Trichocentrum oerstedii Distribución potencial (Damon y Bertolini, 2015)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Damon, A., V. Bertolini, (2015)

Palabras clave: 2015, Distribución potencial, JM061, MaxEnt, Orchidaceae, Trichocentrum oerstedii

Fecha de publicación: 25-02-2015, del metadato 25-02-2015

Descargas: Google Earth (KML), ESRI Shapefile (SHP), Metadatos

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Damon, A., V. Bertolini, (2015). 'Trichocentrum oerstedii. Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. El Colegio de la Frontera Sur, Unidad Tapachula. Proyecto: JM061, Modelación de la distribución geográfica de las orquídeas del Soconusco. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Tapachula, Chiapas, México.
      Fecha de publicación:
      25-02-2015
      Nombre del producto:
      Trichocentrum oerstedii Distribución potencial (Damon y Bertolini, 2015)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/metadatos/doc/html/toe061dpgw.html
    2. Descripción
      Resumen:
      El modelo estima la distribución del nicho ambiental de la especie Trichocentrum oerstedii, generado a través de 'Minimum training presence' de Maxent. Por lo tanto tiene información binaria de presencia/ausencia del nicho ambiental, abarcando desde el centro de México hasta el norte de Colombia.
      Propósito:
      Estimar la distribución potencial de Trichocentrum oerstedii
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=JM&Numero=061
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1959-2012
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extención geográfica:
      República Mexicana y Centroamérica
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -97.163459777832, (Este) -85.2217788696289, (Norte) 21.5411510467529, (Sur) 12.7161493301392
    6. Palabras clave
      Tema:
      2015, Distribución potencial, JM061, MaxEnt, Orchidaceae, Trichocentrum oerstedii
      Lugar:
      Belize, Campeche, Chiapas, El Salvador, Honduras, Nicaragua, Oaxaca, Puebla, Quintana Roo, República de Guatemala, República Mexicana, Tabasco, Veracruz de Ignacio de la Llave, Yucatán
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Liliopsida, Orchidales, Orchidaceae, Trichocentrum, Trichocentrum oerstedii
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.'

        19810000. Cronquist, A., (1981), 'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.', Columbia University Press., New York, Estados Unidos.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Plantae: Magnoliophyta: Liliopsida: Orchidales: Orchidaceae: Trichocentrum:

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/toe061dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/toe061dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3k, ArcView 3.2, ArchMap 10, Divas-Gis, Dell Vostro 470, Intel® Core i7-3770 CPU @, 3.4GHz, RAM 6.0 GB, Windows 7
    16. Documentos relacionados

      Página de enciclovida para Trichocentrum oerstedii a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 26348ANGIO en http://enciclovida.mx/especies/

      Trichocentrum oerstedii Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Damon y Bertolini, 2015)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Trichocentrum oerstedii Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Damon y Bertolini, 2015)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      1) Se integró una base de datos a partir de datos de distintas fuentes de información, datos propios, datos obtenidos vía electrónica, datos proporcionados por el SNIB, y datos recopilados de distintos herbarios de Centroamérica y Colombia. 2) Los datos se revisaron exhaustivamente en términos de su distribución geográfica y nomenclatura. 3) Se definió una región de referencia M basada en las 'Ecorregiones Terrestres Mundiales' (http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world), y quedó conformada por las eco-regiones con presencia de registros de esta especie; 4) Se generaron los datos geográficos de las ocho capas bioclimáticas seleccionadas de WorldClim (Hijmans et al. 2005). 5) Se modeló la distribución geográfica utilizando MaxEnt 3.3.3k. (Phillips et al. 2006); 6) La calidad de los modelos se evaluó considerando la estimación del área bajo la curva (AUC) ROC, aplicado a 'test data' y 'training data'; 7) El modelo obtenido se transformó en un mapa booleano (presencia/ausencia) a partir del 'Minimum training presence'.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Olson, D. M., E. Dinerstein, E. D. Wikramanayake, N. D. Burgess, G. V. N. Powell, E. C. Underwood, J. A. D'Amico, I. Itoua, H. E. Strand, C. J. Loucks, J. C. Morrison, T. F. Allnutt, T. H. Ricketts, Y. Kura, J. F. Lamoreux, W. W. Wettengel, P. Hedao, K. R. Kassem, (2001), 'Terrestrial Ecoregions of the World (TEOW)', versión: 2.0, World Wildlife Fund, Washington, D. C. La información sobre los métodos usados para generar las capas de Ecorregiones Terrestres del Mundo se pueden consultar en: Olson, D. M., Dinerstein, E., Wikramanayake, E. D., Burgess, N. D., Powell, G. V. N., Underwood, E. C., D'Amico, J. A., Itoua, I., Strand, H. E., Morrison, J. C., Loucks, C. J., Allnutt, T. F., Ricketts, T. H., Kura, Y., Lamoreux, J. F., Wettengel, W. W., Hedao, P., Kassem, K. R. 2001. Terrestrial ecoregions of the world: a new map of life on Earth. Bioscience 51(11):933-938., http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world

      • Damon, A, V. Bertolini, (2015), 'Modelación de la distribución geográfica de las Orchidaceae del Soconusco', versión: 1, Unidad Tapachula, El Colegio de la Frontera Sur, Tapachula, Chiapas, México. Bases de datos SNIB-CONABIO proyecto No. JM061,

      • Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http://www.worldclim.org/

      Procedimientos:

      • No aplica: 1) Se integró una base de datos a partir de información del grupo de investigación 'Ecología y cultivo sustentable de las orquídeas del Soconusco'(Departamento de Conservación de la Biodiversidad de ECOSUR), de datos proporcionados por el Sistema Nacional de Información de Biodiversidad (SNIB - CONABIO), datos obtenidos vía electrónica del Herbario Nacional de México (MEXU), Missouri Botanical Garden (MOBOT) y el Colegio de la Frontera Sur, unidad Tapachula (ECOSUR-T) y de datos recopilados de distintos herbarios de Centroamérica y Colombia; 2) Los datos se revisaron exhaustivamente y se identificaron registros mal ubicados, geográficamente incongruentes, o cuyos coordenadas no coincidieron con la descripción del sitio; 3) Se definió una región de referencia M basada en las 'Ecoregiones Terrestres Mundiales' (http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world), que quedó conformada por las siguientes eco-regiones (OBJECTID): 234, 611, 752, 940, 950, 1008, 1058. 4) Se generaron los datos geográficos de las ocho capas bioclimáticas seleccionadas a partir de las capas climáticas de WorldClim (Hijmans et al. 2005) con el molde M: Annual Mean Temperature, Temperature Seasonality (standard deviation *100), Max Temperature of Warmest Month, Min Temperature of Coldest Month, Annual Precipitation, Precipitation of Wettest Month. Precipitation of Driest Month, Precipitation Seasonality (Coefficient of Variation); 5) Se incorporaron los datos geográficos de distribución de la especie y las variables climáticas al programa MaxEnt 3.3.3k (Phillips et al. 2006). En la ventana de abertura del software Maxent, se seleccionaron las opciones pre-establecidas, además de activar la función de 'create reponse curves' y de 'Do jacknife to measure variable importance'. Abriendo la ventana de Setting/Basic, se activó la función 'Random seed' y se asignó el valor de 25% a la función de 'Random test percentage'. En la ventana de Setting/Advanced, se activó el 'Minimum training presence' de 'Apply threshold rule'. Se utilizó el 25 % de los datos para entrenamiento del modelo (total de registros: 20) y el restante 75 % para validación; 6) La calidad de los modelos se evaluó considerando la estimación del área bajo la curva (AUC) ROC, aplicado a 'test data' y 'training data' que resultó de 0.669 y 0.847, respectivamente.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      1387
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: TOE061DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      Value Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      toe061dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      25-02-2015
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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