Pogonomyrmex barbatus (hormiga cosechadora roja). Distribución potencial (Córdoba-Aguilar y Rocha-Ortega, 2022)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Córdoba-Aguilar, A., M. Rocha-Ortega, (2022)

Palabras clave: Pogonomyrmex barbatus, 2022, hormigas, modelo de distribución, nicho ecológico, RE003

Fecha de publicación: 22-11-2022, del metadato 22-11-2022

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Córdoba-Aguilar, A., M. Rocha-Ortega, (2022). 'Pogonomyrmex barbatus (hormiga cosechadora roja). Distribución potencial', escala: 1:5000000. edición: 1. Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: RE003, Modelado de la distribución potencial de las hormigas de México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO).. Ciudad de México, México.
      Fecha de publicación:
      22-11-2022
      Nombre del producto:
      Pogonomyrmex barbatus (hormiga cosechadora roja). Distribución potencial (Córdoba-Aguilar y Rocha-Ortega, 2022)
      Formato de representación geográfica:
      GEOTIFF. Formato raster Resolución(55555.55,55555.55) metros
      Información complementaria:
      Escala: 1:5000000
      Acceso en línea:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/metadatos/doc/html/pbarr003dpgw.html
    2. Descripción
      Resumen:
      El modelo de distribución potencial de Pogonomyrmex barbatus se elaboró como parte del proyecto RE003 Modelado de la distribución potencial de las hormigas de México. El modelo se generó con el programa MaxEnt (Phillips et al., 2006), a partir de los registros de distribución de la especie obtenidos de Dáttilo et al., 2019 para México y de AntWeb para el resto de América (www.antweb.org); las 15 variables climáticas de WorldClim (Fick y Hijmans, 2017), la variable de elevación (Jarvis et al., 2008), la variable de producción primaria bruta (Li y Xiao, 2019) y las variables de gravimetría del suelo y pH del suelo (Wieder et al., 2014). Para definir la región a modelar se usó las ecorregiones del mundo (Olson et al., 2004). Como resultado, se obtuvo un modelo en formato IMG, el cual, mediante ArcGIS Desktop 10.6 se transformó a formato GeoTIFF con un sistema de coordenadas geográficas.
      Propósito:
      Generar el modelo de distribución potencial de Pogonomyrmex barbatus
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=RE&Numero=3
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      2022
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extensión geográfica:
      Norteamérica, República Mexicana y Centroamérica
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -119.55, (Este) -86.25, (Norte) 43.3, (Sur) 15.05
    6. Palabras clave
      Tema:
      Pogonomyrmex barbatus, 2022, hormigas, modelo de distribución, nicho ecológico, RE003
      Lugar:
      Aguascalientes, Baja California, Baja California Sur, Campeche, Ciudad de México, Coahuila de Zaragoza, Colima, Chiapas, Chihuahua, Durango, Guanajuato, Guerrero, Hidalgo, Jalisco, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Nayarit, Nuevo León, Oaxaca, Puebla, Querétaro, Quintana Roo, San Luis Potosí, Sinaloa, Sonora, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Zacatecas, Belice, Estados Unidos de América, Guatemala
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Insecta, Hymenoptera, Formicidae, Pogonomyrmex, Pogonomyrmex barbatus, hormiga cosechadora roja
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Catálogo de autoridades taxonómicas de especies de flora y fauna con distribución en México'

        20230000. CONABIO (comp.), (2023), 'Catálogo de autoridades taxonómicas de especies de flora y fauna con distribución en México', Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, Validador de taxonomía SNIB-CONABIO, México. Consultado [21/12/2023] en https://www.snib.mx/taxonomia/urlTaxonomia/?id=252865HYMEN, México.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Animalia: Arthropoda: Insecta: Hymenoptera: Formicidae: Pogonomyrmex: ()

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/pbarr003dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/pbarr003dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3k, ArcGIS Desktop 10.6, Windows
    16. Documentos relacionados

      Pogonomyrmex barbatus (hormiga cosechadora roja). Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Córdoba-Aguilar y Rocha-Ortega, 2022)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Pogonomyrmex barbatus (hormiga cosechadora roja). Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Córdoba-Aguilar y Rocha-Ortega, 2022)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

      Página de enciclovida para Pogonomyrmex barbatus a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 32795HYMEN en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Los registros de presencia de la especie Pogonomyrmex barbatus, se obtuvo de Dáttilo et al. 2019 para México y de AntWeb (www.antweb.org) para el resto de América, ambas fuentes son revisadas por expertos taxónomos. Para delimitar el área a modelar, se definió una región de referencia M generando un polígono mínimo convexo alrededor de los puntos de entrenamiento, el cual, se usó para seleccionar las ecorregiones (Olson et al. 2004) que caen dentro de esta extensión. Para genera el modelo, se utilizaron 15 variables climáticas obtenidas de WorldClim (Fick y Hijmans, 2017) a una resolución espacial de aproximadamente 0.05°, no se consideraron las variables bio8, bio9, bio18 y bio19. Las principales razones por las que se eligieron estas variables son: a) la cobertura es mundial; b) es un recurso libre y gratuito; c) tienen un sentido biológico, es decir, pueden utilizarse como factores limitantes a la hora de explicar las distribuciones de los organismos; d) son variables que tienen una influencia directa sobre la distribución de las hormigas (Rocha-Ortega and García-Martínez 2018). Para la modelación, calibración y validación, se usó el algoritmo MaxEnt dentro de la plataforma de acceso libre R, usando el paquete SDM (Naimi y Araújo, 2016). El rendimiento de los modelos se evaluó utilizando la estadística de True Skill Statistics (TSS).
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Jarvis, A., H. I. Reuter, A. Nelson, E. Guevara, (2008), 'Hole-filled SRTM for the globe', versión: 4, available from the CGIAR-CSI SRTM 90m Database (http://srtm.csi.cgiar.org)., https://cgiarcsi.community/data/srtm-90m-digital-elevation-database-v4-1/

      • Li, X., J. Xiao, (2019), 'Mapping photosynthesis solely from solar-induced chlorophyll fluorescence: A global, fine-resolution dataset of gross primary production derived from OCO-2', Remote Sensing, Volumen 11(21), 2563; https://doi.org/10.3390/rs11212563, https://globalecology.unh.edu/data/GOSIF-GPP.html

      • Córdoba-Aguilar, A., M. Rocha-Ortega, (2023), 'Modelado de la distribución potencial de las hormigas de México', versión: 1, Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México, México. Bases de datos SNIB-CONABIO, Proyecto No. RE003, http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=RE&Numero=3

      • Wieder, W. R., J. Boehnert, G. B. Bonan, M. Langseth, (2014), 'Regridded harmonized world soil databse', versión: 1.2, Data set. Available on-line [http://daac.ornl.gov] from Oak Ridge National Laboratory Distributed Active Archive Center, Oak Ridge, Tennessee, USA. https://doi.org/10.3334/ORNLDAAC/1247, https://daac.ornl.gov/SOILS/guides/HWSD.html

      • Olson, D. M., E. Dinerstein, E. D. Wikramanayake, N. D. Burgess, G. V. N. Powell, E. C. Underwood, J. A. D'Amico, I. Itoua, H. E. Strand, J. C. Morrison, C. J. Loucks, T. F. Allnutt, T. H. Ricketts, Y. Kura, J. F. Lamoreux, W. W. Wettengel, P. Hedao, K. R. Kassem, (2004), 'Terrestrial Ecoregions of the World', versión: 2.0, World Wildlife Fund - US, Washington, DC, EE. UU.. Para más información, consultar: Olson, D. M., Dinerstein, E., Wikramanayake, E. D., Burgess, N. D., Powell, G. V. N., Underwood, E. C., D'Amico, J. A., Itoua, I., Strand, H. E., Morrison, J. C., Loucks, C. J., Allnutt, T. F., Ricketts, T. H., Kura, Y., Lamoreux, J. F., Wettengel, W. W., Hedao, P., Kassem, K. R. 2001. Terrestrial ecoregions of the world: a new map of life on Earth. Bioscience 51(11):933-938., https://www.worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world

      • Fick, S. E, R. J. Hijmans, (2017), 'WorldClim 2: new 1km spatial resolution climate surfaces for global land areas', versión: 2.1, International Journal of Climatology, Volumen 37 (12): 4302-4315. https://doi.org/10.1002/joc.5086, https://www.worldclim.org/data/worldclim21.html

      Procedimientos:

      • No aplica: i) Procesamiento de los datos de presencia y/o ausencias. Los registros de presencia de la especie, fueron depurados eliminando los registros duplicados, no georreferenciados, con georreferencias con menos de 2 decimales y con coordenadas (0,0). También, para evitar la autocorrelación espacial se eliminaron los registros que estaban a menos de 1 km de distancia empleando la función thin_data en el entorno R y posteriormente, para reducir la aglomeración de registros, se realizó una depuración eliminando los registros que estaban a menos de 30 kilómetros, y si la aglomeración continuaba se probó con distancias de: 50, 80 ó 100 km. Quedando así, un total de 93 registros de presencia que se usaron para correr el modelo. ii) Procesamiento de datos ambientales: Se definió una región de referencia M para delimitar el área a modelar, para ello, se generó un polígono mínimo convexo alrededor de los puntos de presencia y usando el mapa de las ecorregiones del mundo (Olson et al. 2004) seleccionando las siguientes:Northern Mesoamerican Pacific mangroves Sinaloan dry forests San Lucan xeric scrub Veracruz moist forests Sierra de la Laguna dry forests Trans-Mexican Volcanic Belt pine-oak forests Mesoamerican Gulf-Caribbean mangroves Oaxacan montane forests Sierra de la Laguna pine-oak forests Balsas dry forests Sierra Madre del Sur pine-oak forests Jalisco dry forests Tehuacán Valley matorral Veracruz montane forests BajÃ-o dry forests Veracruz dry forests Petén-Veracruz moist forests Sierra Madre de Oaxaca pine-oak forests Southern Pacific dry forests Sierra Madre Occidental pine-oak forests Sierra Madre Oriental pine-oak forests East Central Texas forests Chihuahuan desert Edwards Plateau savanna Sonoran-Sinaloan transition subtropical dry forest Gulf of California xeric scrub Sonoran desert Arizona Mountains forests Tamaulipan matorral Western short grasslands Colorado Rockies forests Central forest-grasslands transition Central and Southern mixed grasslands Colorado Plateau shrublands Mojave desert Piney Woods forests California coastal sage and chaparral Texas blackland prairies Sierra Juarez and San Pedro Martir pine-oak forests Baja California desert Western Gulf coastal grasslands Tamaulipan mezquital Meseta Central matorral Central Mexican matorral para recortar las variables ambientales. Se utilizaron 15 variables ambientales obtenidas de WorldClim (Fick y Hijmans, 2017) a una resolución de aproximadamente 0.05 °. Con las variables recortadas, se realizó un análisis de correlación para usar en la modelación únicamente las variables no correlacionadas, se consideró un umbral de r > 0.8. Las variables ambientales seleccionadas como predictoras son: bio1, bio2, bio3, bio5, bio7, bio13, bio14, bio15, bio20, bio21, bio22, bio23, mismas que usaron para general el modelo de distribución potencial de la especie. iii) Calibración del modelo. Para llevar a cabo la modelación, calibración y validación de los modelos se usó como algoritmo de modelación MaxEnt con los parámetros por defecto y se corrió utilizando el paquete de sdm (Naimi y Araújo 2016) en el entorno R; se dividieron los registros de presencia en 75% para entrenar el modelo y 25% para realizar una validación independiente. iv) Validación y transferencia del modelo: Para evaluar el desempeño del modelo se utilizó el True Skill Statistics (TSS) con un valor de0.452. Finalmente, para fines de publicación, el mapa en formato IMG se transformó a formato GeoTIFF con un sistema de coordenadas geográficas usando ArcGIS Desktop 10.6. El valor de la tasa de omisión para este modelo es de 0.036.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Raster
    3. Información de vectores y puntos
    4. Información de imágenes
      Tipo de objeto:
      Pixel
      Dimensiones:
      Número de filas:
      565
      Número de columnas:
      666
      Número de niveles, capas, etc.. Vertical:
      1
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: PBARR003DPGW.TIF

      Definición: Describe los campos contenidos en el mapa

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      VALUE Numérico Datos del proyecto Los valores cercanos a 1 indican condiciones favorables para la presencia de la especie, valores cercanos a 0 indican condiciones no favorables para la especie. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales

      ssig@conabio.gob.mx

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 01 55 5004 4931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      pbarr003dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      • GeoTIFF (TIF), 1.00 MB

        http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/pbarr003dpgw.zip

      • Google Earth (KML)

        http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/pbarr003dpgw.kmz

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener sistemas compatibles con archivos raster, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      22-11-2022
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 01 55 5004 4931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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