Phaseolus coccineus (silvestre). Incertidumbre en los cambios de la distribución potencial futura del frijol (2015-2039) con escenario de emisión extremo RCP 8.5 (Cuervo-Robayo et. al., 2018)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Cuervo-Robayo, A. P., J. M. Barrios, S. Gama-López, E. Martínez-Meyer, A. Delgado-Salinas, C. Enríquez-García, M. Jiménez-Cruz, (2018)

Palabras clave: 2018, agrobiodiversidad, cambio climático, distribución, extrapolación, frijol, incertidumbre, JE014, moderado, Phaseolus coccineus, silvestre

Fecha de publicación: 28-03-2018, del metadato 26-03-2018

Descargas: Google Earth (KML), ESRI Shapefile (SHP), Metadatos

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Cuervo-Robayo, A. P., J. M. Barrios, S. Gama-López, E. Martínez-Meyer, A. Delgado-Salinas, C. Enríquez-García, M. Jiménez-Cruz, (2018). 'Phaseolus coccineus (silvestre). Incertidumbre en los cambios de la distribución potencial futura del frijol (2015-2039) con escenario de emisión extremo RCP 8.5', escala: 1:1000000. edición: 1. Instituto de Biología - Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JE014, El género Phaseolus (Leguminosae, Papilionoideae, Phaseoleae) para México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Ciudad de México, México.
      Fecha de publicación:
      28-03-2018
      Nombre del producto:
      Phaseolus coccineus (silvestre). Incertidumbre en los cambios de la distribución potencial futura del frijol (2015-2039) con escenario de emisión extremo RCP 8.5 (Cuervo-Robayo et. al., 2018)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Acceso en línea:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/metadatos/doc/html/pcosidpfc85gw.html
    2. Descripción
      Resumen:
      El mapa de incertidumbre se generó a partir del modelo de cambios en la distribución potencial futura de frijol Phaseolus coccineus (silvestre), período (2015-2039) con escenario extremo (RCP 8.5)', y otro modelo de cambio en la distribución potencial futura de la especie elaborado con el mismo proceso que el modelo anterior, solo que esta vez no se activó la opción de extrapolación; posteriormente, se aplicó un geoproceso para obtener la diferencia entre ambos modelos el cual dio como resultado el mapa de incertidumbre, en formato shapefile con un sistema de coordenadas geograficas.
      Propósito:
      Obtener la superficie de incertidumbre en el modelo de cambios de distribución potencial futuro cercano extremo del frijol, Phaseolus coccineus (silvestre).
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JE&Numero=14
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      No aplica
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extensión geográfica:
      Republica Mexicana
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -100.9833334, (Este) -95.74166675, (Norte) 20.39892598, (Sur) 16.06559266
    6. Palabras clave
      Tema:
      2018, agrobiodiversidad, cambio climático, distribución, extrapolación, frijol, incertidumbre, JE014, moderado, Phaseolus coccineus, silvestre
      Lugar:
      Guanajuato, México, Michoacán de Ocampo, Oaxaca, Puebla, Querétaro de Arteaga
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Magnoliopsida, Fabales, Fabaceae, Phaseolus, Phaseolus coccineus, ayocote, tecómari, botil, frijolón, patola
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Phylogeny of the genus Phaseolus (Leguminosae): a recent diversification in an ancient landscape'

        20060000. Delgado-Salinas, A., R. Bibler, M. Lavin, (2006), 'Phylogeny of the genus Phaseolus (Leguminosae): a recent diversification in an ancient landscape', The American Society of Plant Taxonomists, Syst. Bot. 31(4): 779-791,

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Plantae: Magnoliophyta: Magnoliopsida: Fabales: Fabaceae: Phaseolus: (, , , , )

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/pcosidpfc85gw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/pcosidpfc85gw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      SIG ArcView, Windows
    16. Documentos relacionados

      Página de enciclovida para Phaseolus coccineus a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 50241ANGIO en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Para elaborar el mapa de incertidumbre se generaron dos modelos de Cambios en la distribución potencial futura de frijol Phaseolus coccineus (silvestre), período (2015-2039) con escenario de emisión extremo (RCP 8.5), en uno se aplicó la opción de extrapolación y en el otro no. Posteriormente, se aplicó un geoprocesamiento para obtener la diferencia entre ambos modelos el cual dio como resultado el mapa de incertidumbre.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Cuervo-Robayo, A. P., J. M. Barrios, S. Gama-López, E. Martínez-Meyer, A. Delgado-Salinas, (2018), 'Phaseolus coccineus (silvestre). Cambio en la distribución potencial futura del frijol (2015-2039) con escenario de emisión extremo RCP 8.5', Escala 1:1000000. versión: 1, Instituto de Biología - Universidad Nacional Autónoma de México., Ciudad de México, México.

      Procedimientos:

      • No aplica: Para generar el mapa de incertidumbre en los cambios de la distribución potencial futura del frijol Phaseolus coccineus (silvestre), período (2015-2039) con escenario de emisión extremo (RCP 8.5). se generaron dos modelos con escenario futuro cercano extremo, siguiendo el mismo proceso que a continuación se describe. Únicamente, para uno de ellos se activó la opción de extrapolación y al otro no. 1.-Se utilizó 535 registros de presencia de la especie contenidos en la base del proyecto JE014. 2.-Variables bioclimáticas del presente (1960-2000) con un tamaño de celda de 1 km² de Cuervo-Robayo 2015. 3.-Variables bioclimáticas del futuro del modelo REA (Reliability Ensemble Averaging), correspondiente al horizonte futuro cercano (2015-2039), con forzamiento radiativo: escenario extremo de emisiones (RCP 8.5) y tamaño de celda de 50 km² generados por Cavazos et al. 2013. Estas variables se descargaron de la página http://atlasclimatico.unam.mx/AECC_descargas/ en formato *TIF y se ajustaron a un tamaño de celda de 1 km² aplicando procesos estadísticos por Cuervo-Robayo 2015. 4.- Para seleccionar las variables bioclimáticas del presente, se aplicó la prueba de Pearson (correlación menor a 0.8 p) mediante el programa de uso libre R (R Core Team 2017), con la función corSelect de la biblioteca fussySim (Barbosa et al. 2015). Para esta especie se eligieron las siguientes variables no correlacionadas: bio01, bio02, bio03, bio5, bio12, bio14, bio15, bio18 y bio19. 5.-El área a modelar fue definida a partir de la selección de las ecorregiones terrestres de Olson et al. 2001, en los cuales se ubicaron los registros de presencia de la especie según la distribución natural de la especie, dicha área quedo conformado por las siguientes ecorregiones: Desierto de Baja California (Baja California desert), Bosques secos del Bajío (Bajío dry forests), Bosques de pino-encino de Centro América (Central American pine-oak forests), Matorral del Centro de México (Central Mexican matorral), Bosques de la Depresión Central de Chiapas (Chiapas Depression dry forests), Bosques montanos de Chiapas/ bosque de niebla o bosque mesófilo de montaña (Chiapas montane forests, Jalisco dry forests), Matorral central del Altiplano (Meseta Central matorral), Bosques montanos de Oaxaca/ bosque de niebla o bosque mesófilo de montaña (Oaxacan montane forests), Bosques húmedos del Petén y Veracruz (Petén-Veracruz moist forests), Bosques húmedos de la Sierra Madre de Chiapas (Sierra Madre de Chiapas moist forests), Bosques de pino-encino de la Sierra Madre de Oaxaca (Sierra Madre de Oaxaca pine-oak forests), Bosques de pino-encino de la Sierra Madre del Sur (Sierra Madre del Sur pine-oak forests), Bosques de pino-encino de la Sierra Madre Occidental (Sierra Madre Occidental pine-oak forests), Bosques de pino-encino de la Sierra Madre Oriental (Sierra Madre Oriental pine-oak forests), Bosques secos de Sinaloa (Sinaloan dry forests), Bosques secos del Pacífico Sur (Southern Pacific dry forests), Matorral del Valle de Tehuacán (Tehuacán Valley matorral), Bosques de pino-encino de la Faja Volcánica Transmexicana (Trans-Mexican Volcanic Belt pine-oak forests), Bosques húmedos de Veracruz (Veracruz moist forests), Bosques montanos de Veracruz/ bosque de niebla o bosque mesófilo de montaña (Veracruz montane forests). Esta región definida se utilizó como mascara para recortar las variables seleccionadas para la modelación. 6.-Como algoritmo de modelación se utilizó MaxEnt (versión 3.3.3 k), el cual fue parametrizado para cada especie con la biblioteca de ENMeval (Muscarrella et al. 2016) para identificar las características de ajuste y el multiplicador de regularización del modelo. Para esta especie fueron: Lineal (L), Cuadrática (Q), Hinge (H) y Producto (P) y Umbral (T) 1 respectivamente. Se usaron 535 registros de presencia para entrenar el modelo y 230 para validar. El desempeño del modelo se evaluó con el 30 % del total de registros, a través de la prueba del área bajo la curva (AUC, acrónimo en inglés) con un valor de AUC de 0.898. 7.- Como resultado, se obtuvo un mapa de la distribución potencial presente y otro de distribución potencial futura, ambos modelos de valores continuos. Los dos modelos se transformaron a binarios utilizando como umbral de corte el valor del décimo percentil de los datos de presencia utilizados en la modelación, el modelo de la distribución potencial presente se reclasificó a valores de 0 y 1 mientras que el modelo de la distribución potencial futura a valores de 0 y 10, esto con el propósito de que al sumarlos fuera posible identificar las áreas de distribución potencial estable, de ganancia y de pérdida ante escenarios de cambio climático. El resultado final es un mapa (modelo), el cual contiene valores de: 0 (ausencia), 1 (perdida), 10 (ganancia) y 11 (estabilidad) de la distribución potencial de la especie. 8.-Una vez que se obtienen los dos modelos con escenario futuro cercano moderado (uno con extrapolación y otro sin extrapolación), se aplicó un geoproceso para obtener la diferencia entre ambos modelos, por lo tanto, la cobertura de incertidumbre corresponde a las zonas donde el algoritmo hace extrapolación. Finalmente, el modelo resultante se transformó a formato vectorial (shapefile).

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      96
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: PCOSIDPFC85GW.DBF

      Definición: Describe los campos contenidos en el mapa

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      layer Numérico Datos del proyecto Indica la superficie de incertidumbre -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales

      ssig@conabio.gob.mx

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 01 55 5004 4931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      pcosidpfc85gw
    3. Responsabilidad
      La Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener sistemas compatibles con archivos Shapefile, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      26-03-2018
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 01 55 5004 4931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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