Microtus oaxacensis (metorito de Oaxaca). Distribución potencial (Escalante-Espinosa y Gámez-Tamariz, 2014)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Escalante-Espinosa, T., N. Gámez-Tamariz, (2014)

Palabras clave: 2014, JM055, MaxEnt, Microtus oaxacensis, Modelo binario de presencia/ausencia, Modelo de Distribución

Fecha de publicación: 03-09-2014, del metadato 03-09-2014

Descargas: Google Earth (KML), ESRI Shapefile (SHP), Metadatos

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Escalante-Espinosa, T., N. Gámez-Tamariz, (2014). 'Microtus oaxacensis (metorito de Oaxaca). Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. Museo de Zoología Alfonso L. Herrera, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JM055, Modelos de distribución de especies de Mamíferos y Suculentas de la Faja Volcánica Transmexicana. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). México.
      Fecha de publicación:
      03-09-2014
      Nombre del producto:
      Microtus oaxacensis (metorito de Oaxaca). Distribución potencial (Escalante-Espinosa y Gámez-Tamariz, 2014)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/moa055dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      El modelo de distribución potencial de Microtus oaxacensis proyecto JM055 Distribución de especies de Mamíferos y Suculentas de la Faja Volcánica Transmexicana, apoyado por CONABIO. El objetivo fue estimar la distribución potencial de esta especie, utilizando como datos geográficos los sitios de recolecta georreferenciados proporcionadospor el Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad de la CONABIO y variables ambientales (Tallez et al., 2011; USGCS, hidro1k, DEM, GTOPO03) a una resolución espacial de 30 arco segundos. Ambos conjuntos de datos fueron incorporados en el programa MaxEnt 3.3.3k (Phillips et al,. 2006) para generar el modelo, el cual fue importado a R (R Proyect) para eliminar las áreas con probabilidades por debajo del percentil 10 asociado a los registros utilizados en la generación del modelo.
      Propósito:
      Estimar la distribución potencial de Microtus oaxacensis
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=55
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1964-2005
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extensión geográfica:
      Centro de México, Tehuacán, República Mexicana
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -100.000885009766, (Este) -94.0011138916016, (Norte) 20.9996814727783, (Sur) 15.6415605545044
    6. Palabras clave
      Tema:
      2014, JM055, MaxEnt, Microtus oaxacensis, Modelo binario de presencia/ausencia, Modelo de Distribución
      Lugar:
      Ciudad de México, Chiapas, Guerrero, Hidalgo, México, Morelos, Oaxaca, Puebla, Querétaro, República Mexicana, Tabasco, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Mammalia, Rodentia, Cricetidae, Microtus, Microtus oaxacensis, metorito de Oaxaca, meteorito, meteoro, meteoro de tarabundí, ratón de alfalfar, tarabund vole, tarabundi vole, campanhol-de-Oaxaca
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Estado actual y relación nomenclatural de los mamíferos terrestres de México'

        20050000. Ramírez-Pulido, J., J. Arroyo-Cabrales, A. Castro-Campillo, (2005), 'Estado actual y relación nomenclatural de los mamíferos terrestres de México', Instituto de Ecología, A.C., Acta Zoológica Mexicana (nueva serie) 91: 21-82. http://www.ibiologia.unam.mx/pdf/directorio/c/cervantes/clases/masto/azm211.pdf, Jalapa, México.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Animalia: Chordata: Mammalia: Rodentia: Cricetidae: Microtus: (, , , , , , , )

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/moa055dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/moa055dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3k, R 3.0.2., Dell XPS 8500, Intel® Core i7, 3.4GHz, RAM 16.0, linux mint17
    16. Documentos relacionados

      Microtus oaxacensis (metorito de Oaxaca) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Escalante-Espinosa y Gámez-Tamariz, 2014)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

      Microtus oaxacensis (metorito de Oaxaca) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Escalante-Espinosa y Gámez-Tamariz, 2014)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Página de enciclovida para Microtus oaxacensis a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 12090MAMIF en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Se depuró la base de datos de los registros de con información georreferida de Microtus oaxacensis, generada a partir de los datos proporcionados SNIB-CONABIO, portales en línea y colecciones científicas. Se realizó una validación geográfica y nomenclatural. Las variables predictoras utilizadas para hacer la modelación provienen de cartografía digital que describe aspectos climáticos (Téllez et al., 2011) y topográficos (USGCS) del espacio. Las variables ambientales fueron seleccionadas mediante un análisis de componentes principales. Se utilizó una de las 7 regiones geográficas (M o landscape) definidas en este proyecto (Región FVT Tehuacán). Se utilizó el programa MaxEnt 3.3.3k para generar los modelos y R para realizar los distintos procesos en la elaboración del dato geográfico de distribución de la especie. Para refinar el modelo se empleó el valor de probabilidad asociado al 10% de los datos con menor valor (entrenamiento + validación interna). Se empleó el método AUC parcial como método de evaluación global del modelo.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • EROS Data Center, (2000), 'HYDRO1k Elevation Derivative Database', Escala 1:1000000. U.S. Geological Survey Earth Resources Observation and Science (EROS) Center, USA. The effort has been led by U.S.G.S. scientists in collaboration with the United Nations Environment Programme/Global Resource Information Database (UNEP/GRID) located in Sioux Falls, South Dakota., https://lta.cr.usgs.gov/HYDRO1KReadMe

      • Escalante-Espinosa, T., N. Gámez-Tamariz, (2014/09/03), 'Modelos de distribución de especies de mamíferos y suculentas de la Faja Volcánica Transmexicana', versión: 1, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México, México. Base de datos SNIB-CONABIO, proyecto No. JM055, http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=55

      • Téllez, O., M. A. Hutchinson, H. A. Nix, P. Jones, (2011), 'Desarrollo de coberturas digitales climáticas para México', Escala 1:1000000. Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo, Pachuca, Hidalgo, México. En: Sánchez-Rojas, G., Ballesteros, B.C. & N. Pavón(Eds.) Cambio Climático. Http://www.uaeh.edu.mx/investigacion/icbi/LI_EcoConserBiolo/gerardo_sanchez/2011Libro_CC.pdf, http://idrisi.uaemex.mx/index.php/ligas/geodatos/306-superficies-climaticas-para-mexico

      Procedimientos:

      • No aplica: Se obtuvo información georreferida de Microtus oaxacensis a partir de los datos proporcionados SNIB-CONABIO, portales en línea (http://gbif.org/) y colecciones científicas (Colección de mamíferos de IB UNAM; Colección Mastozológica y Colección de tejidos congelados, ambas de la Facultad de Ciencias, UNAM; Colección de mamíferos, UAM Iztapalapa; Colección de mamíferos, UAEM; Colección de mamíferos, Instituto Tecnológico de Huejutla Hgo. Se realizó la validación geográfica y nomenclatural de los registros siguiendo la propuesta por Ramírez-Pulido et al. (2005). Se obtuvo un total de 36 registros únicos. Para caracterizar ambientalmente los registros con potencial para ser incluídos en el modelo y detectar a aquellos con distribución marginal y comportamiento ambiental diferenciado se calcularon las distancias de Mahalanobis. Las variables predictoras provienen de cartografía digital que describe aspectos climáticos (Téllez et al., 2011) y topográficos (USGCS) del espacio. Las variables se seleccionaron mediante un análisis de componentes principales. Las variables utilizadas fueron: Aspect Flow Accum FlowDir bio01 bio02 bio04 bio08 bio10 bio12 bio14 bio15 bio17. Debido a que las especies seleccionadas en este proyecto describen patrones de distribución que se ajustan distintas porciones geográficas, se definieron distintas M que describieran dichas regiones a partir de polígonos regulares. La región geográfica para la elaboración del modelo (M o landcape) correspondió a la Región FVT Tehuacán y quedó delimitada por las coordenadas extremas: -100.0008791; -94.00111882, 15.49990011, 20.99968034. El modelo fue generado con el programa MaxEnt 3.3.3k (Phillips et al., 2006), utilizando los siguientes criterios: Random Seed = on, Remove duplicate presence records = off; Random test percentage =20, Regularization multiplier = 1, Replicates = 30, Replicate run type = Bootstrap, Extrapolate = off, Maximum iterations = 1000, y el resto pre-establecido. Para refinar el modelo se empleó el valor de probabilidad asociado al 10% de los datos con menor valor (entrenamiento + validación interna). Los valores de los píxeles con probabilidades menores a la del 10 percentil fueron reasignados a NA, mientras que los mayores fueron reasignados a 1. Para el modelo se calculó el valor de AUC de la ROC Parcial, tomando como umbral de error el 10% de la muestra total empleada para modelar, que en este caso fue de 3.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      434
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: MOA055DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de presencia-ausencia de la especie en números binarios (0=ausencia y 1=presencia).

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      GRIDCODE Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      moa055dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener sistemas compatibles con archivos tipo raster, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      03-09-2014
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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