Specklinia segregatifolia Distribución potencial (Damon y Bertolini, 2014)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: V. Bertolini, Damon-Beale, A. A., (2014)

Palabras clave: Distribución potencial, JM061, MaxEnt, Orchidaceae, Specklinia segregatifolia, Superficie probabilidad

Fecha de publicación: 15-07-2013, del metadato 26-02-2014

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      V. Bertolini, Damon-Beale, A. A., (2014). 'Specklinia segregatifolia. Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. El Colegio de la Frontera Sur, Unidad Tapachula. Proyecto: JM061, Modelación de la distribución geográfica de las orquídeas del Soconusco. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO).. Tapachula, Chiapas, México.
      Fecha de publicación:
      15-07-2013
      Nombre del producto:
      Specklinia segregatifolia Distribución potencial (Damon y Bertolini, 2014)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/sse061dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      El modelo estima la distribución del nicho ambiental de la especie Specklinia segregatifolia, generado a través de 'Minimum training presence' de Maxent. Por lo tanto tiene información binaria de presencia/ausencia del nicho ambiental, abarcando desde el centro de México hasta el norte de Colombia.
      Propósito:
      Estimar la distribución potencial de Specklinia segregatifolia
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=JM&Numero=061
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1946-2012
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extensión geográfica:
      República Mexicana y Centroamérica
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -97.163459777832, (Este) -79.8801116943359, (Norte) 19.130708694458, (Sur) 7.20570659637451
    6. Palabras clave
      Tema:
      Distribución potencial, JM061, MaxEnt, Orchidaceae, Specklinia segregatifolia, Superficie probabilidad
      Lugar:
      Veracruz de Ignacio de la Llave, Tabasco, República de Guatemala, Quintana Roo, Puebla, Panamá, Oaxaca, Nicaragua, Honduras, El Salvador, Chiapas, Costa Rica, Campeche, Belize, República Mexicana
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Liliopsida, Orchidales, Orchidaceae, Specklinia, Specklinia segregatifolia
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.'

        19810000. Cronquist, A., (1981), 'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.', Columbia University Press., New York, Estados Unidos.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Plantae: Magnoliophyta: Liliopsida: Orchidales: Orchidaceae: Specklinia:

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/sse061dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/sse061dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3k, ArcView 3.2, ArchMap 10, Divas-Gis, Dell Vostro 470, Intel® Core i7-3770 CPU @, 3.4GHz, RAM 6.0 GB, Windows 7
    16. Documentos relacionados
  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      1) Se integró una base de datos a partir de datos de distintas fuentes de información, datos propios, datos obtenidos vía electrónica, datos proporcionados por el SNIB, y datos recopilados de distintos herbarios de Centroamérica y Colombia. 2) Los datos se revisaron exhaustivamente en términos de su distribución geográfica y nomenclatura. 3) Se definió una región de referencia M basada en las 'Ecorregiones Terrestres Mundiales' (http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world), y quedó conformada por las eco-regiones con presencia de registros de esta especie; 4) Se generaron los datos geográficos de las ocho capas bioclimáticas seleccionadas de WorldClim (Hijmans et al. 2005). 5) Se modeló la distribución geográfica utilizando MaxEnt 3.3.3k. (Phillips et al. 2006); 6) La calidad de los modelos se evaluó considerando la estimación del área bajo la curva (AUC) ROC, aplicado a 'test data' y 'training data'; 7) El modelo obtenido se transformó en un mapa booleano (presencia/ausencia) a partir del 'Minimum training presence'.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Olson, D. M., E. Dinerstein, E. D. Wikramanayake, N. D. Burgess, G. V. N. Powell, E. C. Underwood, J. A. D'Amico, I. Itoua, H. E. Strand, C. J. Loucks, J. C. Morrison, T. F. Allnutt, T. H. Ricketts, Y. Kura, J. F. Lamoreux, W. W. Wettengel, P. Hedao, K. R. Kassem, (2001), 'Terrestrial Ecoregions of the World (TEOW)', 2.0, World Wildlife Fund, La información sobre los métodos usados para generar las capas de Ecorregiones Terrestres del Mundo se pueden consultar en: Olson, D. M., Dinerstein, E., Wikramanayake, E. D., Burgess, N. D., Powell, G. V. N., Underwood, E. C., D'Amico, J. A., Itoua, I., Strand, H. E., Morrison, J. C., Loucks, C. J., Allnutt, T. F., Ricketts, T. H., Kura, Y., Lamoreux, J. F., Wettengel, W. W., Hedao, P., Kassem, K. R. 2001. Terrestrial ecoregions of the world: a new map of life on Earth. Bioscience 51(11):933-938., http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world, Washington, D. C..

      • V. Bertolini, Damon, A, (2015), 'Modelación de la distribución geográfica de las Orchidaceae del Soconusco', 1, Unidad Tapachula, El Colegio de la Frontera Sur, Tapachula, Chiapas, México.

      • Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. 1.4, WorldClim, Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http://www.worldclim.org/, University of California, Berkeley. U.S.A..

      Procedimientos:

      • No aplica: 1) Se integró una base de datos a partir de información del grupo de investigación 'Ecología y cultivo sustentable de las orquídeas del Soconusco'(Departamento de Conservación de la Biodiversidad de ECOSUR), de datos proporcionados por el Sistema Nacional de Información de Biodiversidad (SNIB - CONABIO), datos obtenidos vía electrónica del Herbario Nacional de México (MEXU), Missouri Botanical Garden (MOBOT) y el Colegio de la Frontera Sur, unidad Tapachula (ECOSUR-T) y de datos recopilados de distintos herbarios de Centroamérica y Colombia; 2) Los datos se revisaron exhaustivamente y se identificaron registros mal ubicados, geográficamente incongruentes, o cuyos coordenadas no coincidieron con la descripción del sitio; 3) Se definió una región de referencia M basada en las 'Ecoregiones Terrestres Mundiales' (http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world), que quedó conformada por las siguientes eco-regiones (OBJECTID): 1281, 1368, 284, 752, 1360, 940, 1008, 1030, 1185, 1203. 4) Se generaron los datos geográficos de las ocho capas bioclimáticas seleccionadas a partir de las capas climáticas de WorldClim (Hijmans et al. 2005) con el molde M: Annual Mean Temperature, Temperature Seasonality (standard deviation *100), Max Temperature of Warmest Month, Min Temperature of Coldest Month, Annual Precipitation, Precipitation of Wettest Month. Precipitation of Driest Month, Precipitation Seasonality (Coefficient of Variation); 5) Se incorporaron los datos geográficos de distribución de la especie y las variables climáticas al programa MaxEnt 3.3.3k (Phillips et al. 2006). En la ventana de abertura del software Maxent, se seleccionaron las opciones pre-establecidas, además de activar la función de 'create reponse curves' y de 'Do jacknife to measure variable importance'. Abriendo la ventana de Setting/Basic, se activó la función 'Random seed' y se asignó el valor de 25% a la función de 'Random test percentage'. En la ventana de Setting/Advanced, se activó el 'Minimum training presence' de 'Apply threshold rule'. Se utilizó el 25 % de los datos para entrenamiento del modelo (total de registros: 20) y el restante 75 % para validación; 6) La calidad de los modelos se evaluó considerando la estimación del área bajo la curva (AUC) ROC, aplicado a 'test data' y 'training data' que resultó de 0.982 y 0.927, respectivamente.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      1671
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: SSE061DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      Value Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Jose Manuel Davila Rosas

      jdavila@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      sse061dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subdirección de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      26-02-2014
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Estrella Cruz Reyes

      ecruz@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 4963 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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