Coccoloba uvifera (uva de mar) Distribución potencial usando GARP, en la región costera del Golfo de México y mar Caribe (Mendoza-González et al. 2014)

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Información de identificación
1. Referencia
  
  Información de referencia:
  
  Autor:
  
  Mendoza-González, G., M. L. Martínez, O. Rojas-Soto, I. Arias-Del Razo, (2014). 'Coccoloba uvifera (uva de mar). Distribución potencial usando GARP, en la región costera del Golfo de México y mar Caribe', escala: 1:1000000. edición: 1. Instituto de Ecología A. C. Proyecto: JM027, Patrones de distribución de la vegetación costera en el Golfo de México y mar Caribe. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). México, D. F.
  
  Fecha de publicación:
  
  29-05-2014
  
  Nombre del producto:
  
  Coccoloba uvifera (uva de mar) Distribución potencial usando GARP, en la región costera del Golfo de México y mar Caribe (Mendoza-González et al. 2014)
  
  Formato de representación geográfica:
  
  Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
  
  Información complementaria:
  
  Escala: 1:1000000
  
  Acceso en línea:
  
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/cuv027dpggw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
2. Descripción
  
  Resumen:
  
  El modelo de distribución potencial de Coccoloba uvifera, se elaboró dentro del proyecto JM027 Patrones de distribución de la vegetación costera en el Golfo de México y mar Caribe, apoyado por CONABIO. El objetivo fue estimar la distribución potencial de esta especie, utilizando como datos geográficos los registros obtenidos del Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad de CONABIO (SNIB) y del Herbario del Instituto de Ecología, A.C. (IE-XAL). Se utilizaron 19 variables climáticas obtenidas del Global Climate Data (WorldClim) a una resolución espacial de 1km cuadrado. Para generar el modelo utilizamos el software Desktop GARP Ver 1.1.6. Posteriormente realizamos el consenso de los diez mejores modelos en el programa ArcView 3.2.
  
  Propósito:
  
  Estimar la distribución potencial de Coccoloba uvifera
  
  Información suplementaria:
  
  Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=27
3. Periodo de validez de los datos
  
  Fecha y hora:
  
  No aplica
  
  Vigencia:
  
  1953 - 2005
4. Estado de la información
  
  Progreso:
  
  Terminado
  
  Mantenimiento:
  
  No planeado
5. Dominio espacial
  
  Descripción de la extención geográfica:
  
  Costa de Golfo de México y mar Caribe
  
  Coordenadas extremas:
  
  (Oeste) -98.0200653076172, (Este) -86.7121734619141, (Norte) 26.5506210327148, (Sur) 17.5009822845459
6. Palabras clave
  
  Tema:
  
  2014, Distribución potencial, Ecología, vegetación de duna costera, GARP, Modelo, JM027, Coccoloba uvifera
  
  Lugar:
  
  Golfo de México, Belize, Estados Unidos de América, República Mexicana, Tamaulipas, Veracruz de Ignacio de la Llave, Tabasco, Campeche, Yucatán, Quintana Roo
7. Taxonomía
  Palabras clave:
  
  Tema: Magnoliopsida, Polygonales, Polygonaceae, Coccoloba, Coccoloba uvifera, uva de mar, uva de playa, carnero, manzana, roble de la costa, uvero, uvero de mar, ni' che', kiiché, baygrape, sea grape, raisinier bord de mer, choschogo, coccoloba, uva, uva cimarrona, uva de la costa.
  
  Sistema taxonómico:
  
  Clasificación:
  
  Fuente:
  
  ' Integrated Taxonomic Information System'
  
  20140000. ITIS, (2014), ' Integrated Taxonomic Information System', versión: 1, Integrated Taxonomic Information System, http://www.itis.gov.
  
  Procedimiento taxonómico: No conocido
  
  Clasificación:
  
  Plantae: Magnoliophyta: Magnoliopsida: Polygonales: Polygonaceae: Coccoloba: Coccoloba uvifera (uva de mar, uva de playa, carnero, manzana, roble de la costa, uvero, uvero de mar, ni' che', kiiché, baygrape, sea grape, raisinier bord de mer, choschogo, coccoloba, uva, uva cimarrona, uva de la costa.)
8. Herramienta de análisis
9. Condiciones de acceso
  Sin restricciones
10. Condiciones de uso
  Importante:
  
  No se permite utilizar estos datos con fines lucrativos y se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en http://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/mx/
11. Contacto
12. Vista previa
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/cuv027dpggw
  
  Descripción:
  
  171 x 132 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/cuv027dpggw
  
  Descripción:
  
  1002 x 774 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
13. Créditos y reconocimientos
14. Restricciones de uso
15. Sistema nativo
  ArcView 3.2, ArcGis 9.3, Genetic Algorithm for Rule-set Production (DesktopGARP, ver. 1.1.6) y DELL XPS 8700, Intel Corei7-4770, 3.40GHz, RAM 12.0, Windows 8 Single Language, SO 64 bits, procesador x64
16. Documentos relacionados
Calidad de la información
1. Precisión de los atributos no espaciales
2. Consistencia lógica
  Gabinete
3. Cobertura del tema
  Los mapas generados para modelar la distribución potencial de esta especie, se elaboraron a partir de la depuración de las bases de datos obtenidas del Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad de CONABIO (SNIB) y del Herbario del Instituto de Ecología, A.C. (IE-XAL). Para generar el modelo utilizamos el software Desktop GARP Ver 1.1.6. y el sistema de información geográfica ArcView 3.2 para realizar los distintos procesos en la elaboración del dato geográfico de distribución potencial de la especie. Se utilizaron las localidades únicas. Se utilizaron 19 variables climáticas obtenidas del Global Climate Data (WorldClim) a una resolución espacial de 1km cuadrado. Se definió el área geográfica de accesibilidad de la especie (M) a partir de un búfer de 10 km sobre la línea de costa; Se empleó el método AUC parcial como método de evaluación global del modelo. Se obtuvo un mapa boleano (0 y 1).
4. Precisión de los atributos espaciales
5. Procesamiento
  Fuentes:
  
  Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2000/50/19), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978., http://www.worldclim.org/
  
  ESRI, (2000), 'World Countries', Escala 1:15000000. Environmental System Research Institute, Inc., Redlands, California, USA.http://www.esri.com/.
  
  Mendoza-González, G., M. L. Martínez, O. Rojas-Soto, I. Arias-Del Razo, (2014), 'Patrones de distribución de la vegetación costera en el Golfo de México y mar Caribe', versión: 1, Instituto de Ecología A.C., México, D.F. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto No. JM027., http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=27
  Procedimientos:
  
  No aplica: Se obtuvieron y depuraron las bases de datos de CONABIO y IE-XAL. Se eliminaron los registros que no tenían ubicación geográfica, los que estaban duplicados entre las bases de datos, los que se encontraban fuera del área del interés (el Atlántico Mexicano) y los que eran inconsistentes con la distribución de la especie (registros tierra adentro o fuera del rango de su distribución), este proceso se realizó a partir de la eliminación de los registros ubicados a más de 10 km (tierra adentro) sobre la línea de costa, considerando que esta especie es costera. Debido a que varios de los registros de presencia se ubicaron en el mar, fue necesario modificar su ubicación al pixel más cercano del límite de las variables climáticas, para que formaran parte del set de datos utilizados en el modelado, porque son puntos correctos. Los registros de presencia con las siguientes coordenadas latitud y longitud: -97.364528 20.987766, -90.444678 20.704023, -90.443490 20.706581, -90.443337 20.704967, -88.314552 18.524501, -87.753549 21.527718, -87.387784 21.511801, -87.384676 21.508567, -86.782064 21.481039, -86.781231 21.478261, -86.719966 21.216966 y -86.717436 21.217329, se usaron para modelar la especie, pero no se encuentran la base DarwinCore del proyecto. Se utilizaron las 19 variables climáticas disponibles de la base de datos WorldClim. El área geográfica de accesibilidad de la especie (M) fue definida a partir de un búfer de 10 km sobre la línea de costa, dado que las dunas costeras en general no abarcan más allá de 10 km. Utilizamos el software Desktop GARP Ver 1.1.6. Para correr el modelo con las siguientes especificaciones: 128 puntos para generar el modelo y 30 para validarlo (81% entrenamiento y 19% validación), elaborando 500 modelos; 0.01 límite de convergencia; 1000 iteraciones max; Best subsets; error de omisión intrínseco; umbral de omisión duro con el 10% de omisión; 20 modelos bajo el umbral de omisión y finalmente un umbral de comisión del 50% de la distribución. Posteriormente realizamos el consenso de los diez mejores modelos en el programa ArcView 3.2. Posteriormente realizamos un mapa binario (0 -1) con un límite de corte definido por los puntos de validación coincidentes a la predicción de la presencia de la especie con una coincidencia de 7 a 10 modelos, para esta especie en el programa ArcView 3.2. Para evaluar el modelo se utilizó el análisis ROC parcial (Partial Receiver Operating Characteristic; Peterson et al. 2008). El análisis ROC parcial se llevó a cabo usando el paquete estadístico Tool for Partial ROC desarrollado por Barve (2008), donde los modelos producidos son comparados con expectativas nulas (modelos generados de manera aleatoria). Dicho paquete se configuró para realizar 1000 repeticiones y se estableció un umbral 1-E de 0.95 para el eje y (Peterson et al. 2008; Saupe et al. 2011). El valor de Ratio obtenido indica un pobre desempeño si el valor es igual o menor que uno, y un buen desempeño conforme el valor se aleja de uno y se acerca a dos. Para esta especie el valor promedio del Ratio para las 1000 iteraciones fue de 1.268 con un valor de p < 0.001.
6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
Atributos espaciales
1. Representacion espacial
2. Método de representacion espacial
  Vector
3. Información de vectores y puntos
  
  Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
  
  Tipo de objetos punto y vectores:
  
  G-polygon
  
  Número de puntos o vectores:
  
  306
4. Información de imágenes
Sistema de referencia
1. Sistema de coordenadas (horizontal)
  
  Geográficas:
  
  Resolución de la latitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Resolución de la longitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Unidades de las coordenadas Geográficas:
  
  Decimal degrees
  
  Modelo geodésico:
  
  Datum horizontal:
  
  WGS84
  
  Elipsoide:
  
  WGS84
  
  Semieje mayor:
  
  6378137.000000
  
  Denominador del factor de achatamiento:
  
  298.257224
2. Sistema de coordenadas (vertical)

Atributos no espaciales

Descripción detallada

Nombre: CUV027DPGGW.DBF

Definición: Es la base de las entidades geográficas, está constituido por campos y registros. Contiene valores de 0 (ausencia) y 1 (presencia) que indican la probabilidad de presencia de la especie.

Fuente: No conocido

Atributo	Descripción	Fuente [1]	Dominio [2]	Precisión [3]
Value	Numérico	Datos del proyecto	0 ausencia de especie, 1 presencia de la especie	-

Descripción resumida

Distribución de la información
1. Información de contacto
  
  Jose Manuel Davila Rosas
  
  jdavila@conabio.gob.mx
  
  Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
2. Nombre de referencia
  cuv027dpggw
3. Responsabilidad
  La Subdirección de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
4. Medios de distribución
  Digitales:
  
  ESRI Shapefile (SHP), 1.00 MB
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/cuv027dpggw.zip
  
  Google Earth (KML)
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/cuv027dpggw.kmz
  
  Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.
5. Medios de distribución especiales
6. Requisitos técnicos
  Tener Arc-Info, Arcview o sistemas compatibles con archivos tipo raster (Arc/Info), en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
7. Disponibilidad
Acerca de este documento
1. Fecha de creación o última actualización
  29-05-2014
2. Fecha de última revisión
3. Fecha de la siguiente revisión
4. Información de contacto
  
  Estrella Cruz Reyes
  
  ecruz@conabio.gob.mx
  
  Administrador de Metadatos
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 01 55 5004 4963 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
5. Nombre del estándar de contenido
  FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
6. Versión del estándar de contenido
  FGDC-STD-001.1-1999
7. Uso horario
8. Condiciones de acceso
9. Condiciones de uso
10. Restricciones de seguridad o privacidad
11. Extensiones

Coccoloba uvifera (uva de mar) Distribución potencial usando GARP, en la región costera del Golfo de México y mar Caribe (Mendoza-González et al. 2014)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

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