Peromyscus maniculatus (ratón norteamericano) Distribución Potencial en México (Sánchez-Cordero et al., 2020)

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Información de identificación
1. Referencia
  
  Información de referencia:
  
  Autor:
  
  Sánchez-Cordero, V., P. Rodríguez, N. Moreno-Almeraya, M. Jiménez-Cruz, (2020). 'Peromyscus maniculatus (ratón norteamericano). Distribución Potencial en México', escala: 1:1000000. edición: 1. Instituto de Biología, UNAM. Proyecto: JM040, Modelado de la distribución potencial de especies de mamíferos reservorios y vectores de tres zoonosis emergentes en México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Ciudad de México, México.
  
  Fecha de publicación:
  
  27-05-2020
  
  Nombre del producto:
  
  Peromyscus maniculatus (ratón norteamericano) Distribución Potencial en México (Sánchez-Cordero et al., 2020)
  
  Formato de representación geográfica:
  
  GEOTIFF. Formato raster Resolución(925.92,925.92) metros
  
  Información complementaria:
  
  Escala: 1:1000000
  
  Acceso en línea:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/metadatos/doc/html/pma040dpgw.html
2. Descripción
  
  Resumen:
  
  El modelo de la distribución potencial de Peromyscus maniculatus se elaboró como parte del proyecto JM040 'Modelado de la distribución potencial de especies de mamíferos reservorios y vectores de tres zoonosis emergentes en México'. Se generó con Maxent a partir de datos de presencia obtenidos del GBIF, 19 variables climáticas de WordlClim y 3 variables topográficas de HYDRO1K. El área de accesibilidad ('M') se eligió utilizando las eco-regiones de la WWF. Se evaluó el desempeño del modelo utilizando el AUC de la ROC completa. Si bien esta especie se distribuye en las islas San Jerónimo en Baja California y San Roque en Baja California Sur; estas no fueron consideradas en la modelación ya que las variables climáticas no las incluyen.
  
  Propósito:
  
  Estimar la distribución potencial de Peromyscus maniculatus en México.
  
  Información suplementaria:
  
  Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JE&Numero=40
3. Periodo de validez de los datos
  
  Fecha y hora:
  
  No aplica
  
  Vigencia:
  
  1800-2015
4. Estado de la información
  
  Progreso:
  
  Terminado
  
  Mantenimiento:
  
  No planeado
5. Dominio espacial
  
  Descripción de la extensión geográfica:
  
  República Mexicana, Belice, El Salvador, Estados Unidos de América, Guatemala, Honduras, Nicaragua
  
  Coordenadas extremas:
  
  (Oeste) -117.29760457302, (Este) -85.22260277682, (Norte) 32.7161509419469, (Sur) 12.7161498219469
6. Palabras clave
  
  Tema:
  
  split taxonómico, 2020, JM040, Mamíferos, Mapas de distribución, Modelos de distribución, Nicho ecológico, Peromyscus maniculatus, Peromyscus maniculatus assimilis, Peromyscus maniculatus blandus, Peromyscus maniculatus coolidgei, Peromyscus maniculatus dorsalis, Peromyscus maniculatus exiguus, Peromyscus maniculatus fulvus, Peromyscus maniculatus gambelii, Peromyscus maniculatus geronimensis, Peromyscus maniculatus labecula, Peromyscus maniculatus magdalenae, Peromyscus maniculatus margaritae, Peromyscus maniculatus rufinus, Peromyscus maniculatus sonoriensis, Roedores
  
  Lugar:
  
  Aguascalientes, Baja California, Baja California Sur, Belice, Campeche, Chiapas, Chihuahua, Ciudad de México, Coahuila de Zaragoza, Colima, Durango, El Salvador, Estados Unidos de América, Guanajuato, Guatemala, Guerrero, Hidalgo, Honduras, Jalisco, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Nayarit, Nicaragua, Nuevo León, Oaxaca, Puebla, Querétaro, Quintana Roo, República Mexicana, San Luis Potosí, Sinaloa, Sonora, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Zacatecas
7. Taxonomía
  Palabras clave:
  
  Tema: Mammalia, Rodentia, Cricetidae, Peromyscus, Peromyscus maniculatus, deermouse, ratón de campo, ratón norteamericano, ratón venado
  
  Sistema taxonómico:
  
  Clasificación:
  
  Fuente:
  
  'Catálogo de autoridades taxonómicas de especies de flora y fauna con distribución en México.'
  
  20190000. CONABIO (comp.), (2019), 'Catálogo de autoridades taxonómicas de especies de flora y fauna con distribución en México.', Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, Base de datos SNIB-CONABIO. http://www.enciclovida.mx/, México.
  
  Procedimiento taxonómico: split Taxón sin distribución en México | De acuerdo con Bradley et al. (2019) Peromyscus maniculatus subsp. gambelii, Peromyscus maniculatus subsp. sonoriensis y Peromyscus maniculatus subsp. labecula se reconocen como especies: P. gambelii (Son. BC, BCS), P. sonoriensis (Son.), P. labecula (Son., Chih., Tam., Ver., Oax.) y P. maniculatus (Canadá, E.U.A.).
  
  Cobertura taxonómica:
  
  No conocido
  
  Clasificación:
  
  Animalia: Chordata: Mammalia: Rodentia: Cricetidae: Peromyscus: Peromyscus maniculatus (deermouse, ratón de campo, ratón norteamericano, ratón venado)
8. Herramienta de análisis
9. Condiciones de acceso
  Sin restricciones
10. Condiciones de uso
  Importante:
  
  Se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
11. Contacto
12. Vista previa
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/pma040dpgw
  
  Descripción:
  
  171 x 132 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/pma040dpgw
  
  Descripción:
  
  1002 x 774 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
13. Créditos y reconocimientos
14. Restricciones de uso
15. Sistema nativo
  MaxEnt 3.3.3k, ArcGIS Desktop 10.6, DELL Optiplex 9020, Windows
16. Documentos relacionados
  
  Página de enciclovida para Peromyscus maniculatus a nivel de especie
  
  Enlace por idcatalogo 11882MAMIF en http://enciclovida.mx/especies/
  
  Peromyscus maniculatus (ratón norteamericano) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial en México (Sánchez-Cordero et al., 2020)
  
  Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).
  
  Peromyscus maniculatus (ratón norteamericano) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial en México (Sánchez-Cordero et al., 2020)
  
  Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)
Calidad de la información
1. Precisión de los atributos no espaciales
2. Consistencia lógica
  Gabinete
3. Cobertura del tema
  Se generó una base de datos de sitios ocurrencia en México de las especies de roedores, obtenidos de GBIF (Global Environmental Facility). Se realizó un proceso de control de calidad de los datos de aspectos taxonómicos y geográficos. Los modelos se generaron con el programa MaxEnt 3.3.3k (Phillips et al, 2006). Se utilizaron las localidades únicas de cada especie y variables climáticas de WordlClim (http://www.worldclim.org/) y topográficas (https://lta.cr.usgs.gov/HYDRO1K). El área de accesibilidad ('M') se eligió para cada especie, utilizando las eco-regiones de la WWF (Olson et al. 2001). Se evaluó el desempeño del modelo utilizando el AUC de la ROC (Narayani, 2008). Al mapa resultante, se le realizó una edición a posteriori siguiendo los límites políticos administrativos al norte del país, para ello se utilizó ArcGIS Desktop 10.3. Si bien esta especie se distribuye en las islas San Jerónimo en Baja California y San Roque en Baja California Sur; estas no fueron consideradas en la modelación ya que las variables climáticas no las incluyen.
4. Precisión de los atributos espaciales
5. Procesamiento
  Fuentes:
  
  Olson, D. M., E. Dinerstein, E. D. Wikramanayake, N. D. Burgess, G. V. N. Powell, E. C. Underwood, J. A. D'Amico, I. Itoua, H. E. Strand, J. C. Morrison, C. J. Loucks, T. F. Allnutt, T. H. Ricketts, Y. Kura, J. F. Lamoreux, W. W. Wettengel, P. Hedao, K. R. Kassem, (2014), 'Terrestrial Ecoregions of the World (TEOW)', versión: 1, World Wildlife Fund, Washington, DC. La información sobre los métodos usados para generar las capas de Ecorregiones Terrestres del Mundo se pueden consultar en: Olson, D. M., Dinerstein, E., Wikramanayake, E. D., Burgess, N. D., Powell, G. V. N., Underwood, E. C., D'Amico, J. A., Itoua, I., , http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world
  
  Hijmans, R. J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolate, http://www.worldclim.org/
  
  modelo digital de elevacion, (2000), 'HYDRO1k Elevation Derivative Database', U.S. Geological Survey Earth Resources Observation and Science (EROS) Center, USA. The effort has been led by U.S.G.S. scientists in collaboration with the United Nations Environment Programme/Global Resource Information Database (UNEP/GRID) located in Sioux Falls, South Dakota., https://lta.cr.usgs.gov/HYDRO1KReadMe
  
  Sánchez-Cordero, V., Gutiérrez-Granados, A. Rodríguez-Moreno, (2020), 'Modelado de la distribución potencial de especies de mamíferos reservorios y vectores de tres zoonosis emergentes en México', versión: 1, Instituto de Biología, Universidad Nacional Atónoma de México, Ciudad de México, México. Base de datos_Rodentia SNIB-CONABIO, proyecto No. JM040, http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=40
  Procedimientos:
  
  No aplica: Se generó una base de datos de sitios de ocurrencia en México de la especie Peromyscus maniculatus obtenidos de GBIF (Global Environmental Facility). Se realizó un detallado proceso de control de calidad tanto de la parte taxonómica, como de la parte geográfica. Se eliminaron datos redundantes, duplicados, inconsistentes y sin información útil para la generación del modelo. Se obtuvieron 1834 registros de localidades únicas. Para definir el área de accesibilidad (M) se seleccionaron aquellas eco-regiones en las que se tenía al menos un registro de presencia, y las que, de acuerdo con el conocimiento del experto, podrían ser parte de la distribución de la especie. La 'M' quedó conformada por las siguientes eco-regiones: Arizona Mountains forests, Baja California desert, Bajío dry forests, Balsas dry forests, Belizian pine forests, California Central Valley grasslands, California coastal sage and chaparral, California interior chaparral and woodlands, California montane chaparral and woodlands, Central American Atlantic moist forests, Central American dry forests, Central American montane forests, Central American pine-oak forests, Central and Southern mixed grasslands, Central Mexican matorral, Chiapas Depression dry forests, Chiapas montane forests, Chihuahuan desert, Chimalapas montane forests, Colorado Plateau shrublands, Colorado Rockies forests, East Central Texas forests, Eastern Cascades forests, Edwards Plateau savanna, Great Basin montane forests, Great Basin shrub steppe, Gulf of California xeric scrub, Jalisco dry forests, Klamath-Siskiyou forests, Meseta Central matorral, Mesoamerican Gulf-Caribbean mangroves, Mojave desert, Motagua Valley thornscrub, Nebraska Sand Hills mixed grasslands, Northern California coastal forests, Northern Mesoamerican Pacific mangroves, Northern short grasslands, Oaxacan montane forests, Pantanos de Centla, Petén-Veracruz moist forests, San Lucan xeric scrub, Sierra de la Laguna dry forests, Sierra de la Laguna pine-oak forests, Sierra de los Tuxtlas, Sierra Juarez and San Pedro Martir pine-oak forests, Sierra Madre de Chiapas moist forests, Sierra Madre de Oaxaca pine-oak forests, Sierra Madre del Sur pine-oak forests, Sierra Madre Occidental pine-oak forests, Sierra Madre Oriental pine-oak forests, Sierra Nevada forests, Sinaloan dry forests, Snake-Columbia shrub steppe, Sonoran-Sinaloan transition subtropical dry forest, Sonoran desert, South Central Rockies forests, Southern Mesoamerican Pacific mangroves, Southern Pacific dry forests, Tamaulipan matorral, Tamaulipan mezquital, Tehuacán Valley matorral, Texas blackland prairies, Trans-Mexican Volcanic Belt pine-oak forests, Veracruz dry forests, Veracruz moist forests, Veracruz montane forests, Wasatch and Uinta montane forests, Western Gulf coastal grasslands, Western short grasslands, Wyoming Basin shrub steppe, Yucatán moist forests. Las variables predictoras se seleccionaron a partir de un análisis de correlación de Pearson realizado entre las 19 variables de Worldclim (http://www.worldclim.org/) y las variables topográficas, altitud, pendiente y orientación (https://lta.cr.usgs.gov/HYDRO1K). Para este proceso se utilizó el paquete fuzzySim que se corrió en R (R Core Team 2015. ISBN 3-900051-07-0XX). Las variables seleccionadas fueron: aspect, bio_1, bio_14, bio_15, bio_19, bio_2, bio_3, bio_7, bio_8 y pendiente. Se usó el programa MaxEnt 3.3.3k (Phillips et al., 2006). Se seleccionó el tipo de salida 'logistic' y se mantuvieron los parámetros establecidos por default. Se activó 'Create response curves', 'Do jacknife to measure variable importance', 'Random seed', 'Add all samples to background' y 'Write plot data'. Se desactivó: 'Write clamp grid when projecting', 'Do MESS analysis when projecting', 'Extrapolatre' y 'Do clamping'. Se utilizó el 75 % de los registros para entrenamiento y el 25 % para validación (Random test percentage). Se corrieron 10 réplicas y se utilizó el método 'Bootstrap' para hacer el re-muestreo. El valor de AUC de la ROC resultó de: 0.8934 (training) y 0.8834 (test), lo que indica que es un buen modelo. Al mapa resultante, se le realizó una edición a posteriori siguiendo los límites políticos administrativos al norte del país, para ello se utilizó ArcGIS Desktop 10.3. El modelo se generó con registros a nivel de especie y de las siguientes subespecies: Peromyscus maniculatus assimilis, Peromyscus maniculatus blandus, Peromyscus maniculatus coolidgei, Peromyscus maniculatus dorsalis, Peromyscus maniculatus exiguus, Peromyscus maniculatus fulvus, Peromyscus maniculatus gambelii, Peromyscus maniculatus geronimensis, Peromyscus maniculatus labecula, Peromyscus maniculatus magdalenae, Peromyscus maniculatus margaritae, Peromyscus maniculatus rufinus y Peromyscus maniculatus sonoriensis.
6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
Atributos espaciales
1. Representacion espacial
2. Método de representacion espacial
  Raster
3. Información de vectores y puntos
4. Información de imágenes
  
  Tipo de objeto:
  
  Pixel
  
  Dimensiones:
  
  Número de filas:
  
  2400
  
  Número de columnas:
  
  3849
  
  Número de niveles, capas, etc.. Vertical:
  
  1
Sistema de referencia
1. Sistema de coordenadas (horizontal)
  
  Geográficas:
  
  Resolución de la latitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Resolución de la longitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Unidades de las coordenadas Geográficas:
  
  Decimal degrees
  
  Modelo geodésico:
  
  Datum horizontal:
  
  WGS84
  
  Elipsoide:
  
  WGS84
  
  Semieje mayor:
  
  6378137.000000
  
  Denominador del factor de achatamiento:
  
  298.257224
2. Sistema de coordenadas (vertical)

Atributos no espaciales

Descripción detallada

Nombre: PMA040DPGW.TIF

Definición: Describe los campos contenidos en el mapa

Fuente: No conocido

Atributo	Descripción	Fuente [1]	Dominio [2]	Precisión [3]
Value	Numérico	Datos del proyecto	Los valores cercanos a 1 indican condiciones favorables para la presencia de la especie, valores cercanos a 0 indican condiciones no favorables para la especie.	-

Descripción resumida

Distribución de la información
1. Información de contacto
  
  Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales
  
  ssig@conabio.gob.mx
  
  Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México
  
  Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 01 55 5004 4931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
2. Nombre de referencia
  pma040dpgw
3. Responsabilidad
  La Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
4. Medios de distribución
  Digitales:
  
  GeoTIFF (TIF), 10.8 MB
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/pma040dpgw.zip
  
  Google Earth (KML)
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/pma040dpgw.kmz
  
  Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.
5. Medios de distribución especiales
6. Requisitos técnicos
  Tener sistemas compatibles con archivos raster, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
7. Disponibilidad
Acerca de este documento
1. Fecha de creación o última actualización
  27-05-2020
2. Fecha de última revisión
3. Fecha de la siguiente revisión
4. Información de contacto
  
  Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales
  
  ssig@conabio.gob.mx
  
  Administrador de Metadatos
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México
  
  Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 01 55 5004 4931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
5. Nombre del estándar de contenido
  FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
6. Versión del estándar de contenido
  FGDC-STD-001.1-1999
7. Uso horario
8. Condiciones de acceso
9. Condiciones de uso
10. Restricciones de seguridad o privacidad
11. Extensiones

Peromyscus maniculatus (ratón norteamericano) Distribución Potencial en México (Sánchez-Cordero et al., 2020)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

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