Neotomodon alstoni (ratón de los volcanes). Distribución potencial (Escalante-Espinosa y Gámez-Tamariz, 2014)

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Información de identificación
1. Referencia
  
  Información de referencia:
  
  Autor:
  
  Escalante-Espinosa, T., N. Gámez-Tamariz, (2014). 'Neotomodon alstoni (ratón de los volcanes). Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. Museo de Zoología Alfonso L. Herrera, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JM055, Modelos de distribución de especies de Mamíferos y Suculentas de la Faja Volcánica Transmexicana. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). México.
  
  Fecha de publicación:
  
  03-09-2014
  
  Nombre del producto:
  
  Neotomodon alstoni (ratón de los volcanes). Distribución potencial (Escalante-Espinosa y Gámez-Tamariz, 2014)
  
  Formato de representación geográfica:
  
  Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
  
  Información complementaria:
  
  Escala: 1:1000000
  
  Acceso en línea:
  
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/nal055dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
2. Descripción
  
  Resumen:
  
  El modelo de distribución potencial de Neotomodon alstoni, se elaboró dentro del proyecto JM055 Distribución de especies de Mamíferos y Suculentas de la Faja Volcánica Transmexicana, apoyado por CONABIO. El objetivo fue estimar la distribución potencial de esta especie, utilizando como datos geográficos los sitios de recolecta georreferenciados proporcionadospor el Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad de la CONABIO y variables ambientales (Tallez et al., 2011; USGCS, hidro1k, DEM, GTOPO03 a una resolución espacial de 30 arco segundos. Ambos conjuntos de datos fueron incorporados en el programa MaxEnt 3.3.3k (Phillips et al,. 2006) para generar el modelo, el cual fue importado a R (R Proyect) para eliminar las áreas con probabilidades por debajo del percentil 10 asociado a los registros utilizados en la generación del modelo.
  
  Propósito:
  
  Estimar la distribución potencial de Neotomodon alstoni
  
  Información suplementaria:
  
  Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=55
3. Periodo de validez de los datos
  
  Fecha y hora:
  
  No aplica
  
  Vigencia:
  
  1892-2009
4. Estado de la información
  
  Progreso:
  
  Terminado
  
  Mantenimiento:
  
  No planeado
5. Dominio espacial
  
  Descripción de la extención geográfica:
  
  Sur de la Faja Volcánica Transmexicana, República Mexicana
  
  Coordenadas extremas:
  
  (Oeste) -105.500663757324, (Este) -95.0010757446289, (Norte) 22.4996204376221, (Sur) 17.4998188018799
6. Palabras clave
  
  Tema:
  
  2014, JM055, MaxEnt, Modelo binario de presencia/ausencia, Modelo de Distribución, Neotomodon alstoni
  
  Lugar:
  
  Aguascalientes, Ciudad de México, Colima, Durango, Guanajuato, Guerrero, Hidalgo, Jalisco, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Nayarit, Oaxaca, Puebla, Querétaro, República Mexicana, San Luis Potosí, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Zacatecas
7. Taxonomía
  Palabras clave:
  
  Tema: Mammalia, Rodentia, Cricetidae, Neotomodon, Neotomodon alstoni, ratón de los volcanes, rata de campo, ratón de volcán, mexican volcano mouse, volcano mouse
  
  Sistema taxonómico:
  
  Clasificación:
  
  Fuente:
  
  'List of Recent Land Mammals of Mexico, 2014'
  
  20140000. Ramírez-Pulido, J., N. González-Ruiz, A. L. Gardner, J. Arroyo-Cabrales, (2014), 'List of Recent Land Mammals of Mexico, 2014', Museum of Texas Tech University, Special Publications of the Museum of Texas Tech University 63:1-69, USA.
  
  Procedimiento taxonómico: No conocido
  
  Clasificación:
  
  Animalia: Chordata: Mammalia: Rodentia: Cricetidae: Neotomodon: Neotomodon alstoni (ratón de los volcanes, rata de campo, ratón de volcán, mexican volcano mouse, volcano mouse)
8. Herramienta de análisis
9. Condiciones de acceso
  Sin restricciones
10. Condiciones de uso
  Importante:
  
  Se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
11. Contacto
12. Vista previa
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/nal055dpgw
  
  Descripción:
  
  171 x 132 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/nal055dpgw
  
  Descripción:
  
  1002 x 774 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
13. Créditos y reconocimientos
14. Restricciones de uso
15. Sistema nativo
  MaxEnt 3.3.3k, R 3.0.2., Dell XPS 8500, Intel® Core i7, 3.4GHz, RAM 16.0, linux mint17
16. Documentos relacionados
  
  Neotomodon alstoni (ratón de los volcanes) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Escalante-Espinosa y Gámez-Tamariz, 2014)
  
  Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).
  
  Neotomodon alstoni (ratón de los volcanes) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Escalante-Espinosa y Gámez-Tamariz, 2014)
  
  Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)
  
  Página de enciclovida para Neotomodon alstoni a nivel de especie
  
  Enlace por idcatalogo 11122MAMIF en http://enciclovida.mx/especies/
Calidad de la información
1. Precisión de los atributos no espaciales
2. Consistencia lógica
  Gabinete
3. Cobertura del tema
  Se depuró la base de datos de los registros de con información georreferida de Neotomodon alstoni, generada a partir de los datos proporcionados SNIB-CONABIO, portales en línea y colecciones científicas. Se realizó una validación geográfica y nomenclatural. Las variables predictoras utilizadas para hacer la modelación provienen de cartografía digital que describe aspectos climáticos (Téllez et al., 2011) y topográficos (USGCS) del espacio. Las variables ambientales fueron seleccionadas mediante un análisis de componentes principales. Se utilizó una de las 7 regiones geográficas (M o landscape) definidas en este proyecto (Región FVT). Se utilizó el programa MaxEnt 3.3.3k para generar los modelos y R para realizar los distintos procesos en la elaboración del dato geográfico de distribución de la especie. Para refinar el modelo se empleó el valor de probabilidad asociado al 10% de los datos con menor valor (entrenamiento + validación interna). Se empleó el método AUC parcial como método de evaluación global del modelo.
4. Precisión de los atributos espaciales
5. Procesamiento
  Fuentes:
  
  Escalante-Espinosa, T., N. Gámez-Tamariz, (2014/09/03), 'Modelos de distribución de especies de mamíferos y suculentas de la Faja Volcánica Transmexicana', versión: 1, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México, México. Base de datos SNIB-CONABIO, proyecto No. JM055, http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=55
  
  EROS Data Center, (2000), 'HYDRO1k Elevation Derivative Database', Escala 1:1000000. U.S. Geological Survey Earth Resources Observation and Science (EROS) Center, USA. The effort has been led by U.S.G.S. scientists in collaboration with the United Nations Environment Programme/Global Resource Information Database (UNEP/GRID) located in Sioux Falls, South Dakota., https://lta.cr.usgs.gov/HYDRO1KReadMe
  
  Téllez, O., M. A. Hutchinson, H. A. Nix, P. Jones, (2011), 'Desarrollo de coberturas digitales climáticas para México', Escala 1:1000000. Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo, Pachuca, Hidalgo, México. En: Sánchez-Rojas, G., Ballesteros, B.C. & N. Pavón(Eds.) Cambio Climático. Http://www.uaeh.edu.mx/investigacion/icbi/LI_EcoConserBiolo/gerardo_sanchez/2011Libro_CC.pdf, http://idrisi.uaemex.mx/index.php/ligas/geodatos/306-superficies-climaticas-para-mexico
  Procedimientos:
  
  No aplica: Se obtuvo información georreferida de Neotomodon alstoni a partir de los datos proporcionados SNIB-CONABIO, portales en línea (http://gbif.org/) y colecciones científicas (Colección de mamíferos de IB UNAM; Colección Mastozológica y Colección de tejidos congelados, ambas de la Facultad de Ciencias, UNAM; Colección de mamíferos, UAM Iztapalapa; Colección de mamíferos, UAEM; Colección de mamíferos, Instituto Tecnológico de Huejutla Hgo. Se realizó la validación geográfica y nomenclatural de los registros siguiendo la propuesta por Ramírez-Pulido et al. (2005). Se obtuvo un total de 221 registros únicos. Para caracterizar ambientalmente los registros con potencial para ser incluídos en el modelo y detectar a aquellos con distribución marginal y comportamiento ambiental diferenciado se calcularon las distancias de Mahalanobis. Las variables predictoras provienen de cartografía digital que describe aspectos climáticos (Téllez et al., 2011) y topográficos (USGCS) del espacio. Las variables se seleccionaron mediante un análisis de componentes principales. Las variables utilizadas fueron: Aspect Flow Accum FlowDir bio01 bio02 bio04 bio08 bio10 bio12 bio14 bio15 bio17. Debido a que las especies seleccionadas en este proyecto describen patrones de distribución que se ajustan distintas porciones geográficas, se definieron distintas M que describieran dichas regiones a partir de polígonos regulares. La región geográfica para la elaboración del modelo (M o landcape) correspondió a la Región FVT y quedó delimitada por las coordenadas extremas: -105.5006593, -95.00107886, 17.49982019, 22.4996204. El modelo fue generado con el programa MaxEnt 3.3.3k (Phillips et al., 2006), utilizando los siguientes criterios: Random Seed = on, Remove duplicate presence records = off; Random test percentage =20, Regularization multiplier = 1, Replicates = 30, Replicate run type = Bootstrap, Extrapolate = off, Maximum iterations = 1000, y el resto pre-establecido. Para refinar el modelo se empleó el valor de probabilidad asociado al 10% de los datos con menor valor (entrenamiento + validación interna). Los valores de los píxeles con probabilidades menores a la del 10 percentil fueron reasignados a NA, mientras que los mayores fueron reasignados a 1. Para el modelo se calculó el valor de AUC de la ROC Parcial, tomando como umbral de error el 10% de la muestra total empleada para modelar, que en este caso fue de 22.
6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
Atributos espaciales
1. Representacion espacial
2. Método de representacion espacial
  Vector
3. Información de vectores y puntos
  
  Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
  
  Tipo de objetos punto y vectores:
  
  G-polygon
  
  Número de puntos o vectores:
  
  863
4. Información de imágenes
Sistema de referencia
1. Sistema de coordenadas (horizontal)
  
  Geográficas:
  
  Resolución de la latitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Resolución de la longitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Unidades de las coordenadas Geográficas:
  
  Decimal degrees
  
  Modelo geodésico:
  
  Datum horizontal:
  
  WGS84
  
  Elipsoide:
  
  WGS84
  
  Semieje mayor:
  
  6378137.000000
  
  Denominador del factor de achatamiento:
  
  298.257224
2. Sistema de coordenadas (vertical)

Atributos no espaciales

Descripción detallada

Nombre: NAL055DPGW.DBF

Definición: La tabla contiene valores de presencia-ausencia de la especie en números binarios (0=ausencia y 1=presencia).

Fuente: No conocido

Atributo	Descripción	Fuente [1]	Dominio [2]	Precisión [3]
GRIDCODE	Numérico	Datos del proyecto	Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia.	-

Descripción resumida

Distribución de la información
1. Información de contacto
  
  Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica
  
  ssig@conabio.gob.mx
  
  Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
2. Nombre de referencia
  nal055dpgw
3. Responsabilidad
  La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
4. Medios de distribución
  Digitales:
  
  ESRI Shapefile (SHP), 1.00 MB
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/nal055dpgw.zip
  
  Google Earth (KML)
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/nal055dpgw.kmz
  
  Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.
5. Medios de distribución especiales
6. Requisitos técnicos
  Tener sistemas compatibles con archivos tipo raster, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
7. Disponibilidad
Acerca de este documento
1. Fecha de creación o última actualización
  03-09-2014
2. Fecha de última revisión
3. Fecha de la siguiente revisión
4. Información de contacto
  
  Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica
  
  ssig@conabio.gob.mx
  
  Administrador de Metadatos
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  
  Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
5. Nombre del estándar de contenido
  FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
6. Versión del estándar de contenido
  FGDC-STD-001.1-1999
7. Uso horario
8. Condiciones de acceso
9. Condiciones de uso
10. Restricciones de seguridad o privacidad
11. Extensiones

Neotomodon alstoni (ratón de los volcanes). Distribución potencial (Escalante-Espinosa y Gámez-Tamariz, 2014)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

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