Odocoileus virginianus (venado cola blanca) Distribución potencial con corte al 10 percentile training presence (Mandujano-Rodríguez et al., 2015)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Mandujano-Rodríguez, S., A. Sandoval-Comte, L. A. Escobedo-Morales, A. González-Zamora, (11/06/2015)

Palabras clave: 10 percentile training presence, 2015, binario, Distribución potencial, JM016, Modelado de nicho, Odocoileus virginianus, subespecie, venado cola blanca

Fecha de publicación: 11-06-2015, del metadato 11-06-2015

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Mandujano-Rodríguez, S., A. Sandoval-Comte, L. A. Escobedo-Morales, A. González-Zamora, (11/06/2015). 'Odocoileus virginianus (venado cola blanca). Distribución potencial con corte al 10 percentile training presence.', escala: 1:1000000. edición: 1. Instituto de Ecología A.C. Proyecto: JM016, Modelación de la distribución y abundancia de las subespecies de venado cola blanca en México: implicaciones de conservación y manejo. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). México.
      Fecha de publicación:
      11-06-2015
      Nombre del producto:
      Odocoileus virginianus (venado cola blanca) Distribución potencial con corte al 10 percentile training presence (Mandujano-Rodríguez et al., 2015)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/ovic10016dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      El mapa muestra la distribución potencial del venado cola blanca (O. virginianus) en México, utilizando como umbral de corte el 10 percentile training presence. El modelo se generó con MaxEnt y variables climáticas seleccionadas a partir de WorldClim e HydroK.
      Propósito:
      Modelar la distribución potencial del venado cola blanca (Odocoileus virginianus) para México utilizando como umbral de corte el 10 percentile training presence.
      Información suplementaria:
      Del número de sitios utilizados para modelar, (1) se encuentran fuera del modelo Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=16
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1800-2011
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extensión geográfica:
      República Mexicana
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -115.040267944336, (Este) -86.7402572631836, (Norte) 32.504222869873, (Sur) 14.5542192459106
    6. Palabras clave
      Tema:
      10 percentile training presence, 2015, binario, Distribución potencial, JM016, Modelado de nicho, Odocoileus virginianus, subespecie, venado cola blanca
      Lugar:
      Aguascalientes, Baja California, Campeche, Coahuila de Zaragoza, Colima, Chiapas, Chihuahua, Distrito Federal, Durango, Guanajuato, Guerrero, Hidalgo, Jalisco, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Nayarit, Nuevo León, Oaxaca, Puebla, Querétaro de Arteaga, Quintana Roo, República Mexicana, San Luis Potosí, Sinaloa, Sonora, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Yucatán, Zacatecas
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Mammalia, Artiodactyla, Cervidae, Odocoileus, Odocoileus virginianus, venado cola blanca, cariac, venado de campo, venado de cola blanca, venado de llano, venado real
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Mammal Species of the World. A Taxonomic and Geographic Reference (3rd ed)'

        20050000. Wilson, D. E., Reeder, D. M. (editors), (2005), 'Mammal Species of the World. A Taxonomic and Geographic Reference (3rd ed)', Johns Hopkins University, (Available from Johns Hopkins University Press, 1-800-537-5487 or (410) 516-6900, or at http://www.press.jhu.edu),

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Animalia: Chordata: Mammalia: Artiodactyla: Cervidae: Odocoileus: (, , , , , )

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/ovic10016dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/ovic10016dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3k, Arc Map 10, ArcView 3.2, Dell Vostro 470, Intel® Core i7, 3.40GHz, RAM 6.0, Windows 7 Pro Service Pack 1, 64 bits
    16. Documentos relacionados

      Odocoileus virginianus (venado cola blanca) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Mandujano-Rodríguez et al., 2015)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

      Odocoileus virginianus (venado cola blanca) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Mandujano-Rodríguez et al., 2015)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Página de enciclovida para Odocoileus virginianus a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 12496MAMIF en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      1) Se compilaron 2, 203 registros de presencia de Odocoileus virginianus de distintas fuentes; 2) Utilizando ENMTools se eliminaron los registros geográficamente dependientes para evitar correlación y redundancia de la información, resultando 901 registros independientes;3) A partir de WorldClim e HydroK se seleccionaron 13 variables climáticas por medio de un análisis de correlación de Pearson; 4) Se modeló la distribución potencial utilizando MaxEnt 3.3.3. utilizando los 901 registros geográficamente independientes y las 13 variables climáticas seleccionadas, usando como región de modelado M todo el país. Se generaron 10 réplicas. 5) Cada replica se convirtió en un mapa binario definiendo como umbral de corte el '10 percentile training presence'. 6) Con el programa ArcMap 10 se sumaron las 10 réplicas (binarias) obteniéndo un mapa consenso. El mapa consenso se convirtió a binario utilizando como umbral de corte a partir de la coincidencia de los10 modelos, es decir, se consideró como distribución potencial aquellos pixeles en los que coincidieran todos los modelos. 7) Se evaluó el desempeño del modelo utilizando AUC promedio de las 10 replicas.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Mandujano-Rodríguez, S., A. Sandoval-Comte, (2015), 'Modelación de la distribución y abundancia de las subespecies de venado cola blanca en México: implicaciones de conservación y manejo', versión: 1, Instituto de Ecología A.C, México. Bases de datos SNIB-CONABIO proyecto No. JM016,

      • Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http://www.worldclim.org/

      • EROS Data Center, (2000), 'HYDRO1k Elevation Derivative Database', Escala 1:1000000. U.S. Geological Survey Earth Resources Observation and Science (EROS) Center, USA. The effort has been led by U.S.G.S. scientists in collaboration with the United Nations Environment Programme/Global Resource Information Database (UNEP/GRID) located in Sioux Falls, South Dakota., http://eros.usgs.gov/#/Find_Data/Products_and_Data_Available/gtopo30/hydro https://lta.cr.usgs.gov/HYDRO1KReadMe

      • Phillips, S., R. Anderson, R. Schapire, M. Dudick, 'Maxent software for species habitat modeling', versión: 3.3.3 K, Princeton University and The Center of Biodiversity and Conservation, American Museum of natural History, USA. - Steven J. Phillips, Miroslav Dudík, Robert E. Schapire. A maximum entropy approach to species distribution modeling. In Proceedings of the Twenty-First International Conference on Machine Learning, pages 655-662, 2004. https://www.cs.princeton.edu/~schapire/papers/maxent_icml.pdf - Steven J. Phillips, Robert P. Anderson, Robert E. Schapire. Maximum entropy modeling of species geographic distributions. Ecological Modelling, 190:231-259, 2006. (datasets used in this paper are available below) http://www.cs.princeton.edu/~schapire/papers/ecolmod.pdf - Jane Elith, Steven J. Phillips, Trevor Hastie, Miroslav Dudík, Yung En Chee, Colin J. Yates. A statistical explanation of MaxEnt for ecologists. Diversity and Distributions, 17:43-57, 2011. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1472-4642.2010.00725.x/pdf, http://www.cs.princeton.edu/~schapire/maxent/

      Procedimientos:

      • No aplica: Los 2, 203 registros de Odocoileus virginianus obtenidos de distintas fuentes fueron cuidadosamente depurados taxonómica y geográficamente. Se eliminaron los registros geográficamente dependientes (a menos de 5 km de distancia) utilizando ENMTools. Como resultado de este proceso se obtuvieron 901 registros independientes. El modelo se generó en el programa MaxEnt 3.3.3 utilizando como variables predictoras 13 capas abióticas a una resolución de 30 arco-segundos obtenidas a partir de WorldClim (bio_2, bio_3, bio_7, bio_8, bio_9, bio_10, bio_11, bio_15, bio_16, bio_17, bio_18, vbio_19) e HydroK (alt). Estas variables se seleccionaron de la siguiente manera: a partir de cada par de variables que tuviera una correlación (Pearson) mayor al 75%, se selección aquella que, de acuerdo con la literatura fuera más importantes para la especie. El programa se corrió utilizando el modo automático, indicando 10 réplicas con el 25% de los registros para poner a prueba el modelo y con un remuestreo aleatorio de los puntos de presencia con el método de bootstrap. Para la trasformación de cada replica de logístico a binario se utilizó como umbral de corte el 'mínimum training presence' y en ArcMap 10 se sumaron las réplicas, considerando como áreas de distribución potencial, aquellas en donde todas las réplicas (10) ya en formato binario (presencia/ausencia) predecían la presencia de la especie. Finalmente, se evaluó el desempeño del modelo utilizando AUC promedio de las replicas obteniéndose un valor de 0.916. El modelo se generó con registros a nivel de especie y de las siguientes subespecies. Odocoileus virginianus acapulcensis Odocoileus virginianus carminis Odocoileus virginianus couesi Odocoileus virginianus macrourus Odocoileus virginianus mexicanus Odocoileus virginianus miquihuanensis Odocoileus virginianus nelsoni Odocoileus virginianus oaxacensis Odocoileus virginianus sinaloae Odocoileus virginianus texanus Odocoileus virginianus thomasi Odocoileus virginianus toltecus Odocoileus virginianus truei Odocoileus virginianus veraecrucis Odocoileus virginianus yucatanensis

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      1209
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: OVIC10016DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      GRIDCODE Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      ovic10016dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info, Arcview o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      11-06-2015
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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