalense, Sinaloa, Sonora, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Veracruzense, Yucatán, Yucatanense, Zacatecas
7. Taxonomía
  Palabras clave:
  
  Tema: Magnoliopsida, Urticales, Moraceae, Ficus, Ficus crassinervia, amate dulce, amate, copo, higo, higuera
  
  Sistema taxonómico:
  
  Clasificación:
  
  Fuente:
  
  'El género Ficus L. (Moraceae) en México Ibarra-Marríquez et al., 2012'
  
  20120000. Ibarra-Manriquez, G., G. Cornejo-Tenorio, N. González-Castañeda, E.M. Piedra-Malagón, A. Luna, (2012), 'El género Ficus L. (Moraceae) en México Ibarra-Marríquez et al., 2012', Botanical Sciences, 90(4): 389-452,
  
  Procedimiento taxonómico: No conocido
  
  Clasificación:
  
  Plantae: Magnoliophyta: Magnoliopsida: Urticales: Moraceae: Ficus: Ficus crassinervia (amate dulce, amate, copo, higo, higuera)
8. Herramienta de análisis
9. Condiciones de acceso
  Sin restricciones
10. Condiciones de uso
  Importante:
  
  Se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
11. Contacto
12. Vista previa
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/fcr037dpgw
  
  Descripción:
  
  171 x 132 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/fcr037dpgw
  
  Descripción:
  
  1002 x 774 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
13. Créditos y reconocimientos
14. Restricciones de uso
15. Sistema nativo
  R 2.15.1, ILWIS 3.4, QuantumGIS 1.7.4, Maxent 3.3.3e, ArcMap 10, Dell Vostro 470, Intel ® Core i7, 3.40GHz, RAM 4 GB, Windows 7
16. Documentos relacionados
  
  Ficus crassinervia (amate dulce) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)
  
  Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).
  
  Ficus crassinervia (amate dulce) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)
  
  Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)
  
  Página de enciclovida para Ficus crassinervia a nivel de especie
  
  Enlace por idcatalogo 29828ANGIO en http://enciclovida.mx/especies/
Calidad de la información
1. Precisión de los atributos no espaciales
2. Consistencia lógica
  Gabinete
3. Cobertura del tema
  Se revisó la base de datos y se obtuvieron los registros de Ficus crassinervia, a los cuales, se les aplicó una prueba de aleatoriedad utilizando R (R Development Core Team, 2012), es decir, si los registros se distribuye espacialmente al azar. Si los registros cumplen con esta prueba, estos son divididos al azar en 75% para desarrollar el modelo y 25% para validarlo. De lo contrario si los registros se distribuyen de forma agregada, se realiza un análisis de patrones utilizando Ilwis 3.4, para obtener la distancia en donde los registros ya no están auto correlacionados. A partir de la distancia obtenida en Ilwis, se hizo una cuadricula en Quantum GIS 1.7.4, para hacer una selección aleatoria de un registro por celda, que sirvieron para desarrollar el modelo; mientras que los registros no seleccionados se utilizó el 25% de ellos para validar el modelo. Para elaborar el dato geográfico de la distribución de la especie se utilizaron tanto los registros de la selección aleatoria como el 25% restantes de los registros, junto con 15 variables ambientales no autocorrelacionadas obtenidas de Worldclim. Como región de referencia (M) se utilizaron las provincias bióticas en las que se ha colectado la especie, así como en las que es posible su presencia con base en afinidad climática, ecológica y/o biogeográfica: Oaxaquense, Pacifiquense, Campechano-Petenense, Yucatanense, Chiapasense, Veracruzense, Sierra Madre Sureña, Sierra Madre Occidentalense, Sierra Madre Orientalense, Neovolcanense, Nayaritense y Jalisqueño-Guerrerense. Estos datos se caragaron en Maxent 3.3.3 para general el modelo y posteriormente en el Sistema de Información Geográfica ArcMap 10 para realizar los distintos procesos en la elaboración del dato geográfico de distribución potencial de la especie. La validación del modelo generado se hizo con una prueba binomial, para verificar si este es mejor que uno al azar (p < 0.5)
4. Precisión de los atributos espaciales
5. Procesamiento
  Fuentes:
  
  Ferrusquía-Villafranca, I., (1990), 'Provincias Bióticas (con énfasis en criterios morfotectónicos)', Escala 1:4000000. Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto de Geografía, México, D. F. Regionalización Biogeográfica, IV.8.10. Atlas Nacional de México. Vol. II., http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/region/fisica/rmorf4mgw
  
  Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http://www.worldclim.org/
  
  A. Luna-Nieves, Ibarra-Manríquez, G., L. López-Toledo, (2015), 'Distribución potencial del género Ficus (Moraceae) en México', versión: 1, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Universidad Nacional Autónoma de México, México. Bases de datos SNIB-CONABIO proyecto No. JM037,
  Procedimientos:
  
  No aplica: A los 84 registros (georreferenciados) de la especie, se les aplicó una prueba de aleatoriedad utilizando R (R Development Core Team, 2012), debido a que no paso esta prueba, es decir, que los registros se encuentran agregados; se realizó un análisis de patrones en Ilwis 3.7, para calcular la probabilidad de 1.0 de encontrar un registro a cierta distancia donde los registros ya no están autocorrelacionados; el valor de la distancia se empleó para formar una cuadrícula en Quantum GIS 1.7.4., el programa selecciona un registro al azar de cada celda de la cuadrícula (13 registros), que sirvieron para entrenar el modelo. De los registros no seleccionados (71 registros), se procesan en ArcMap para hacer una división y sólo el 75% se empleó para validar el modelo. Se emplearon 15 variables ambientales no autocorrelacionadas. Las variables y los registros de entrenamiento se utilizaron para modelar la distribución de la especie en el programa Maxent 3.3.3e. La configuración en Maxent fue por default (Phillips y Dudik, 2008), excepto la desactivación de 'Extrapolate' y 'Do clamping' (comunicación personal T. Peterson) y el formato de salida del modelo logístico. El modelo se transformó a una capa booleana (presencia-ausencia) para esto se tomó como umbral de corte el maximum training sensitivity plus specificity, que para el caso de F. crassinervia fue de 0.418 (Peterson et al., 2007). La validación del modelo se hizo con una prueba binomial para evaluar si este es mejor que al azar (p < 0.5). El número de éxitos se obtiene cuantificando cuantos registros de validación tienen valores logísticos por arriba del umbral de corte. ROC parcial AUC 0.57-1.32 , Prueba binomial <0.01 El número de sitios mencionados en la metodología no coincide con el número de sitios en la base de datos Darwin Core.
6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
Atributos espaciales
1. Representacion espacial
2. Método de representacion espacial
  Vector
3. Información de vectores y puntos
  
  Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
  
  Tipo de objetos punto y vectores:
  
  G-polygon
  
  Número de puntos o vectores:
  
  3215
4. Información de imágenes
Sistema de referencia
1. Sistema de coordenadas (horizontal)
  
  Geográficas:
  
  Resolución de la latitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Resolución de la longitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Unidades de las coordenadas Geográficas:
  
  Decimal degrees
  
  Modelo geodésico:
  
  Datum horizontal:
  
  WGS84
  
  Elipsoide:
  
  WGS84
  
  Semieje mayor:
  
  6378137.000000
  
  Denominador del factor de achatamiento:
  
  298.257224
2. Sistema de coordenadas (vertical)

Atributos no espaciales

Descripción detallada

Nombre: FCR037DPGW.DBF

Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie

Fuente: No conocido

Atributo	Descripción	Fuente [1]	Dominio [2]	Precisión [3]
GRIDCODE	Numérico	Datos del proyecto	Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia.	-

Descripción resumida

Distribución de la información
1. Información de contacto
  
  Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica
  
  ssig@conabio.gob.mx
  
  Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
2. Nombre de referencia
  fcr037dpgw
3. Responsabilidad
  La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
4. Medios de distribución
  Digitales:
  
  ESRI Shapefile (SHP), 1.55 MB
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/fcr037dpgw.zip
  
  Google Earth (KML)
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/fcr037dpgw.kmz
  
  Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.
5. Medios de distribución especiales
6. Requisitos técnicos
  Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
7. Disponibilidad
Acerca de este documento
1. Fecha de creación o última actualización
  04-10-2015
2. Fecha de última revisión
3. Fecha de la siguiente revisión
4. Información de contacto
  
  Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica
  
  ssig@conabio.gob.mx
  
  Administrador de Metadatos
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
5. Nombre del estándar de contenido
  FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
6. Versión del estándar de contenido
  FGDC-STD-001.1-1999
7. Uso horario
8. Condiciones de acceso
9. Condiciones de uso
10. Restricciones de seguridad o privacidad
11. Extensiones

Ficus crassinervia (amate dulce) Distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

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