Megadontomys thomasi (ratón gigante guerrerense) Distribución potencial (González, 2013)

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Información de identificación
1. Referencia
  
  Información de referencia:
  
  Autor:
  
  González-Cózatl, F. X., (2013). 'Megadontomys thomasi (ratón gigante guerrerense). Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. Centro de Investigación en Biodiversidad y Conservación, Universidad Autónoma del Estado de Morelos. Proyecto: JM043, Modelado de la distribución geográfica de especies de ratones endémicos de bosque mesófilo. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO).. México.
  
  Fecha de publicación:
  
  01-02-2013
  
  Nombre del producto:
  
  Megadontomys thomasi (ratón gigante guerrerense) Distribución potencial (González, 2013)
  
  Formato de representación geográfica:
  
  Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
  
  Información complementaria:
  
  Escala: 1:1000000
  
  Acceso en línea:
  
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/mth043dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
2. Descripción
  
  Resumen:
  
  Se elaboró el modelo de distribución potencial de Megadontomys thomasi, dentro del proyecto JM043 'Modelado de la distribución geográfica de especies de ratones endémicos de bosque mesófilo', apoyado por CONABIO. El objetivo fue estimar la distribución potencial de esta especie, utilizando como datos geográficos digitales los sitios de recolecta georreferenciados obtenidos de distintas bases de datos públicas con registro de ejemplares de mamíferos: REMIB, (Conabio), UNIBIO (UNAM), MaNIS (Mammal Network Information System), ARCTOS (Collection Management Information System), GBIF (Global Biodiversity Information Facility), incluyendo datos de el SNIB solicitados a la Conabio. Se emplearon seis variables climáticas y la capa de altitud del sitio Worldclim a una resolución espacial de 1km cuadrado. Los datos de ocurrencia y de variables ambientales fueron incorporados en el programa Desktop GARP para generar los modelos. Considerando los mínimos errores (omisión y comisión) se hizo una selección de los mejores modelos los cuales fueron importado al programa ArcView 3.3 para obtener un mapa consenso de distribución potencial. El modelo fue validado usando el método de ROC parcial.
  
  Propósito:
  
  Estimar la distribución potencial de Megadontomys thomasi.
  
  Información suplementaria:
  
  Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=JM&Numero=043
3. Periodo de validez de los datos
  
  Fecha y hora:
  
  No aplica
  
  Vigencia:
  
  1949-2005
4. Estado de la información
  
  Progreso:
  
  Terminado
  
  Mantenimiento:
  
  No planeado
5. Dominio espacial
  
  Descripción de la extención geográfica:
  
  Ecorregión Sierra Madre del Sur y República Mexicana
  
  Coordenadas extremas:
  
  (Oeste) -101.748069763184, (Este) -96.4649353027344, (Norte) 18.4568462371826, (Sur) 16.0819396972656
6. Palabras clave
  
  Tema:
  
  2013, Bosque mesófilo, Distribución potencial, JM043, Megadontomys thomasi, roedores
  
  Lugar:
  
  Guerrero, Oaxaca, Puebla, República Mexicana
7. Taxonomía
  Palabras clave:
  
  Tema: Mammalia, Rodentia, Cricetidae, Megadontomys, Megadontomys thomasi, ratón, ratón de Thomas, ratón gigante guerrerense
  
  Sistema taxonómico:
  
  Clasificación:
  
  Fuente:
  
  'Phylogenetic affinities and species limits within the genus Megadontomys (Rodentia: Cricetidae) based on mitochondrial sequence data.'
  
  2012 2 2. Ramírez-Pulido J, J. Arroyo-Cabrales, N.González-Ruíz, (2008/20/20), 'Catálogo de autoridades de los mamíferos terrestres de México.', Universidad Autonoma Metropolitana-Iztapalapa. División de Ciencias Biológicas y de la Salud, Base de datos SNIB-CONABIO, proyecto ES010., México, D. F..Vallejo, R., F. X. González-Cózatl, (2012/ 2/ 2), 'Phylogenetic affinities and species limits within the genus Megadontomys (Rodentia: Cricetidae) based on mitochondrial sequence data.', 50 (1):67-75, Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research,
  
  Procedimiento taxonómico: No conocido
  
  Clasificación:
  
  Animalia: Chordata: Mammalia: Rodentia: Cricetidae: Megadontomys: Megadontomys thomasi (ratón, ratón de Thomas, ratón gigante guerrerense)
8. Herramienta de análisis
9. Condiciones de acceso
  Sin restricciones
10. Condiciones de uso
  Importante:
  
  No se permite utilizar estos datos con fines lucrativos y se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en http://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/mx/
11. Contacto
12. Vista previa
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/mth043dpgw
  
  Descripción:
  
  171 x 132 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/mth043dpgw
  
  Descripción:
  
  1002 x 774 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
13. Créditos y reconocimientos
14. Restricciones de uso
15. Sistema nativo
  ArcMap 10.2, ArcView 3.3, Desktop Garp 1.1.6, MaxEnt 3.3.3k, Windows 7
16. Documentos relacionados
Calidad de la información
1. Precisión de los atributos no espaciales
2. Consistencia lógica
  Gabinete
3. Cobertura del tema
  Los datos de ocurrencia fueron obtenidos a partir de bases de datos con registros de colecta de Megadontomys thomasi: REMIB, (Conabio), UNIBIO (UNAM), MaNIS (Mammal Network Information System), ARCTOS (Collection Management Information System), GBIF (Global Biodiversity Information Facility), incluyendo datos del SNIB solicitados a la Conabio. Con dichos datos se conformó una base de datos con una estructura basada en el estándar Darwin Core usando el formato Microsoft Excel. Dichos registros fueron depurados para elaborar el dato geográfico de la distribución de la especie. Los datos geográficos de siete variables ambientales (temperatura promedio anual, temperatura máxima del mes más cálido, temperatura mínima del mes más frío, precipitación anual, precipitación del mes más lluvioso, precipitación del mes más seco, altitud) fueron obtenidos del sitio BioClim. La región geográfica (área M) para la elaboración del modelo corresponde a la Ecoregión Sierra Madre del Sur. El límite de esta área se afinó tomando en consideración las subcuencas Oaxaca, Atoyac y San Francisco, al sureste y los ríos Salado y Quilotepec, al norte. Las coordenadas extremas son: 18.465179° / -101.756396° / 16.073608° / -96.456608°.. El programa Desktop GARP fue utilizado para generar los modelos y el programa ArcView 3.3 para realizar los distintos procesos en la elaboración del dato geográfico de distribución potencial de la especie. Se empleó el método ROC parcial como estrategia para la validación del modelo.
4. Precisión de los atributos espaciales
5. Procesamiento
  Fuentes:
  
  González-Cózatl, F. X., (2014), 'Modelado de la distribución geográfica de especies de ratones endémicos de bosque mesófilo', 1, Centro de Investigación en Biodiversidad y Conservación, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, México, D. F..
  
  Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. 1.4, WorldClim, Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http://www.worldclim.org/, University of California, Berkeley. U.S.A..
  
  INEGI, (2010), 'Red hidrográfica, subcuencas hidrográficas de México', Escala 1:50000. 2.0, Instituto Nacional de Estadística y Geografía, Subcuencas hidrológicas de México. INEGI, http://www.inegi.org.mx/geo/contenidos/topografia/regiones_hidrograficas.aspx, Aguascalientes, Ags., México.
  
  INEGI, CONABIO, INE, (2008), 'Ecorregiones terrestres de México', Escala 1:1000000. Instituto Nacional de Estadística, Geografía e Informática, Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, Instituto Nacional de Ecología, http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/region/biotic/ecort08gw, México, D. F..
  Procedimientos:
  
  No aplica: Los datos de ocurrencia fueron obtenidos a partir de bases de datos con registros de colecta de Megadontomys nelsoni: REMIB, (Conabio), UNIBIO (UNAM), MaNIS (Mammal Network Information System), ARCTOS (Collection Management Information System), GBIF (Global Biodiversity Information Facility), incluyendo datos del SNIB solicitados a la Conabio. Con dichos datos se conformó una base de datos con una estructura basada en el estándar Darwin Core usando el formato Microsoft Excel. Dichos registros fueron depurados para elaborar el dato geográfico de la distribución de la especie. Los datos geográficos de siete variables ambientales (temperatura promedio anual, temperatura máxima del mes más cálido, temperatura mínima del mes más frío, precipitación anual, precipitación del mes más lluvioso, precipitación del mes más seco, altitud) fueron obtenidos del sitio BioClim. La región geográfica (área M) para la elaboración del modelo corresponde a la Ecorregión Sierra Madre del Sur. El límite de esta área se afinó tomando en consideración las subcuencas Oaxaca, Atoyac y San Francisco, al sureste y los ríos Salado y Quilotepec, al norte. Las coordenadas extremas son: 18.465179° / -101.756396° / 16.073608° / -96.456608°. El programa Desktop GARP fue utilizado para generar los modelos y el programa ArcView 3.3 para realizar los distintos procesos en la elaboración del dato geográfico de distribución potencial de la especie. Se empleó el método ROC parcial como estrategia para la validación del modelo. La base de datos con registros de ocurrencias fue revisada y depurada. Inicialmente, se proyectaron los puntos geo-referenciados en el espacio geográfico para determinar si estos correspondían a las áreas históricas de distribución de las especies. Para confirmar la validez de los registros y verificar la existencia de registros fuera del rango en el que la especie podría ocurrir, se graficó la distribución de frecuencias de los registros en distintos intervalos para cada variable ambiental que se consideró como indicadora del nicho ecológico de la especie (ver abajo). Como resultado del proceso completo de control de calidad y limpieza de datos se eliminaron registros cuya ubicación geográfica no se ajustaba a las condiciones de nicho ecológico en que esta especie ocurre naturalmente. Además, con base en la información genética generada en los trabajos sobre sistemática de los grupos, se corrigieron varios registros que tenían una incorrecta identificación taxonómica de la especie, en relación a su localidad de colecta y a la distribución conocida del grupo. La delimitación del área accesible 'M' de esta especie del género Megadontomys estuvo basada en la información generada reciente sobre la sistemática y distribución del grupo (Vallejo y González-Cózatl, 2012). En este trabajo se demuestra que todas las especies del género Megadontomys habitan en partes altas de varios sistemas montañosos de México (por arriba de los 1,600 msnm). La región geográfica (área M) para la elaboración del modelo corresponde a la Ecorregión Sierra Madre del Sur. El límite de esta área se afinó tomando en consideración las subcuencas Oaxaca, Atoyac y San Francisco, al sureste y los ríos Salado y Quilotepec, al norte. Las coordenadas extremas son: 18.465179° / -101.756396° / 16.073608° / -96.456608°. Considerando que la especie, cuya distribución se quiere modelar, ocurre en tierras altas de sistema montañosos, en bosques templados húmedos, relativamente bien conservados, la selección de las variables utilizadas estuvo orientada a representar las condiciones ecológicas de dicho ecosistema y se seleccionaron las capas de temperatura promedio anual, temperatura máxima del mes más cálido, temperatura mínima del mes más frío, precipitación anual, precipitación del mes más lluvioso, precipitación del mes más seco y altitud de WorldClim. Una vez obtenidas las variables ambientales y habiendo generado el polígono del área 'M', se hizo un recorte de cada una de las variables acotándolas al área de interés. Esto se realizó con ayuda de la extensión Grid Tools de ArcView. En el programa Desktop GARP, se cargaron las localidades previamente seleccionadas y depuradas, y además se montó el archivo (.dxl) que aloja las variables a utilizar en el análisis. Para hacer el modelado se usaron los parámetros establecidos por definición en GARP: no se activó la opción Best Subset (número de modelos = 20); porcentaje o número de registros utilizados para entrenamiento = 50%; número de corridas por experimento = 100; límite de convergencia = .01; máximo de iteraciones = 1000; tipo de reglas utilizado = todas (Atómicas, de Rango, de rango negado, Logit). Considerando los mínimos errores (omisión y comisión) se hizo una selección de los mejores modelos y se importaron a ArcView (File - import GRID - ASCII format). Posteriormente, se sumaron los mejores modelos, previamente seleccionados, con el objetivo de obtener un mapa consenso final. El valor del campo VALUE fue asignado mediante una reclasificación del raster ya que en la suma de los mejores modelos se obtenían valores mayores de diez. La reclasificación se acotó a un rango de 0 a 10, en donde la distribución potencial era cero cuando ningún modelo predecía dicha distribución y 10 cuando varios modelos predecían la distribución de la especie. Es decir, 0 representa una nula probabilidad de que la especie esté presente ya que las condiciones no son idóneas para la misma; y 10 representa una probabilidad muy alta de que la especie esté presente, ya que las condiciones son adecuadas para que subsista. Para validar los modelos se usó el método de ROC parcial implementado en el programa Tool for Partial-ROC. El análisis se realizó con los parámetros establecidos por definición en Tool for Partial-ROC: Proportion of points in bootstrap (0 - 100%) = 50; Sampling with replacement (# of repetitions) = 1000; 1 - Omission Threshold = 0.95. Con los valores de proporción del AUC se realizó una prueba de significancia de una cola para estimar la probabilidad de que el promedio de la proporciones sea =1 usando del estadístico Z implementado en Excel.
6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
Atributos espaciales
1. Representacion espacial
2. Método de representacion espacial
  Vector
3. Información de vectores y puntos
  
  Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
  
  Tipo de objetos punto y vectores:
  
  G-polygon
  
  Número de puntos o vectores:
  
  10255
4. Información de imágenes
Sistema de referencia
1. Sistema de coordenadas (horizontal)
  
  Geográficas:
  
  Resolución de la latitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Resolución de la longitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Unidades de las coordenadas Geográficas:
  
  Decimal degrees
  
  Modelo geodésico:
  
  Datum horizontal:
  
  WGS84
  
  Elipsoide:
  
  WGS84
  
  Semieje mayor:
  
  6378137.000000
  
  Denominador del factor de achatamiento:
  
  298.257224
2. Sistema de coordenadas (vertical)

Atributos no espaciales

Descripción detallada

Nombre: MTH043DPGW.DBF

Definición: La tabla contiene valores (en números reales), de probabilidad de presencia del hábitat climático propicio (suitable climatic habitat) para la especie, valores que van de 0 a 10.

Fuente: No conocido

Atributo	Descripción	Fuente [1]	Dominio [2]	Precisión [3]
Value	Numérico	Datos del Proyecto	Valor que indica la probabilidad de presencia de la especie, 0 representa una nula probabilidad de que la especie esté presente ya que las condiciones no son idóneas para la misma; y 10 representa una probabilidad muy alta de que la especie esté presente, ya que las condiciones son adecuadas para que subsista.	-

Descripción resumida

Distribución de la información
1. Información de contacto
  
  Jose Manuel Davila Rosas
  
  jdavila@conabio.gob.mx
  
  Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
2. Nombre de referencia
  mth043dpgw
3. Responsabilidad
  La Subdirección de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
4. Medios de distribución
  Digitales:
  
  ESRI Shapefile (SHP), 1.00 MB
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/mth043dpgw.zip
  
  Google Earth (KML)
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/mth043dpgw.kmz
  
  Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.
5. Medios de distribución especiales
6. Requisitos técnicos
  Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
7. Disponibilidad
Acerca de este documento
1. Fecha de creación o última actualización
  01-02-2013
2. Fecha de última revisión
3. Fecha de la siguiente revisión
4. Información de contacto
  
  Estrella Cruz Reyes
  
  ecruz@conabio.gob.mx
  
  Administrador de Metadatos
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 01 55 5004 4963 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
5. Nombre del estándar de contenido
  FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
6. Versión del estándar de contenido
  FGDC-STD-001.1-1999
7. Uso horario
8. Condiciones de acceso
9. Condiciones de uso
10. Restricciones de seguridad o privacidad
11. Extensiones

Megadontomys thomasi (ratón gigante guerrerense) Distribución potencial (González, 2013)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

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