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1. Información de identificación
   1. Referencia

      Información de referencia:

      Autor:

      Vaca, R. A., (2020). 'Pimenta dioica (pimienta gorda). Distribución potencial', escala: 1:5000000. edición: 1. El Colegio de la Frontera Sur-Unidad San Cristóbal. Proyecto: JM052, REDDEAM: Riesgo de extinción determinado por distribución de árboles mexicanos. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Ciudad de México, México.

      Fecha de publicación:

      05-11-2020

      Nombre del producto:

      Pimenta dioica (pimienta gorda). Distribución potencial (Vaca, 2020)

      Formato de representación geográfica:

      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)

      Información complementaria:

      Escala: 1:5000000

      Acceso en línea:

      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/pdio052dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no

   2. Descripción

      Resumen:

      El modelo de distribución potencial de Pimenta dioica se elaboró dentro del proyecto JM052 'REDDEAM: Riesgo de extinción determinado por distribución de árboles mexicanos'. Los modelos se generaron con el programa estadístico R, utilizando dos métodos: GAM (modelos aditivos generalizados) y RPART (Recursive Partitioning and Regression Trees), se seleccionó el que tuvo mejor desempeño (RPART). Como variable predictiva se utilizó la dinámica anual en la humedad del suelo. Los cambios en la humedad del suelo a lo largo del año están definidos por un modelo de cubeta que se elaboró en el contexto de este proyecto y que incluye las 36 variables climáticas de WorldClim. La resolución espacial del modelo es de 5 km cuadrados por pixel, con un sistema de coordenadas geográficas.

      Propósito:

      Estimar la distribución potencial de Pimenta dioica.

      Información suplementaria:

      Dr. Raúl A. Vaca, institución de adscripción actual El Colegio de San Luis (COLSAN) Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=52 http://www.ecosur.mx/ecoconsulta/busqueda/detalles.php?id=13117&bdi=0

   3. Periodo de validez de los datos

      Fecha y hora:

      No aplica

      Vigencia:

      Desconocido

   4. Estado de la información

      Progreso:

      Terminado

      Mantenimiento:

      No planeado

   5. Dominio espacial

      Descripción de la extención geográfica:

      México, Belice, Costa Rica, El Salvador, Guatemala, Honduras, Nicaragua y Panamá

      Coordenadas extremas:

      (Oeste) -99.2499999996695, (Este) -82.4999999994535, (Norte) 21.9166666665327, (Sur) 8.66666666636181

   6. Palabras clave

      Tema:

      2020, árboles, Distribución potencial, JM052, Mesoamérica, Pimenta dioica, RPART

      Lugar:

      Belice, Campeche, Costa Rica, Chiapas, El Salvador, Guatemala, Hidalgo, Honduras, Nicaragua, Oaxaca, Panamá, Puebla, Querétaro, Quintana Roo, República Mexicana, San Luis Potosí, Tabasco, Veracruz de Ignacio de la Llave, Yucatán

   7. Taxonomía

      Palabras clave:

      Tema: Equisetopsida, Myrtales, Myrtaceae, Pimenta, Pimenta dioica, boox pool, du-te-dan, hoja de pimienta, jocosúchil, malagueta, nukuch pool, patalolote, patolote, pimentón, pimienta, pimienta de Tabasco, pimienta de la tierra, pimienta gorda, pimienta grande, pimienta gruesa, pimienta inglesa, pimienta negra, pimiento

      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Catálogo de autoridades taxonómicas de especies de flora y fauna con distribución en México'

        20180000. CONABIO (comp.), (2018), 'Catálogo de autoridades taxonómicas de especies de flora y fauna con distribución en México', Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, Base de datos SNIB-CONABIO. Disponible en: http://enciclovida.mx/, México.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Plantae: Tracheophyta: Equisetopsida: Myrtales: Myrtaceae: Pimenta: Pimenta dioica (boox pool, du-te-dan, hoja de pimienta, jocosúchil, malagueta, nukuch pool, patalolote, patolote, pimentón, pimienta, pimienta de Tabasco, pimienta de la tierra, pimienta gorda, pimienta grande, pimienta gruesa, pimienta inglesa, pimienta negra, pimiento)

   8. Herramienta de análisis
   9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
   10. Condiciones de uso

       Importante:

       • Se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
   11. Contacto
   12. Vista previa

       Nombre del recurso:

       http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/pdio052dpgw

       Descripción:

       171 x 132 píxeles

       Formato:

       image/png

       Nombre del recurso:

       http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/pdio052dpgw

       Descripción:

       1002 x 774 píxeles

       Formato:

       image/png

   13. Créditos y reconocimientos
   14. Restricciones de uso
   15. Sistema nativo
       PostgreSQL 9.3, PostGIS 2.1, pgAdmin III 1.18, R 3.1, Quantum GIS 2.2, Lenovo V470, Intel® Core™i7, 2.20GHz x 8, Ubuntu 12.04 LTS Precise Pangolin, 64 bits
   16. Documentos relacionados

       Página de enciclovida para Pimenta dioica a nivel de especie

       Enlace por idcatalogo 30006ANGIO en http://enciclovida.mx/especies/

       Pimenta dioica (pimienta gorda). Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Vaca, 2020)

       Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

       Pimenta dioica (pimienta gorda). Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Vaca, 2020)

       Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

2. Calidad de la información
   1. Precisión de los atributos no espaciales
   2. Consistencia lógica
      Gabinete
   3. Cobertura del tema
      Se integró una base de datos con información proveniente de Global Biodiversity Information Facility (GBIF) (http://www.gbif.org/) y del Sistema Nacional de Información de Biodiversidad (SNIB) (http://www.snib.mx/). Se realizó el control de calidad de los datos utilizando el análisis de outliers con la distancia de Mahalanobis. Para definir la región a modelar (M) se utilizaron los registros de presencia de la especie, las Ecorregiones Terrestres de México (INEGI-CONABIO-INE, 2008), Provincias biogeográficas de México (CONABIO, 1997) y la Cobertura de vegetación potencial (Ramankutty and Foley, 1999). Para generar el modelo se utilizaron 3 variables climáticas de Worldclim, la variable Elevación del CIAT (Jarvis et al.,2008) y la variable balance hídrico del suelo basado en el Modelo de cubeta (Vaca y Golicher, 2016). Las variables climáticas se cortaron desde la mitad de Norteamérica (35° de latitud norte) hasta la mitad de Sudamérica (5° de latitud sur). Se generaron dos modelos por especie, uno utilizando GAM (Modelos Aditivos Generalizados) y otro utilizando rpart (árboles de regresión). Se seleccionó el modelo que tuvo mejor rendimiento de acuerdo con los resultados del AUC de las curvas ROC. Para validar el modelo se usaron registros independientes obtenidos de la Red Internacional de Inventarios Forestales BIOTREE- NET (http://www.biotreenet.com/espanol/html/). Finalmente, el modelo continuo se convirtió a binario utilizando el umbral de corte 0.2230383.
   4. Precisión de los atributos espaciales
   5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Ramankutty, N., J. A. Foley, (1999), 'Estimating historical changes in land cover: North American croplands from 1850 to 1992.', Global Ecology and Biogeography, Volumen 8, Issue 5, páginas 381-396. Doi:10.1046/j.1365-2699.1999.00141.x, https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1046/j.1365-2699.1999.00141.x

      • Jarvis, A., H.I. Reuter, A. Nelson, E. Guevara, (2008), 'Hole-filled seamless SRTM data V4', International Centre for Tropical Agriculture, SRTM 90m DEM Digital Elevation Database, http://srtm.csi.cgiar.org

      • Hijmans, R. J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http://www.worldclim.org/

      • INEGI, CONABIO e INE, (2008), 'Ecorregiones Terrestres de México', Escala 1:1000000. Instituto Nacional de Estadística Geografía e Informática, Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad e Instituto Nacional de Ecología., México.http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/region/biotic/ecort08gw.

      • CONABIO, (1997), 'Provincias biogeográficas de México.', Escala 1:4000000. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad., México, D. F.http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/region/biotic/rbiog4mgw.

      • Vaca, R. A., (2020), ' REDDEAM: Riesgo de extinción determinado por distribución de árboles mexicanos', versión: 1, El Colegio de la Frontera Sur-Unidad San Cristóbal, Ciudad de México, México. Bases de datos SNIB-CONABIO, Proyecto No. JM052, http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=52

      • Centro Andaluz de Medioambiente-Universidad de Granada - Junta de Andalucía, (2012), 'BIOTREE-NET: Red Internacional de inventarios para la Conservación de la Biodiversidad en el sur de México y Centroamérica.', versión: 1, Granada, España. Para información revisar el siguiente artículo: La Red Internacional de Inventarios Forestales (BIOTREE-NET) en Mesoamérica: avances, retos y perspectivas futuras. L. Cayuela, L. Gálvez-Bravo, F.S. de Albuquerque, D.J. Golicher, M. González-Espinosa, N. Ramírez-Marcial, J.M. Rey Benayas, R.A. Zahawi, J.A. Meave, B.M. Benito, C. Garibaldi, I. Chan, R. Pérez Pérez, R. Field, P. Balvanera, M.A. Castillo, B.L. Figueroa-Rangel, D.M. Griffith, G.A. Islebe, D.L. Kelly, M. Olvera-Vargas, S.A. Schnitzer, E. Velazquez, G. Williams-Linera, S.W. Brewer, A. Camacho-Cruz, I. Coronado, B. de Jong, R. del Castillo, I. Granzowde la Cerda, J. Fernández, W. Fonseca, L. Galindo-Jaimes, T.W. Gillespie, B. González-Rivas, J.E. Gordon, J. Hurtado, J. Linares, S.G. Letcher, S.A. Mangan, V.E. Méndez, V. Meza, S. Ochoa-Gaona, C.J. Peterson, V. RuizGutierrez, K.A. Snarr, F. Tun Dzul, M. Valdez-Hernández, K.M. Viergever, D.A. White, J.N. Williams, F.J. Bonet, R. Zamora. 2012. Ecosistemas 21 (1-2): 126-135. Enero-Agosto 2012. http://www.uvm.edu/~agroecol/CayuelaLEtAl_LaRedInternacionalInvForestalesMesoamerica_12.pdf, http://www.biotreenet.com/espanol/html/main_proyecto.html

      • Vaca, R. A., J. D. Golicher, (2016), 'Integración del balance hídrico en la modelación de la distribución de especies de árboles mexicanos.', Botanical Sciences, Volumen 94 (1): 25-42 DOI: 10.17129/botsci.241, https://www.botanicalsciences.com.mx/index.php/botanicalSciences/article/view/241

      Procedimientos:

      • No aplica: 1. Se integró una base de datos con información proveniente de dos bases de datos, (1) Global Biodiversity Information Facility (GBIF) (http://www.gbif.org/) y (2) el Sistema Nacional de Información de Biodiversidad (SNIB) (http://www.snib.mx/). 2. Se realizó el control de calidad de los datos utilizando el análisis de outliers con la distancia de Mahalanobis, lo que permitió eliminar datos dudosos. Como resultado del proceso se obtuvieron 321 registros que se utilizaron para generar los modelos. 3. Para definir la región a modelar (M), se utilizaron los registros de presencia de la especie y las Ecorregiones Terrestres de México (INEGI-CONABIO-INE, 2008), Provincias biogeográficas de México (CONABIO, 1997) y la Cobertura de vegetación potencial (Ramankutty and Foley, 1999). La 'M' quedó conformada por aquellas ecorregiones o provincias donde al menos ocurriera un registro de la especie. 4. Para generar el modelo se utilizaron 3 variables climáticas de Worldclim: BIO12 = Annual Precipitation, BIO1 = Annual Mean Temperature y BIO7 = Temperature Annual Range de (https://www.worldclim.org/bioclim); la variable Elevación del CIAT (Jarvis et al.,2008) y la variable de Balance hídrico del suelo basado en el Modelo de cubeta (Vaca y Golicher, 2016). 5. Las variables climáticas se cortaron desde la mitad de Norteamérica (35° de latitud norte) hasta la mitad de Sudamérica (5° de latitud sur). 6. Se generaron dos modelos por especie, uno utilizando GAM (Modelos Aditivos Generalizados) y otro utilizando rpart (árboles de regresión). Se seleccionó el modelo que tuvo mejor rendimiento de acuerdo con los resultados del AUC de las curvas ROC (0.921043). 7. Para validar el modelo se usaron registros independientes obtenidos de la Red Internacional de Inventarios Forestales BIOTREE- NET (http://www.biotreenet.com/espanol/html/). 8. Para convertir el modelo continuo en un mapa de presencia se utilizó el siguiente umbral de corte 0.2230383.

   6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
3. Atributos espaciales
   1. Representacion espacial
   2. Método de representacion espacial
      Vector
   3. Información de vectores y puntos

      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):

      Tipo de objetos punto y vectores:

      G-polygon

      Número de puntos o vectores:

      145

   4. Información de imágenes
4. Sistema de referencia
   1. Sistema de coordenadas (horizontal)

      Geográficas:

      Resolución de la latitud:

      0.0174532925199433

      Resolución de la longitud:

      0.0174532925199433

      Unidades de las coordenadas Geográficas:

      Decimal degrees

      Modelo geodésico:

      Datum horizontal:

      WGS84

      Elipsoide:

      WGS84

      Semieje mayor:

      6378137.000000

      Denominador del factor de achatamiento:

      298.257224

   2. Sistema de coordenadas (vertical)
5. Atributos no espaciales
   1. Descripción detallada

      Nombre: PDIO052DPGW.DBF

      Definición: Describe los campos contenidos en el mapa.

      Fuente: No conocido

      Atributo	Descripción	Fuente [1]	Dominio [2]	Precisión [3]
      GRIDCODE	Numérico	Datos de proyecto	Los valores de 1 corresponden a la presencia de la especie.	-

   2. Descripción resumida
6. Distribución de la información
   1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      
      

      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

   2. Nombre de referencia
      pdio052dpgw
   3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
   4. Medios de distribución

      Digitales:

      • ESRI Shapefile (SHP), 1.00 MB

        http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/pdio052dpgw.zip

      • Google Earth (KML)

        http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/pdio052dpgw.kmz

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

   5. Medios de distribución especiales
   6. Requisitos técnicos
      Tener sistemas compatibles con archivos Shapefile, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
   7. Disponibilidad
7. Acerca de este documento
   1. Fecha de creación o última actualización
      05-11-2020
   2. Fecha de última revisión
   3. Fecha de la siguiente revisión
   4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos

      
      

      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

   5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
   6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
   7. Uso horario
   8. Condiciones de acceso
   9. Condiciones de uso
   10. Restricciones de seguridad o privacidad
   11. Extensiones

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx