Linaria vulgaris (linaria común). Índice de similitud (Sifuentes de la Torre, S. I. y J. Golubov-Figueroa, 2021)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Sifuentes de la Torre, S.I., J. Golubov-Figueroa, (2021)

Palabras clave: Índice de similitud, Distribución Potencial, GBIF, Linaria vulgaris, 2021, RE001

Fecha de publicación: 27-08-2020, del metadato 12-01-2021

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Sifuentes de la Torre, S.I., J. Golubov-Figueroa, (2021). 'Linaria vulgaris (linaria común). Índice de similitud', escala: 1:19000000. Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: RE001, Extraído del Proyecto RE001: Adaptación y evaluación de riesgo utilizando métodos estandarizados para especies de plantas exóticas invasoras en México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Ciudad de México, México.
      Fecha de publicación:
      27-08-2020
      Nombre del producto:
      Linaria vulgaris (linaria común). Índice de similitud (Sifuentes de la Torre, S. I. y J. Golubov-Figueroa, 2021)
      Formato de representación geográfica:
      GEOTIFF. Formato raster Resolución(18518.50037,18518.50037) metros
      Información complementaria:
      Escala: 1:19000000
      Acceso en línea:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/metadatos/doc/html/lvu001isgw.html
    2. Descripción
      Resumen:
      Para la elaboración del mapa de similitud se utilizó el modelado de distribución potencial de la especie Linaria vulgaris, mediante modelos lineales y cuadráticos las predicciones de idoneidad del mejor modelo se extrapolaron al polígono del territorio nacional para generar el mapa final.
      Propósito:
      Producir el mapa de similitud de la especie de planta exótica invasora Linaria vulgaris.
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=RE&Numero=1
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      2019
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extensión geográfica:
      República Mexicana
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -118.5, (Este) -86.6666666666029, (Norte) 32.833333333332, (Sur) 14.499999999962
    6. Palabras clave
      Tema:
      Índice de similitud, Distribución Potencial, GBIF, Linaria vulgaris, 2021, RE001
      Lugar:
      República Mexicana
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Magnoliopsida, Lamiales, Plantaginaceae, Linaria, Linaria vulgaris, linaria común
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Global Biodiversity Information Facility'

        00000000. GBIF, 'Global Biodiversity Information Facility', Global Biodiversity Information Facility,

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Plantae: Tracheophyta: Magnoliopsida: Lamiales: Plantaginaceae: Linaria: ()

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/lvu001isgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/lvu001isgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      WALLACE v1.0.6, Qgis Desktop 2.18.13 y PC Dell, Windows 10 Pro
    16. Documentos relacionados

      Página de enciclovida para Linaria vulgaris a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 17796ANGIO en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Para la elaboración del mapa de similitud se uso como base el de distribución potencial, para el cualse obtuvo la base de datos de registros de la especie Linaria vulgaris del portal Global Biodiversity Information Facility mediante el paquete de R rgbif y gbif_issues y unique para duplicados. Se empleó el programa WALLACE (v1.0.6) en R el cual implementa análisis para el nicho de especies/modelado de distribución mediante la estimación de la respuesta de una especie al medio y que puede usarse para inferir (o hipotetizar) intervalos geográficos, idoneidad ambiental en un paisaje o requisitos de nicho con base en la máxima entropía MaxEnt; se usaron las 19 variables ambientales de WorldClim con una resolución espacial de 10 arcos de minuto (aproximadamente 20 km). Se usaron modelos lineales y cuadráticos, y las predicciones de idoneidad del mejor modelo se extrapolaron al polígono del territorio nacional para generar el mapa final.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • GBIF, (2005), 'Global Bodiversity Information Facility', Universitetsparken, Copenhagen, http://www.gbif.org/ Acceso libre y gratuito a los datos de biodiversidad, www.gbif.org/species.

      • Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A, Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolate, http://www.worldclim.org/

      • Kass, M. Jamie, G. E. Pinilla-Buitrago, B. Vilela, M. E. Aiello-Lammens, R. Muscarella, C. Merow, R. P. Anderson, (2020/06/12), 'Wallace: a flexible platform for reproducible modeling of species niches and distributions built for community expansion', versión: 1.0.6, The 'shiny' application 'wallace' is a modular platform for reproducible modeling of species niches and distributions. 'wallace' guides users through a complete analysis, from the acquisition of species occurrence and environmental data to visualizing mod, https://wallaceEcoMod.github.io

      Procedimientos:

      • No aplica: A) Obtención de las bases de datos de registros de presencia de Linaria vulgaris en Global Biodiversity Information Facility mediante el paquete de R rgbif. B) Se limpiaron los datos con gbif_issues con los parámetros bri (Basis of record invalid), ccm (Continent country), cdc (Continent derived from coordinates), conti (Continent invalid), cdiv (Coordinate invalid), cdout (Coordinate out of range), cdrep (Coordinate reprojected), cdrepf (Coordinate reprojection failed), cdreps (Coordinate reprojection suspicious), cdround (Coordinate rounded), cucdmis (Country coordinate mismatch), cudc (Country derived from coordinates), cuiv (Country invalid), cum (Country mismatch), depmms (Depth min max swapped), depnn (Depth nonnumeric), depnmet (Depth not metric), depunl (Depth unlikely), elmms (Elevation min max swapped), elnn (Elevation nonnumeric), elnmet (Elevation nonmetric), elunl (Elevation unlikely), gass84 (Geodetic datum assumed WGS 84), gdativ (Geodetic datum invalid), iddativ (Geodetic datum invalid), iddatunl (Identified date unlikely), mdativ (Modified date invalid), mdatunl (Modified date unlikely), muldativ (Multimedia date invalid), muluriiv (Multimedia uri invalid), preneglat (Presumed negated latitude), preneglon (Presumed negated longitude), preswcd (Presumed swapped coordinate), rdativ (Recorded date invalid), rdatm (Recorded date mismatch), rdatunl (Recorded date unlikely), refuriiv (Reference uri invalid), txmatfuz (Taxon match fuzzy), txmathi (Taxon match higherrank), txmatnon (Taxon match none), typstativ (Type status invalid), zerocd (Zero coordínate). C) Se usó unique para duplicados, en total se usaron 5957 registros. D) Se empleó el programa WALLACE (v1.0.6) en R el cual implementa análisis para el nicho de especies/modelado de distribución mediante la estimación de la respuesta de una especie al medio y que puede usarse para inferir (o hipotetizar) intervalos geográficos, idoneidad ambiental en un paisaje o requisitos de nicho. E) Se usaron las 19 variables ambientales de WorldClim con una resolución espacial de 10 arcos de minuto (aproximadamente 20 km) debido a que la mayoría de las especies no se encuentran reportadas en México y por lo que se tuvo que usar coberturas mundiales. F) Dentro de WALLACE se usó el programa para el modelado de la distribución geográfica de las especies con base a la máxima entropía MaxEnt con una partición de datos del 50 % (entrenamiento y validación) usando k-means en dos grupos con clamping y valores default para el modelado. G) Se usaron modelos lineales y cuadráticos, y las predicciones de idoneidad del mejor modelo se extrapolaron al polígono del territorio nacional para generar los mapas finales, se desconoce las herramientas y la descripción metodológica de este proceso. Valor de AUC = 0.827696294. H) El modelo contiene los siguientes rangos de índice de similitud: nulo =0, bajo =0.01-0.199, intermedia = 0.2-0.499.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Raster
    3. Información de vectores y puntos
    4. Información de imágenes
      Tipo de objeto:
      Pixel
      Dimensiones:
      Número de filas:
      110
      Número de columnas:
      191
      Número de niveles, capas, etc.. Vertical:
      1
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: LVU001ISGW.TIF

      Definición: Representa los valores de índice de similitud para la especie.

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      Value Numérico Datos del proyecto. Índice de similitud -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales

      ssig@conabio.gob.mx

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 01 55 5004 4931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      lvu001isgw
    3. Responsabilidad
      La Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      • GeoTIFF (TIF), 1.00 MB

        http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/lvu001isgw.zip

      • Google Earth (KML)

        http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/lvu001isgw.kmz

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener sistemas compatibles con archivos de imágenes, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      12-01-2021
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 01 55 5004 4931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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