Cucumis sativus (pepino) Distribución potencial (Lira-Saade et al. 2018)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Lira-Saade, R., L. J. Sosa-Guzmán, I.V. Cabral-Soto, O. Téllez-Valdés, (2018)

Palabras clave: rastreras, JM003, 2018, postradas, familia de las calabazas, modelos de distribución, nicho ecológico, mapas de distribución, Cucumis sativus

Fecha de publicación: 07-11-2017, del metadato 07-11-2017

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Lira-Saade, R., L. J. Sosa-Guzmán, I.V. Cabral-Soto, O. Téllez-Valdés, (2018). 'Cucumis sativus (pepino). Distribución potencial.', escala: 1:1000000. edición: 1. Facultad de Estudios Superiores Iztacala, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JM003, Distribución potencial de las especies silvestres de la familia Cucurbitaceae de México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO).. Ciudad de México, Mexico.
      Fecha de publicación:
      07-11-2017
      Nombre del producto:
      Cucumis sativus (pepino) Distribución potencial (Lira-Saade et al. 2018)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/csa003dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      El modelo de idoneidad de la distribución potencial de Cucumis sativus se elaboró como parte del proyecto JM003 ' Distribución potencial de las especies silvestres de la familia Cucurbitaceae de México'. Este se generó por medio de una rutina escrita para el entorno de programación R 2.15.2. Esta rutina utiliza recortes regionales en formato raster que corresponden a la M de la especie que son los registros de la distribución actual conocida de la especie y que fueron obtenidos de distintas fuentes, entre estas el Sistema de Información sobre la Biodiversidad (SNIB) de CONABIO, colecciones de herbarios, literatura especializada y trabajo de campo, y 19 variables climáticas a una resolución espacial de 1 km cuadrado. Los modelos fueron generados con el programa MaxEnt BlackBox. El modelo resultante este en formato ASCII Grid, con un sistema de coordenadas geográficas.
      Propósito:
      Estimar la distribución potencial de Cucumis sativus
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=JM&Numero=003
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1900 - 1994
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extención geográfica:
      Trópico de México, Península de Yucatán, Belize, República de El Salvador, República de Guatemala, República de Honduras y Estados Unidos de América
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -109.770004272461, (Este) -86.3376007080078, (Norte) 27.0411491394043, (Sur) 14.0999994277954
    6. Palabras clave
      Tema:
      rastreras, JM003, 2018, postradas, familia de las calabazas, modelos de distribución, nicho ecológico, mapas de distribución, Cucumis sativus
      Lugar:
      Aguascalientes, Baja California Sur, Campeche, Coahuila de Zaragoza, Colima, Chiapas, Chihuahua, Distrito Federal, Durango, Guanajuato, Guerrero, Hidalgo, Jalisco, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Nayarit, Nuevo León, Oaxaca, Puebla, Querétaro de Arteaga, Quintana Roo, San Luis Potosí, Sinaloa, Sonora, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Yucatán, Zacatecas, Trópico de México, Península de Yucatán, Belize, República de El Salvador, República de Guatemala, República de Honduras, Estados Unidos de América, República Mexicana
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Magnoliopsida, Violales, Cucurbitaceae, Cucumis, Cucumis sativus, pepino, bi-toni-castilla, pi-toni, No conocido
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.'

        19810000. Cronquist, A., (1981), 'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.', Columbia University Press., New York, Estados Unidos.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Plantae: Magnoliophyta: Magnoliopsida: Violales: Cucurbitaceae: Cucumis: (, , , )

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/csa003dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/csa003dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3a, ArcView 3.1, Dell XPS 8500, Intel® Core i7, 3.4GHz, RAM 16.0, Windows 7 Pro Service Pack 1, 64 bits
    16. Documentos relacionados
  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Se depuró la base de datos de los registros de la ubicación de Cucumis sativus obtenido de distintas fuentes, entre estas el Sistema de Información sobre la Biodiversidad (SNIB) de CONABIO, colecciones de herbarios, trabajo de campo y literatura especializada para elaborar el dato geográfico de la distribución de la especie. Se utilizaron las 19 variables climáticas de Cuervo-Robayo et al. (2013). Se utilizó el programa MaxEnt blackbox para generar los modelos y el Sistema de Información Geográfica ArcView 3.1 para realizar los distintos procesos en la elaboración del dato geográfico de distribución potencial de la especie. La región geográfica o M se definió con base en la regionalización de Provincias Bióticas (con énfasis en criterios morfotectónicos) Ferrusquía-Villafranca (1990). En algunos casos, de acuerdo con la localización de los sitios, las provincias fueron recortadas para ajustar la M. Para evaluar el desempeño de los modelos se utilizó el método AUC total.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Cuervo-Robayo A. P., O. Téllez-Valdés, M. Gómez, C. Venegas-Barrera, J. Manjarrez, E. Martínez-Meyer, (2013), 'An update of high-resolution monthly climate surfaces for Mexico', 34, International Journal of Climatology, Volume 34, Issue 7 https://doi.org/10.1002/joc.3848, http://idrisi.uaemex.mx/distribucion/superficies-climaticas-para-mexico,

      • Ferrusquía-Villafranca, I., (1990), 'Provincias Bióticas (con énfasis en criterios morfotectónicos)', Escala 1:4000000. Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto de Geografía, En: Regionalización Biogeográfica. Tomo II, Sección IV, 8.10. Atlas Nacional de México (1990-1992). Instituto de Geografía, UNAM. México, http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/rmorf4mgw.zip, México, D.F..

      • Lira-Saade, R., L. J. Sosa-Guzmán, I.V. Cabral-Soto, O. Téllez-Valdés, (2018), 'Distribución potencial de las especies silvestres de la familia Cucurbitaceae de México', 1, Facultad de Estudios Superiores Iztacala, Universidad Nacional Autónoma de México, Base de datos SNIB-CONABIO, Proyecto No. JM003, http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=JM&Numero=3, Ciudad de México, México.

      Procedimientos:

      • No aplica: Se revisó y depuró la base de datos con la ubicación geográfica de la especie, para evaluar la consistencia de la distribución y la nomenclatura taxonómica. Se elaboró un dato geográfico de la distribución de la especie en formato shapefile, representada por puntos. Se delimitó el área (M) con base en las Provincias Bióticas (con énfasis en criterios morfotectónicos) Ferrusquía-Villafranca (1990) utilizando los sitios de ocurrencia, quedando definida por las siguientes coordenadas extremas: -109.77 oeste, -86.337604 este, 27.041149 norte, 14.1 sur (Se ajustó a la latitud del Trópico de Cáncer). En seguida, se incorporaron los datos geográficos de la distribución de la especie (13 sitios de ocurrencia) en formato .csv o .txt y las variables climáticas al programa MaxEnt en formato ASCII GRID, para generar el modelo de distribución geográfica. Los parámetros del programa que fueron modificados en la elaboración del dato geográfico fueron: tipo de salida, logístico; porcentaje de puntos de entrenamiento, 90%; porcentaje de puntos de prueba: 10%; selección de localidades únicas, no; selección de la opción Clamping, no; extrapolación, no; iteraciones, 1500; y versión del programa, 3.3.3 blackbox. Finalmente, el archivo tipo ASCII generado por el programa MaxEnt fue importando al programa ArcView 3.1 y convertido a formato GRID de ArcInfo. Las variables que se utilizaron para el modelo son: temperatura promedio anual, estacionalidad de la temperatura, oscilación diurna de la temperatura, temperatura promedio de los tres meses más lluviosos, temperatura promedio de los tres meses más fríos, precipitación anual, precipitación del periodo más seco, estacionalidad de la precipitación, precipitación de los tres meses más cálidos, precipitación de los tres meses más fríos. Se empleó el método AUC total como método de evaluación global del modelo con un valor para entrenamiento de 0.979 y de prueba de 0.952. El punto de corte que se propone para los modelos es donde la especificidad y la sensibilidad de los datos de prueba son iguales (Liu et al. 2005), dando un valor de 0.787.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      825
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: CSA003DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie.

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      GRIDCODE Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Jose Manuel Davila Rosas

      jdavila@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      csa003dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subdirección de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info, Arcview o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      07-11-2017
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Laura Herrera

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 4963 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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