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1. Información de identificación
   1. Referencia

      Información de referencia:

      Autor:

      Sánchez-Cordero, V., P. Rodríguez, N. Moreno-Almeraya, M. Jiménez-Cruz, (2020). 'Nyctomys sumichrasti (rata vespertina centroamericana). Distribución Potencial en México', escala: 1:1000000. edición: 1. Instituto de Biología, UNAM. Proyecto: JM040, Modelado de la distribución potencial de especies de mamíferos reservorios y vectores de tres zoonosis emergentes en México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Ciudad de México, México.

      Fecha de publicación:

      27-05-2020

      Nombre del producto:

      Nyctomys sumichrasti (rata vespertina centroamericana) Distribución Potencial en México (Sánchez-Cordero et al., 2020)

      Formato de representación geográfica:

      GEOTIFF. Formato raster Resolución(925.92,925.92) metros

      Información complementaria:

      Escala: 1:1000000

      Acceso en línea:

      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/nsu040dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no

   2. Descripción

      Resumen:

      El modelo de la distribución potencial de Nyctomys sumichrasti se elaboró como parte del proyecto JM040 'Modelado de la distribución potencial de especies de mamíferos reservorios y vectores de tres zoonosis emergentes en México'. Se generó con Maxent a partir de datos de presencia obtenidos del GBIF, 19 variables climáticas de WordlClim y 3 variables topográficas de HYDRO1K. El área de accesibilidad ('M') se eligió utilizando las eco-regiones de la WWF. Se evaluó el desempeño del modelo utilizando el AUC de la ROC completa.

      Propósito:

      Estimar la distribución potencial de Nyctomys sumichrasti en México.

      Información suplementaria:

      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JE&Numero=40

   3. Periodo de validez de los datos

      Fecha y hora:

      No aplica

      Vigencia:

      1895-2015

   4. Estado de la información

      Progreso:

      Terminado

      Mantenimiento:

      No planeado

   5. Dominio espacial

      Descripción de la extención geográfica:

      República Mexicana, Belice, El Salvador, Guatemala, Honduras, Nicaragua

      Coordenadas extremas:

      (Oeste) -105.692968274949, (Este) -83.15963367975, (Norte) 25.6925713633969, (Sur) 12.984237318397

   6. Palabras clave

      Tema:

      2020, JM040, Mamíferos, Mapas de distribución, Modelos de distribución, Nicho ecológico, Nyctomys sumichrasti, Nyctomys sumichrasti colimensis, Nyctomys sumichrasti pallidulus, Nyctomys sumichrasti salvinii, Nyctomys sumichrasti sumichrasti, Roedores

      Lugar:

      Aguascalientes, Belice, Campeche, Ciudad de México, Coahuila de Zaragoza, Colima, Chiapas, Durango, El Salvador, Guanajuato, Guatemala, Guerrero, Hidalgo, Honduras, Jalisco, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Nayarit, Nicaragua, Nuevo León, Oaxaca, Puebla, Querétaro, Quintana Roo, República Mexicana, San Luis Potosí, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Zacatecas

   7. Taxonomía

      Palabras clave:

      Tema: Mammalia, Rodentia, Cricetidae, Nyctomys, Nyctomys sumichrasti, sumichrast's vesper rat, rata vespertina centroamericana, ratón de campo

      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Catálogo de autoridades taxonómicas de especies de flora y fauna con distribución en México.'

        20190000. CONABIO (comp.), (2019), 'Catálogo de autoridades taxonómicas de especies de flora y fauna con distribución en México.', Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, Base de datos SNIB-CONABIO. http://www.enciclovida.mx/, México.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Animalia: Chordata: Mammalia: Rodentia: Cricetidae: Nyctomys: Nyctomys sumichrasti (sumichrast's vesper rat, rata vespertina centroamericana, ratón de campo)

   8. Herramienta de análisis
   9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
   10. Condiciones de uso

       Importante:

       • Se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
   11. Contacto
   12. Vista previa

       Nombre del recurso:

       http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/nsu040dpgw

       Descripción:

       171 x 132 píxeles

       Formato:

       image/png

       Nombre del recurso:

       http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/nsu040dpgw

       Descripción:

       1002 x 774 píxeles

       Formato:

       image/png

   13. Créditos y reconocimientos
   14. Restricciones de uso
   15. Sistema nativo
       MaxEnt 3.3.3k, ArcGIS Desktop 10.6, DELL Optiplex 9020, Windows
   16. Documentos relacionados

       Nyctomys sumichrasti (rata vespertina centroamericana) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial en México (Sánchez-Cordero et al., 2020)

       Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

       Nyctomys sumichrasti (rata vespertina centroamericana) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial en México (Sánchez-Cordero et al., 2020)

       Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

       Página de enciclovida para Nyctomys sumichrasti a nivel de especie

       Enlace por idcatalogo 12373MAMIF en http://enciclovida.mx/especies/

2. Calidad de la información
   1. Precisión de los atributos no espaciales
   2. Consistencia lógica
      Gabinete
   3. Cobertura del tema
      Se generó una base de datos de sitios ocurrencia en México de las especies de roedores, obtenidos de GBIF (Global Environmental Facility). Se realizó un proceso de control de calidad de los datos de aspectos taxonómicos y geográficos. Los modelos se generaron con el programa MaxEnt 3.3.3k (Phillips et al, 2006). Se utilizaron las localidades únicas de cada especie y variables climáticas de WordlClim (http://www.worldclim.org/) y topográficas (https://lta.cr.usgs.gov/HYDRO1K). El área de accesibilidad ('M') se eligió para cada especie, utilizando las eco-regiones de la WWF (Olson et al. 2001). Se evaluó el desempeño del modelo utilizando el AUC de la ROC (Narayani, 2008). Al mapa resultante, se le realizó una edición a posteriori siguiendo los límites políticos administrativos al sur del país, para ello se utilizó ArcGIS Desktop 10.3.
   4. Precisión de los atributos espaciales
   5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Olson, D. M., E. Dinerstein, E. D. Wikramanayake, N. D. Burgess, G. V. N. Powell, E. C. Underwood, J. A. D'Amico, I. Itoua, H. E. Strand, J. C. Morrison, C. J. Loucks, T. F. Allnutt, T. H. Ricketts, Y. Kura, J. F. Lamoreux, W. W. Wettengel, P. Hedao, K. R. Kassem, (2014), 'Terrestrial Ecoregions of the World (TEOW)', versión: 1, World Wildlife Fund, Washington, DC. La información sobre los métodos usados para generar las capas de Ecorregiones Terrestres del Mundo se pueden consultar en: Olson, D. M., Dinerstein, E., Wikramanayake, E. D., Burgess, N. D., Powell, G. V. N., Underwood, E. C., D'Amico, J. A., Itoua, I., , http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world

      • Hijmans, R. J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolate, http://www.worldclim.org/

      • modelo digital de elevacion, (2000), 'HYDRO1k Elevation Derivative Database', U.S. Geological Survey Earth Resources Observation and Science (EROS) Center, USA. The effort has been led by U.S.G.S. scientists in collaboration with the United Nations Environment Programme/Global Resource Information Database (UNEP/GRID) located in Sioux Falls, South Dakota., https://lta.cr.usgs.gov/HYDRO1KReadMe

      • Sánchez-Cordero, V., Gutiérrez-Granados, A. Rodríguez-Moreno, (2020), 'Modelado de la distribución potencial de especies de mamíferos reservorios y vectores de tres zoonosis emergentes en México', versión: 1, Instituto de Biología, Universidad Nacional Atónoma de México, Ciudad de México, México. Base de datos_Rodentia SNIB-CONABIO, proyecto No. JM040, http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=40

      Procedimientos:

      • No aplica: Se generó una base de datos de sitios de ocurrencia en México de la especie Nyctomys sumichrasti obtenidos de GBIF (Global Environmental Facility). Se realizó un detallado proceso de control de calidad tanto de la parte taxonómica, como de la parte geográfica. Se eliminaron datos redundantes, duplicados, inconsistentes y sin información útil para la generación del modelo. Se obtuvieron 135 registros de localidades únicas. Para definir el área de accesibilidad (M) se seleccionaron aquellas eco-regiones en las que se tenía al menos un registro de presencia, y las que, de acuerdo con el conocimiento del experto, podrían ser parte de la distribución de la especie. La 'M' quedó conformada por las siguientes eco-regiones: Bajío dry forests, Balsas dry forests, Belizian pine forests, Central American Atlantic moist forests, Central American dry forests, Central American montane forests, Central American pine-oak forests, Central Mexican matorral, Chiapas Depression dry forests, Chiapas montane forests, Chihuahuan desert, Chimalapas montane forests, Costa Rican seasonal moist forests, Isthmian-Atlantic moist forests, Jalisco dry forests, Lake, Meseta Central matorral, Mesoamerican Gulf-Caribbean mangroves, Miskito pine forests, Motagua Valley thornscrub, Northern Mesoamerican Pacific mangroves, Oaxacan montane forests, Pantanos de Centla, Petén-Veracruz moist forests, Sierra de los Tuxtlas, Sierra Madre de Chiapas moist forests, Sierra Madre de Oaxaca pine-oak forests, Sierra Madre del Sur pine-oak forests, Sierra Madre Occidental pine-oak forests, Sierra Madre Oriental pine-oak forests, Sinaloan dry forests, Southern Mesoamerican Pacific mangroves, Southern Pacific dry forests, Tamaulipan matorral, Tamaulipan mezquital, Tehuacán Valley matorral, Trans-Mexican Volcanic Belt pine-oak forests, Veracruz dry forests, Veracruz moist forests, Veracruz montane forests, Yucatán moist forests. Las variables predictoras se seleccionaron a partir de un análisis de correlación de Pearson realizado entre las 19 variables de Worldclim (http://www.worldclim.org/) y las variables topográficas, altitud, pendiente y orientación (https://lta.cr.usgs.gov/HYDRO1K). Para este proceso se utilizó el paquete fuzzySim que se corrió en R (R Core Team 2015. ISBN 3-900051-07-0XX). Las variables seleccionadas fueron: aspect, bio_1, bio_15, bio_18, bio_2, bio_3, bio_7 y pendiente. Se usó el programa MaxEnt 3.3.3k (Phillips et al., 2006). Se seleccionó el tipo de salida 'logistic' y se mantuvieron los parámetros establecidos por default. Se activó 'Create response curves', 'Do jacknife to measure variable importance', 'Random seed', 'Add all samples to background' y 'Write plot data'. Se desactivó: 'Write clamp grid when projecting', 'Do MESS analysis when projecting', 'Extrapolatre' y 'Do clamping'. Se utilizó el 75 % de los registros para entrenamiento y el 25 % para validación (Random test percentage). Se corrieron 10 réplicas y se utilizó el método 'Bootstrap' para hacer el re-muestreo. El valor de AUC de la ROC resultó de: 0.9506 (training) y 0.916 (test), lo que indica que es un buen modelo. Al mapa resultante, se le realizó una edición a posteriori siguiendo los límites políticos administrativos al sur del país, para ello se utilizó ArcGIS Desktop 10.3. El modelo se generó con registros a nivel de especie y de las siguientes subespecies: Nyctomys sumichrasti colimensis, Nyctomys sumichrasti pallidulus, Nyctomys sumichrasti salvinii y Nyctomys sumichrasti sumichrasti.

   6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
3. Atributos espaciales
   1. Representacion espacial
   2. Método de representacion espacial
      Raster
   3. Información de vectores y puntos
   4. Información de imágenes

      Tipo de objeto:

      Pixel

      Dimensiones:

      Número de filas:

      1525

      Número de columnas:

      2704

      Número de niveles, capas, etc.. Vertical:

      1

4. Sistema de referencia
   1. Sistema de coordenadas (horizontal)

      Geográficas:

      Resolución de la latitud:

      0.0174532925199433

      Resolución de la longitud:

      0.0174532925199433

      Unidades de las coordenadas Geográficas:

      Decimal degrees

      Modelo geodésico:

      Datum horizontal:

      WGS84

      Elipsoide:

      WGS84

      Semieje mayor:

      6378137.000000

      Denominador del factor de achatamiento:

      298.257224

   2. Sistema de coordenadas (vertical)
5. Atributos no espaciales
   1. Descripción detallada

      Nombre: NSU040DPGW.TIF

      Definición: Describe los campos contenidos en el mapa

      Fuente: No conocido

      Atributo	Descripción	Fuente [1]	Dominio [2]	Precisión [3]
      Value	Numérico	Datos del proyecto	Los valores cercanos a 1 indican condiciones favorables para la presencia de la especie, valores cercanos a 0 indican condiciones no favorables para la especie.	-

   2. Descripción resumida
6. Distribución de la información
   1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      
      

      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

   2. Nombre de referencia
      nsu040dpgw
   3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
   4. Medios de distribución

      Digitales:

      • GeoTIFF (TIF), 5.98 MB

        http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/nsu040dpgw.zip

      • Google Earth (KML)

        http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/nsu040dpgw.kmz

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

   5. Medios de distribución especiales
   6. Requisitos técnicos
      Tener sistemas compatibles con archivos raster, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
   7. Disponibilidad
7. Acerca de este documento
   1. Fecha de creación o última actualización
      27-05-2020
   2. Fecha de última revisión
   3. Fecha de la siguiente revisión
   4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos

      
      

      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

   5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
   6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
   7. Uso horario
   8. Condiciones de acceso
   9. Condiciones de uso
   10. Restricciones de seguridad o privacidad
   11. Extensiones

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx