Myrtillocactus geometrizans (garambullo). Distribución potencial (Vaca, 2020)

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Información de identificación
1. Referencia
  
  Información de referencia:
  
  Autor:
  
  Vaca, R. A., (2020). 'Myrtillocactus geometrizans (garambullo). Distribución potencial', escala: 1:5000000. edición: 1. El Colegio de la Frontera Sur-Unidad San Cristóbal. Proyecto: JM052, REDDEAM: Riesgo de extinción determinado por distribución de árboles mexicanos. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Ciudad de México, México.
  
  Fecha de publicación:
  
  05-11-2020
  
  Nombre del producto:
  
  Myrtillocactus geometrizans (garambullo). Distribución potencial (Vaca, 2020)
  
  Formato de representación geográfica:
  
  Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
  
  Información complementaria:
  
  Escala: 1:5000000
  
  Acceso en línea:
  
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/mge052dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
2. Descripción
  
  Resumen:
  
  El modelo de distribución potencial de Myrtillocactus geometrizans se elaboró dentro del proyecto JM052 'REDDEAM: Riesgo de extinción determinado por distribución de árboles mexicanos'. Los modelos se generaron con el programa estadístico R, utilizando dos métodos: GAM (modelos aditivos generalizados) y RPART (Recursive Partitioning and Regression Trees), se seleccionó el que tuvo mejor desempeño (RPART). Como variable predictiva se utilizó la dinámica anual en la humedad del suelo. Los cambios en la humedad del suelo a lo largo del año están definidos por un modelo de cubeta que se elaboró en el contexto de este proyecto y que incluye las 36 variables climáticas de WorldClim. La resolución espacial del modelo es de 5 km cuadrados por pixel, con un sistema de coordenadas geográficas.
  
  Propósito:
  
  Estimar la distribución potencial de Myrtillocactus geometrizans.
  
  Información suplementaria:
  
  Dr. Raúl A. Vaca, institución de adscripción actual El Colegio de San Luis (COLSAN) Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=52 http://www.ecosur.mx/ecoconsulta/busqueda/detalles.php?id=13117&bdi=0
3. Periodo de validez de los datos
  
  Fecha y hora:
  
  No aplica
  
  Vigencia:
  
  Desconocido
4. Estado de la información
  
  Progreso:
  
  Terminado
  
  Mantenimiento:
  
  No planeado
5. Dominio espacial
  
  Descripción de la extención geográfica:
  
  México
  
  Coordenadas extremas:
  
  (Oeste) -105.333333333081, (Este) -95.3749999996196, (Norte) 25.5833333335004, (Sur) 16.0000000000435
6. Palabras clave
  
  Tema:
  
  2020, árboles, Distribución potencial, JM052, Mesoamérica, Myrtillocactus geometrizans, RPART
  
  Lugar:
  
  Aguascalientes, Ciudad de México, Coahuila de Zaragoza, Durango, Guanajuato, Guerrero, Hidalgo, Jalisco, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Nayarit, Nuevo León, Oaxaca, Puebla, Querétaro, República Mexicana, San Luis Potosí, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Zacatecas
7. Taxonomía
  Palabras clave:
  
  Tema: Equisetopsida, Caryophyllales, Cactaceae, Myrtillocactus, Myrtillocactus geometrizans, basto, bastó, baxta, bazto, biti-xoba, garambullo, garambuyo, garbancillo
  
  Sistema taxonómico:
  
  Clasificación:
  
  Fuente:
  
  'Catálogo de autoridades taxonómicas de especies de flora y fauna con distribución en México'
  
  20180000. CONABIO (comp.), (2018), 'Catálogo de autoridades taxonómicas de especies de flora y fauna con distribución en México', Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, Base de datos SNIB-CONABIO. Disponible en: http://enciclovida.mx/, México.
  
  Procedimiento taxonómico: No conocido
  
  Clasificación:
  
  Plantae: Tracheophyta: Equisetopsida: Caryophyllales: Cactaceae: Myrtillocactus: Myrtillocactus geometrizans (basto, bastó, baxta, bazto, biti-xoba, garambullo, garambuyo, garbancillo)
8. Herramienta de análisis
9. Condiciones de acceso
  Sin restricciones
10. Condiciones de uso
  Importante:
  
  Se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
11. Contacto
12. Vista previa
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/mge052dpgw
  
  Descripción:
  
  171 x 132 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/mge052dpgw
  
  Descripción:
  
  1002 x 774 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
13. Créditos y reconocimientos
14. Restricciones de uso
15. Sistema nativo
  PostgreSQL 9.3, PostGIS 2.1, pgAdmin III 1.18, R 3.1, Quantum GIS 2.2, Lenovo V470, Intel® Core™i7, 2.20GHz x 8, Ubuntu 12.04 LTS Precise Pangolin, 64 bits
16. Documentos relacionados
  
  Página de enciclovida para Myrtillocactus geometrizans a nivel de especie
  
  Enlace por idcatalogo 8005ANGIO en http://enciclovida.mx/especies/
  
  Myrtillocactus geometrizans (garambullo). Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Vaca, 2020)
  
  Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)
  
  Myrtillocactus geometrizans (garambullo). Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Vaca, 2020)
  
  Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).
Calidad de la información
1. Precisión de los atributos no espaciales
2. Consistencia lógica
  Gabinete
3. Cobertura del tema
  Se integró una base de datos con información proveniente de Global Biodiversity Information Facility (GBIF) (http://www.gbif.org/) y del Sistema Nacional de Información de Biodiversidad (SNIB) (http://www.snib.mx/). Se realizó el control de calidad de los datos utilizando el análisis de outliers con la distancia de Mahalanobis. Para definir la región a modelar (M) se utilizaron los registros de presencia de la especie, las Ecorregiones Terrestres de México (INEGI-CONABIO-INE, 2008) y Provincias biogeográficas de México (CONABIO, 1997). Para generar el modelo se utilizaron 3 variables climáticas de Worldclim, la variable Elevación del CIAT (Jarvis et al.,2008) y la variable balance hídrico del suelo basado en el Modelo de cubeta (Vaca y Golicher, 2016). Las variables climáticas se cortaron desde la mitad de Norteamérica (35° de latitud norte) hasta la mitad de Sudamérica (5° de latitud sur). Se generaron dos modelos por especie, uno utilizando GAM (Modelos Aditivos Generalizados) y otro utilizando rpart (árboles de regresión). Se seleccionó el modelo que tuvo mejor rendimiento de acuerdo con los resultados del AUC de las curvas ROC. Para validar el modelo se usaron registros registros contenidos en la base DarwinCore (30 %). Finalmente, el modelo continuo se convirtió a binario utilizando el umbral de corte 0.1885283.
4. Precisión de los atributos espaciales
5. Procesamiento
  Fuentes:
  
  Jarvis, A., H.I. Reuter, A. Nelson, E. Guevara, (2008), 'Hole-filled seamless SRTM data V4', International Centre for Tropical Agriculture, SRTM 90m DEM Digital Elevation Database, http://srtm.csi.cgiar.org
  
  Hijmans, R. J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http://www.worldclim.org/
  
  INEGI, CONABIO e INE, (2008), 'Ecorregiones Terrestres de México', Escala 1:1000000. Instituto Nacional de Estadística Geografía e Informática, Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad e Instituto Nacional de Ecología., México.http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/region/biotic/ecort08gw.
  
  CONABIO, (1997), 'Provincias biogeográficas de México.', Escala 1:4000000. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad., México, D. F.http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/region/biotic/rbiog4mgw.
  
  Vaca, R. A., (2020), ' REDDEAM: Riesgo de extinción determinado por distribución de árboles mexicanos', versión: 1, El Colegio de la Frontera Sur-Unidad San Cristóbal, Ciudad de México, México. Bases de datos SNIB-CONABIO, Proyecto No. JM052, http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=52
  
  Vaca, R. A., J. D. Golicher, (2016), 'Integración del balance hídrico en la modelación de la distribución de especies de árboles mexicanos.', Botanical Sciences, Volumen 94 (1): 25-42 DOI: 10.17129/botsci.241, https://www.botanicalsciences.com.mx/index.php/botanicalSciences/article/view/241
  Procedimientos:
  
  No aplica: 1. Se integró una base de datos con información proveniente de dos bases de datos, (1) Global Biodiversity Information Facility (GBIF) (http://www.gbif.org/) y (2) el Sistema Nacional de Información de Biodiversidad (SNIB) (http://www.snib.mx/). 2. Se realizó el control de calidad de los datos utilizando el análisis de outliers con la distancia de Mahalanobis, lo que permitió eliminar datos dudosos. Como resultado del proceso se obtuvieron 200 registros que se utilizaron para generar los modelos. 3. Para definir la región a modelar (M), se utilizaron los registros de presencia de la especie, las Ecorregiones Terrestres de México (INEGI-CONABIO-INE, 2008) y Provincias biogeográficas de México (CONABIO, 1997). La 'M' quedó conformada por aquellas ecorregiones o provincias donde al menos ocurriera un registro de la especie. 4. Para generar el modelo se utilizaron 3 variables climáticas de Worldclim: BIO12 = Annual Precipitation, BIO1 = Annual Mean Temperature y BIO7 = Temperature Annual Range de (https://www.worldclim.org/bioclim); la variable Elevación del CIAT (Jarvis et al.,2008) y la variable de Balance hídrico del suelo basado en el Modelo de cubeta (Vaca y Golicher, 2016). 5. Las variables climáticas se cortaron desde la mitad de Norteamérica (35° de latitud norte) hasta la mitad de Sudamérica (5° de latitud sur). 6. Se generaron dos modelos por especie, uno utilizando GAM (Modelos Aditivos Generalizados) y otro utilizando rpart (árboles de regresión). Se seleccionó el modelo que tuvo mejor rendimiento de acuerdo con los resultados del AUC de las curvas ROC (0.9482684). 7. Para entrenar el modelo se utilizó el 70 % de los registros contenidos en la base DarwinCore y para validarlo el 30 %. 8. Para convertir el modelo continuo en un mapa de presencia se utilizó el siguiente umbral de corte 0.1885283.
6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
Atributos espaciales
1. Representacion espacial
2. Método de representacion espacial
  Vector
3. Información de vectores y puntos
  
  Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
  
  Tipo de objetos punto y vectores:
  
  G-polygon
  
  Número de puntos o vectores:
  
  156
4. Información de imágenes
Sistema de referencia
1. Sistema de coordenadas (horizontal)
  
  Geográficas:
  
  Resolución de la latitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Resolución de la longitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Unidades de las coordenadas Geográficas:
  
  Decimal degrees
  
  Modelo geodésico:
  
  Datum horizontal:
  
  WGS84
  
  Elipsoide:
  
  WGS84
  
  Semieje mayor:
  
  6378137.000000
  
  Denominador del factor de achatamiento:
  
  298.257224
2. Sistema de coordenadas (vertical)

Atributos no espaciales

Descripción detallada

Nombre: MGE052DPGW.DBF

Definición: Describe los campos contenidos en el mapa.

Fuente: No conocido

Atributo	Descripción	Fuente [1]	Dominio [2]	Precisión [3]
GRIDCODE	Numérico	Datos de proyecto	Los valores de 1 corresponden a la presencia de la especie.	-

Descripción resumida

Distribución de la información
1. Información de contacto
  
  Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica
  
  ssig@conabio.gob.mx
  
  Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
2. Nombre de referencia
  mge052dpgw
3. Responsabilidad
  La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
4. Medios de distribución
  Digitales:
  
  ESRI Shapefile (SHP), 1.00 MB
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/mge052dpgw.zip
  
  Google Earth (KML)
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/mge052dpgw.kmz
  
  Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.
5. Medios de distribución especiales
6. Requisitos técnicos
  Tener sistemas compatibles con archivos Shapefile, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
7. Disponibilidad
Acerca de este documento
1. Fecha de creación o última actualización
  05-11-2020
2. Fecha de última revisión
3. Fecha de la siguiente revisión
4. Información de contacto
  
  Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica
  
  ssig@conabio.gob.mx
  
  Administrador de Metadatos
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
5. Nombre del estándar de contenido
  FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
6. Versión del estándar de contenido
  FGDC-STD-001.1-1999
7. Uso horario
8. Condiciones de acceso
9. Condiciones de uso
10. Restricciones de seguridad o privacidad
11. Extensiones

Myrtillocactus geometrizans (garambullo). Distribución potencial (Vaca, 2020)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

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